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Open-ST: https://rajewsky-lab.github.io/openst/latest/
默认情况下,推断CNV在整个样本水平上运行,例如从单个患者中提取的某种细胞类型的所有细胞。这是推断CNV的最快方法,但往往不是最优方法,因为给定的肿瘤样本可能有...
This procedure avoids calling false positive CNV regions due to cell-type spec...
默认情况下,使用确定性模式来计算transiton matrix。如果要传播速率向量中的不确定性,查看随机模式和蒙特卡罗模式。随机模式使用KNN图估计速率向量上...
ENVI采用条件变分自编码器来推断scRNA-seq数据中的空间背景,并通过将这两种模式映射到一个共同的嵌入来推算空间数据中缺失的基因。
Drug development proceeds via a series of widely-recognised phases.Actionability...
CIViC是一个community-edited forum,用于讨论和解释与癌症variants(或生物标志物改变)临床相关性相关的同行评审出版物。这些解释可...
链接:https://pan.baidu.com/s/1fiZwVRXQP8HqiMXs3IGahw?pwd=n529 提取码:n529
StarDist 是一个基于深度学习的开源库,专注于识别和定位图像中的星形细胞或其他具有类似特征的结构。
从8µm bin大小重新聚集细胞可能会很耗时,因为spot数量通常超过300,000。
这是10X今年更新的第三次,继HD、GEM-X之后,将Xenium的技术检测基因由几百提高到了5000.
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