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单细胞分析的10个基础问题
伴随着单细胞技术的流行，我们也做了很多福利项目，帮助大家对海量的公共数据集继续普通的标准分析，这样大家可以拿我们的分析结果进行后续个性化深入分析和解读： 这个过程中，我安排工程师们整理了初次接触单细胞的小伙伴拿到了 我们的数据分析标准结果后通常的疑惑点，大家可以看看是否有同感。 percent_hb(红细胞基因表达比例)：表明红细胞这个单细胞亚群的比例，一般来说不研究红细胞，所以过滤它没有问题。 因为我们质控的目的是去掉不是细胞的东西，不能排除某种状态的细胞，在下游分析中，会成为我们苦苦寻找的那一个。 在单细胞数据科学中数据质控的原则是：质控时贪婪，验证时谨慎，最大限保留数据信息。 但是绝大部分的marker gene都是选取的在特定的单细胞亚群高表达基因，而且本身很多基因就是因为在某个数据集的某个单细胞亚群特异性高表达，才成为了下次分析的这个亚群的marker gene 。
4.4K32编辑于 2022-07-26 - 来自专栏ThoughtWorks
业务分析实践：10个常见问题 | TW洞见
在敏捷社区里，下面这10个关于业务分析的问题会经常被人问及。我也一直在思考这些问题，结合过去8年来的敏捷项目上的经验，试着做个简单的解答，希望能给大家以启发。 1. 做法是： 做计划的时候，要对照着故事墙（或“业务全景图”），来列出迭代要完成的功能目标，强调为什么要完成这些目标，否则对整个交付计划的影响，在最后的10%的垃圾时间，顺带提下计划的点数是多少，想争论点数 每一个项目，我会去建立一个共享页面，列出所有的假设、风险、问题和依赖；提前1-2个迭代去分析这个列表： 假设：有哪些假设现在就能确认是对的？有哪些假设是错的？ BA(Business Analyst，也即业务分析师，是敏捷团队中的必要角色，下同）经常需要跟踪依赖和一些待处理的问题，这些需不需要可视化在故事墙/看板上？ 要。 10. 我好像绝大多数时间都在写卡，都没时间去想产品和业务，更别说去写总结和分享了。作为BA，该怎么分配自己的时间和精力？
87990发布于 2018-04-20 - 来自专栏生信宝典
单细胞分析Seurat使用相关的10个问题答疑精选！
但里面有蛮多的代码的原理其实我并不太清楚 (读完这个，还不懂，来找我，重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 （原理、代码和评述）)，这次我就介绍一下里面让我曾经困惑的几个问题以及比较 有关merge函数的问题 ? merge只是放在一起，fastMNN才是真正的整合分析。 2. 有关PC的选择 ? 实际分析时，可以尝试选择不同的值如10, 15或所有主成分，结果通常差别不大。但如果选择的主成分比较少如5等，结果可能会有一些变化。 另外要注意：用了这么多年的PCA可视化竟然是错的！！！ 3. (如何使用Bioconductor进行单细胞分析？) 还在用PCA降维？快学学大牛最爱的t-SNE算法吧, 附Python/R代码 10. Seurat与线粒体基因 ? 这是一个简单的操作问题，读懂代码就好解决了。
2.6K22发布于 2020-02-26 - 来自专栏Java架构师必看
spring源码分析10
spring源码分析10 强烈推介IDEA2020.2破解激活，IntelliJ
31330发布于 2021-04-13 - 来自专栏学习笔记ol
框架分析（10）-SQLAlchemy
框架分析（10）-SQLAlchemy 主要对目前市面上常见的框架进行分析和总结，希望有兴趣的小伙伴们可以看一下，会持续更新的。希望各位可以监督我，我们一起学习进步。 特性分析 ORM支持 SQLAlchemy提供了一种将数据库表映射到Python类的方式，使得开发者可以使用面向对象的方法来操作数据库。通过定义模型类和属性，可以轻松地进行数据库的增删改查操作。
59420编辑于 2023-10-11 - 来自专栏数据科学（冷冻工厂）
ATAC-seq分析：差异分析（10）
在这里，我们将采用类似于 Diffbind 中的方法，并在 ATACseq 分析中合理建立。1. 图片library(TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene)toOverLap <- promoters(TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene 由于我们有 TSS +/- 500bp 范围内的区域子集，此时我们可以使用标准富集分析。这里我们使用clusterProfiler来识别富集。 anno_KidneyMinusHindbrain <- annotatePeak(KidneyMinusHindbrain, TxDb = TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene DB_ATAC <- as.data.frame(anno_KidneyMinusHindbrain)DB_ATAC[1, ]图片由于我们有 TSS +/- 500bp 范围内的区域子集，此时我们可以使用标准富集分析
94320编辑于 2023-01-27 - 来自专栏数据科学（冷冻工厂）
ATAC-seq分析：差异分析（10）
在这里，我们将采用类似于 Diffbind 中的方法，并在 ATACseq 分析中合理建立。 1. library(TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene) toOverLap <- promoters(TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene 由于我们有 TSS +/- 500bp 范围内的区域子集，此时我们可以使用标准富集分析。这里我们使用clusterProfiler来识别富集。 anno_KidneyMinusHindbrain <- annotatePeak(KidneyMinusHindbrain, TxDb = TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene as.data.frame(anno_KidneyMinusHindbrain) DB_ATAC[1, ] DB_ATAC 由于我们有 TSS +/- 500bp 范围内的区域子集，此时我们可以使用标准富集分析
51320编辑于 2023-02-27 - 来自专栏Golang语言社区
抽奖问题分析
普通抽奖问题问题描述 用户随机抽奖,数据如下: // map中，key代表用户名，value代表成用户下单数 var users map[string]int64 = map[string]int64 { "a": 10, "b": 6, "c": 3, "d": 12, "f": 1, } 思路 随机问题,一般就是通过随机函数从某个范围内随机取出某个数值,则该数值对应的就是中奖用户 Test_GetAwardUserName(t *testing.T) { var users map[string]int64 = map[string]int64{ "a": 10 Test_getAwardUser_weight(t *testing.T) { var users map[string]int64 = map[string]int64{ "a": 10 ,往往都有数学模型去对应,比如抽奖问题,就可以转化为初中所学习的数轴知识,画个草图,简单易理解,也不需要多高深的数学知识 问题本身并不难,重要的是转换思路,将抽象问题简化为具体的数学问题,然后去解决
2.4K30发布于 2018-03-27 - 来自专栏程序员奇点
ping 问题分析
ping 问题分析 ping 是什么 ping 是常用的网络管理命令，ping也属于一个通信协议，是TCP/IP协议的一部分，适用于windows和linux以及unix。 Ping不通ARP问题故障分析 通过前面的Ping不通故障定位思路可以判断出是否是由于ARP问题引起Ping不通。 Ping不通VLAN问题故障分析 通过前面的Ping不通故障定位思路可以判断出是否是由于VLAN问题引起Ping不通。 Ping不通路由问题故障分析 通过前面的Ping不通故障定位思路可以判断出是否是由于路由问题引起Ping不通。 常见访问控制判断方法如下： 在接口下进行抓包，分析获取报文的信息，然后查看相应的配置。
2.6K41编辑于 2022-03-26 - 来自专栏全栈程序员必看
乱码问题分析
一、字符编码问题举例 1、支付宝代扣签约失败问题。 问题描述：用户在浏览器中输入中文请求，表单post给后台为中文乱码，导致通用代扣签约失败。 b）对于n字节的符号（n>1），第一个字节的前n位都设为1，第n+1位设为0，后面字节的前两位一律设为10。剩下的没有提及的二进制位，全部为这个符号的unicode码。 六、常见问题分析 下面看一下，当我们碰到一些乱码时，应该怎么分析这些问题？ 出现乱码问题的原因都是在转换中编码和解码的字符集不一致导致的，由于往往一次操作涉及到多次编解码，所以出现乱码时很难查找到底是哪个环节出现了问题，下面就几种常见的现象进行分析。 第一二个字节、第三四个字节的起始部分的都是”110″和”10″，正好与UTF8规则里的两字节模板是一致的，于是再次打开记事本时，记事本就误认为这是一个UTF8编码的文件，让我们把第一个字节的110和第二个字节的
1.8K30编辑于 2022-09-01 - 来自专栏移动开发的那些事儿
TCP问题分析
TCP问题分析 网络的五层协议 物理层 数据链路层 网络层，IP协议，ICMP协议（ping） 传输层，传输层有两个协议，面向连接的TCP和无连接的UDP，TCP是点对点的可靠连接，保证数据顺序必达 tcp10.jpg 这个是未用Nagle算法的抓包信息 滑动窗口 ? 则取自新的测量 RTO（Retransmission TimeOut），这个是重传超时时间，也就是下重传消息需要等待Ack的时间，超过这个时间就再次发起下一次重传 TCP抓包分析 wireshark工具来查看 tcpdump chmod 777 /system/bin/tcpdump 到此为止，tcpdump就成功安装到了/system/bin/目录下，接着用如下命令还是抓包 Java中的Socket异常分析 连接，A端的socket的read的时候返回-1，那这条socket就不再有可读取的数据，造成这个-1的原因是B端的TCP发起了一个FIN，可能是调用了socket的close方法 tcpdump抓包分析
1.4K30发布于 2018-09-04 - 来自专栏全栈程序员必看
NE问题分析
/9367352/ libsurfaceflinger.so: http://gerrit.scm.adc.com:8080/#/c/9367154/4/libc/Android.bp HWSan分析方法 fatal,sf,system server等系统关键进程的NE都是fatal的,所以只需要关注fatal的就行了,可以打开db_history搜索进程关键字来找到对应的db文件 db文件一般提供给MTK分析 ,他们通过监控系统SWT重启,发现是因为sf造成的卡死,题中的log只有他们的SWT回传,没有nwatchcall回传,所以需要联系测试去eap系统下载才行 2.分析问题 sf卡死一般分为以下几种 log,看堆栈是否挂在gpu库里 3).系统运行缓慢,io,cpu,loading过重导致sf运行缓慢,这种情况sf连续两个时间点的堆栈不一样,这时候要看log上有没有lmk或者lowmem字样,分析是否是系统问题 4.如果上面确定是sf卡死造成的,则 adb pull /data/persist_log/DCS/de/psw_multimedia_perf 把nwatchcall抓到的现场堆栈和log导出来继续分析
96410编辑于 2022-07-25 - 来自专栏程序员奇点
ping 问题分析
ping 问题分析 ping 是什么 ping 是常用的网络管理命令，ping也属于一个通信协议，是TCP/IP协议的一部分，适用于windows和linux以及unix。 Ping不通ARP问题故障分析 通过前面的Ping不通故障定位思路可以判断出是否是由于ARP问题引起Ping不通。 Ping不通VLAN问题故障分析 通过前面的Ping不通故障定位思路可以判断出是否是由于VLAN问题引起Ping不通。 Ping不通路由问题故障分析 通过前面的Ping不通故障定位思路可以判断出是否是由于路由问题引起Ping不通。 常见访问控制判断方法如下：在接口下进行抓包，分析获取报文的信息，然后查看相应的配置。
3.5K10编辑于 2022-04-26 - 来自专栏golang算法架构leetcode技术php
golang源码分析（10）slice
// maxSliceCap returns the maximum capacity for a slice.
26420编辑于 2022-08-02 - 来自专栏JAVA乐园
GC问题和OOM问题分析
小编最近遇到GC不断增长的问题。 推荐一款分析GC日志的工具 0x01：GC问题 GCViewer是一款分析GC日志的开源工具，非常容易使用，官网如下： https://github.com/chewiebug/GCViewer 下图列出了支持的 具体一些图标上的线条，及说明也非常简单；如果熟悉JVM的GC原理就非常容易看出这些线条到底有没有问题。最简单的一条，只要看到堆的占比只增不减，大概率是有内存泄露问题。 0x02：OOM问题 JVM故障分析及性能优化系列之一：使用jstack定位线程堆栈信息 JVM故障分析及性能优化系列之二：jstack生成的Thread Dump日志结构解析 JVM故障分析及性能优化系列之三 对应OOM问题以上这个网友写的这几篇文章非常不错，可以参考。
1.5K10发布于 2020-06-15 - 来自专栏IT码农
PHP 性能分析10则
单引号，还是双引号，是一个问题。一般的建议是能使用单引号的地方，就不要使用双引号，因为字符串中的单引号，不会引起解析，从而效率更高。那来看一下实际的差别。 那么问题来了，事先声明属性与事后增加属性，是否会有性能上的差别。这里也举一个例子探讨一下。 事先声明了属性的代码就是2.8节中，无 setter 的代码，不再重复。 可以推断出来的就是对于对象的属性，如果事先知道的话，我们还是事先声明的好，这一方面是效率问题，另一方面，也有助于提高代码的可读性呢。 于是为了做好性能分析，我们需要向 PHP 的上下游戏延伸，比如延伸到后端的服务上去，比如延伸到前端的优化规则。 在这两块，都有了相当多的积累和分析，雅虎也据此提出了多达35条前端优化规则，这些同 PHP 本身的性能分析构成了一个整体，就是降低用户的访问延时。
91541编辑于 2022-01-10 - 来自专栏golang算法架构leetcode技术php
golang源码分析：etcd(10)
分析完raft算法，回来看etcd server的代码就比较清晰了，我们从入口文件server/main.go开始 func main() { etcdmain.Main(os.Args
31620编辑于 2023-09-09 - 来自专栏波波烤鸭
【10】Spring源码-分析篇-AOP源码分析
Spring源码-AOP分析 一、手写AOP回顾 本文我们开始讲解Spring中的AOP原理和源码，我们前面手写了AOP的实现，了解和自己实现AOP应该要具备的内容，我们先回顾下，这对我们理解Spring 代理类的结构 在上面的分析中出现了很多代理相关的代码，为了更好的理解，我们来梳理下Spring中的代理相关的结构 2.1 AopProxy 在Spring中创建代理对象都是通过AopProxy这个接口的两个具体实现类来实现的 @Aspect解析 然后我们分析下@Aspect注解的解析过程 @Override protected boolean shouldSkip(Class<?
98350编辑于 2022-10-28 - 来自专栏Panda诚
常见乱码问题分析
了，就我们中国人来说，汉字乱码是最常见的问题了。 说到这里，我们就以一个开发的角度，分析一下常见的乱码原因。 常见乱码问题分析： 从编程角度来看，出现乱码的场景主要是有文本处理的时候，比如文件的新建和读取、复制和粘贴，导入和导出，打开和保存，数据存储和检索，显示，打印，分词处理，字符转换，规范化 读数据比如将文件中的内容显示出来，即字节-->字符的转换，也就是解码；写数据比如创建一个新文件，即字符-->字节转换，也就是编码；在分析 I/O 操作中出现乱码原因之前，先简要概述一下 Java I/O 接下来的文章，会对数据库的编码乱码问题进一步进行研究。
1.7K10发布于 2020-09-01 - 来自专栏Java实战博客
Spring 2.5.3 问题分析
spring-boot-starter-web</artifactId> </dependency> image.png 结果：不配置spring-boot-starter-web 无法启动Tomcat 特殊说明： 解决问题的光鲜
35410编辑于 2022-01-19
腾讯云开发者
