小P君注意到,近日顶尖学术期刊《自然》刊发了一项关于癌症诊断的重要研究。来自加州大学圣地亚哥分校(UCSD)的科学家,通过训练人工智能,可以从血液中鉴定来自微生物的线索,这样不仅可以识别出癌症,还能对不同类型的癌症做出区分。对此,有研究机构评价称,这项新的诊断工具,“可能会改变人们观察和诊断癌症的方式”。
相信大家一定知道,我们以往筛查癌症的方式,主要是通过手术活检,从可疑的肿瘤部位取出样本,然后由富有经验的专家寻找某些与癌症相关的分子标记物。但是这样的方法耗时、昂贵,还会给患者增加创口,带来不必要的痛苦。
正因为如此,很多科学家正在努力开发液体活检技术,希望通过简单的验血,快速识别出特定的疾病。其中UCSD的学者提出:“以前的癌症研究工作大多假设肿瘤是在无菌环境,而忽略了人的癌细胞与细菌、病毒以及其他生活在人体的微生物可能有复杂的相互作用。”
于是他们有了一个全新而大胆的假设:利用AI分析血液中来自微生物的遗传物质,可以根据其“排列“来识别体内的肿瘤。
▲血液中既有我们自身的基因信息,也有“外来者”的基因信息
对于人体来说,我们身体里的微生物数量远超我们自己的细胞数量,而且它们的核酸片段(DNA或RNA)经血液循环游荡在我们全身。为了进行检测,研究团队首先取得了人类已有的人类肿瘤样本,来确认癌症相关的微生物核酸特征。
他们从美国国家癌症所“癌症基因组图集”数据库(TCGA)获得了大约1.8万份样本。这些样本涵盖了33种癌症、1万多个病例,包括原发性和复发性肿瘤,以及转移扩散的肿瘤,既有肿瘤组织也有相邻组织和血液样本。
从几千份样本中找到独特的微生物特征后,研究人员把工作交给了人工智能,训练机器学习模型来挖掘大量数据,把特定的微生物序列特征与特定的癌症相匹配。
▲将癌症的核酸片段与库中做对比
为了检测这套AI模型的实际操作效果。研究人员计划用它来检测100名合作患者提供的样本,包括前列腺癌、肺癌和黑色素瘤等,让AI对每份血浆中的微生物核酸特征进行鉴定,并与69名健康无癌个体的血样进行比较。
▲抽一管血,检测是否患癌以及什么癌症
测试结果和预计的一样!通过机器学习的模型,不仅可以区分患癌和无癌的样本,还相当擅长区分不同类型的癌症:以86%的敏感性识别出肺癌患者,对于无肺部疾病的个体没有出现假阳性报告,并且以81%的准确率区分出前列腺癌和肺癌。
这就意味着,“只要一管血,就能够全面了解肿瘤细胞的DNA和患者微生物群的DNA”这项研究的负责人说。
虽然这只是一个实验,但是小P君相信,在不远的未来,借助AI的高效计算,医疗领域一定会有极大突破和改变,这对目前已知的癌症诊断和治疗将有深刻影响。
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