IPA：一个帮你挖掘生物学意义的数据库

生物信息学软件：IPA

IPA（Ingenuity Pathway Analysis，通路分析软件）是一款基于云计算的图形化界面生物信息学软件，能够从生物学通路角度将组学数据进行分析、整合和理解，帮助挖掘实验数据中隐藏的生物学意义，揭秘实验数据的价值。

1适用领域

IPA适用于转录组学、蛋白质组学、代谢组学等大数据分析，也适用于一些产生基因、化学物质列表的小规模实验。

2IPA分析基础-IPKB

IPKB（Ingenuity knowledge Base）是IPA最核心的部分，是一个专业的生物学相互作用和功能注释的数据库，收集了上百万的关于蛋白质，基因，化合物，细胞，组织，药物和疾病之间最直接的相互作用关系信息。

3IPA功能

搜索功能

以“EPOR”搜索为例，可以挖掘：

EPOR有什么功能？

与哪些疾病相关？

与哪些药物相关？

参与哪些经典通路？

EPOR的调控子是什么？

EPOR调控哪些基因表达？

EPOR表达上调或下调，对下游作用分子的影响是什么？是否影响与它相关的疾病或功能？

探索EPO与EPOR之间可能的作用路径

分析功能

高级分析功能

4我校IPA使用

上海交通大学IPA数据库并发用户为1，同时只能一人在线。因此采用“预约申请”方式，需提前向学院联系人预约。详细信息见【阅读原文】。

文字 │ 陈巧梅

美编 │ 仲汇慧

来源 │ 生命医药学科服务

上海交通大学图书馆

生命医药学科服务