论文“短平快”三部曲第二弹之叶绿体基因组分析技巧

叶绿体基因组研究越来越火热。看起来是采一片叶子，测个序组个圈就完了，然而不会分析，文章不会写是个大bug；另外，找个公司来组装吧，又怕找不好，生活呀！

不要怕，

！！！下面小编就叶绿体发表文章，做了些文章整理和写文思路小结，希望对各位看官有所帮助。

栾树叶绿体全基因组分析

栾树叶绿体基因组图谱 叶绿体基因组系统进化

该文分析比较简单，只进行了组装和系统进化分析。同样也是组装了一个叶绿体基因组，分析内容直接决定发文层次，看下篇：

麻栎叶绿体全基因组分析

话不多说，除了上面文章所做的两个工作，该文作者还就以下两方面进行了分析：

6个物种完整的叶绿体基因组比较6个叶绿体基因组IR边界

第二篇是集思慧远客户发表的，同样是做了一个物种的叶绿体，麻栎这篇文章相对较为充分的利用了已发表叶绿体基因组数据，对不同物种叶绿体从基因结构方面进行深入分析，文章差距显而易见。

当然数据挖掘越透彻，分析内容越全面，发文档次则更高，比如下面这篇：

对物种的研究，深入到进化通常格调就会高大上，从叶绿体基因组层面进行进化研究也不例外。喏，一区的叶绿体进化篇：

该文针对代表全部蔷薇亚科的87个蔷薇属和蔷薇目其他8个科共计130个个体的质体基因组进行测序，结合12个从GenBank下载的质体基因组序列，尝试重建了蔷薇科物种间暂时的多样性及更深入的亲缘关系。

系统发育研究结果蔷薇科分化历史

另外小编需要强调一下，NCBI已公开数据也并不是完全准确。上面推荐的这篇作者就是发现在NCBI已公开的该物种叶绿体组装错误，又重新组装并进行了分析。因此，这里小编需要向各位科研工作者强烈推荐一下集思慧远，公司信息部大佬试用了市面上反响较好的组装软件，亲自上阵研发了新软件，组装效果有非常大的提升，对比别的软件来看，大佬新写的流程可以把组装的准确型性从90％提升到99％，市面上绝无二家！！！

简单来说，就是大佬开发的这款软件可以无参、准确度高、分析全面。小编想低调的，无奈太优秀。