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- 图片说明- 研究设计。从31名患者中收集了匹配的生物样本三联体,包括正常结肠、原发性结直肠癌(CRC)和转移灶,新鲜处理用于单细胞转录组学和类器官生成,并用...
◉ 蛋白质从包括单细胞、组织和体液在内的样品中提取,并使用特定的蛋白水解酶消化成肽。◉ 在多重分析时,这些肽通过化学方法用稳定同位素标记的标签进行标记。◉ 样本...
◉ 图1展示了STRING中新的‘调控网络’模式,在该模式下,网络边直观地指示了每个调控相互作用的方向、置信度和来源。点击网络中的任意一条边将弹出一个窗口,其中...
◉ 图2 差异表达基因的火山图。差异表达基因是基于标准筛选的,下调基因的对数倍变化(LogFC)<1且上调基因的对数倍变化(LogFC)>1,同时P值<0.05...
◉ 图2 比较了使用不同信号强度参数(范围从0.01到0.11)生成的测试数据集上的12种方法。(a)F分数。(b)Fsub。(c)FDR。在某些情况下,得到的...
◉ 左图,查询细胞谱系与来自412项研究的2340万份参考基础模型进行比较。◉ 中间图,识别出具有相似细胞的样本,并返回有关原始样本条件的信息,包括组织、体外或...
◉ 这是通用单细胞基因组分析的最优传输(OT)管道示意图(从左到右):实验变化(例如时间点和不同的空间切片)导致不同的细胞群体。◉ 以前的生物学知识(例如增殖率...
Fig__1__Schematic_illustration_of_our_generative_system_for_medical_image_synthe...
巨噬细胞极化(Macrophage Polarization)是指巨噬细胞在不同微环境信号刺激下,分化为不同功能表型的过程。通常,巨噬细胞可以分为两种主要的极化...
前面我们介绍了如何在我们共享服务器零帧起手单细胞分析:玩转服务器—零帧起手单细胞上下游分析
Motif 是一段典型的序列或者一个结构。一般来说,我们称之为基序。它是构成任何一种特征序列的基本结构。通俗来讲,motif 是有特征的短序列,一般认为它是拥有...
背景:肺癌在世界范围内普遍存在,是癌症相关死亡的主要原因。对肺癌免疫原性细胞死亡(ICD)的研究有限,限制了将ICD相关疗法与免疫疗法相结合的策略的开发。
说过好多次要汇总在分析单细胞数据时候用到的marker基因,因为不同组织中还是有些特异的marker基因的!
今天分享的这一篇文献,是公共数据挖掘类的文章。研究团队通过整合多个人群队列的WES或者WGS数据,如 UKB 、MCPS、100kGP 等来开展分析的。这些数据...
◉ 图1.LnCeCell 2.0的数据扩展和新特征。(A,B)LnCeCell 2.0数据库对高通量测序和人工整理数据集的收集与扩展。(C–I)LnCeCel...
◉ 图1。天然免疫沉淀提供了丰富的富集谱,保留了细胞器的连接(A)内源性标记策略。(B)阵列化细胞库。(C)天然免疫沉淀工作流程。(D)用于全面覆盖亚细胞区室的...
◉ RNA 化学多样性 RNA 易受环境和内源性损伤的影响,并且缺乏核隔离、碱基配对和染色质化所提供的三重保护。而DNA具有这三种保护。◉ 尽管 RNA 也会被...
◉ a, 多尺度足迹工作流程概述。◉ b, 比较不同Tn5偏差校正模型性能的条形图。◉ c, 在包含0 nM(顶部)或100 nM(底部)MYC/MAX的BAC...
◉ 我们开发了一个基于多模态变压器架构的视觉-语言基础模型作为网络主干。◉ 模型预训练包括两个连续阶段。◉ 首先,MUSK 在来自 11,577 名患者的近 3...
◉ 图1. 研究SLCs多功能性的挑战,多功能性是指转运蛋白能够识别和运输多种底物的能力;冗余现象,当多种转运蛋白共享重叠的底物特异性时的现象;亚细胞定位的复杂...
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