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Sentieon软件为完整的纯软件基因变异检测二级分析方案,其分析流程完全忠于BWA、GATK、MuTect2、STAR、Minimap2、Fgbio、pica...
PacBio® HiFi 测序是第一种提供经济、高精度长读数测序的技术,其平均读数长度超过 10kb,平均碱基准确率达到 99.8% 。在该研究中,研究者介绍了...
大家是否有这样的经历,使用conda/anaconda进行环境配置的是否速度非常慢,进度经常卡在“Collecting package metadata”上。甚...
毅硕教你做生信
绿孔雀(Pavo muticus)面临着长期而广泛的偷猎和栖息地转换威胁的状况,濒临灭绝的风险很高。在该研究中,研究者展示了通过 PacBio 测序、DNBSE...
癌症免疫治疗领域的最新进展已确定CD8+ T细胞对肿瘤特异性突变的反应是肿瘤消退和总生存的关键驱动因素。ADXS-NEO是一种基于李斯特菌(Lm)的个性化免疫疗...
临床精准肿瘤学越来越依赖于使用大panel下一代测序的准确全基因组分析;然而,准确和一致地检测来自单个平台和管道的体细胞突变的困难仍然是一个悬而未决的问题。为了...
由于RNA依赖性RNA聚合酶产生的错误,SARS-CoV-2的基因组在病毒复制过程中容易受到突变的影响。这些突变使SARS-CoV-2能够进化成新的毒株。病毒准...
2019年冠状病毒病(COVID-19)的爆发是全球卫生紧急情况。已经报告了 COVID-19 的各种组学结果,但 COVID-19 的分子特征,特别是在没有合...
自基因组测序出现以来,基因组选择和全基因组关联等基因组应用变得越来越普遍。测序的成本在过去二十年中有所下降;然而,基因分型成本仍然无法为这些基因组应用收集大型数...
CNV检测已成为全基因组分析的常规内容,并显著提升了阳性诊断率。然而,由于实验室水平和所使用软件的差异,目前仍难以全面、准确地覆盖CNV的检测与细节分析。尤其在...
板栗(Castanea mollissima)是一种种子坚硬的物种,是坚果和森林生态系统的重要组成。坚硬种子在自然生境中的发芽率较低,在干燥和低温条件下下降。栽...
人瘤病毒阴性(HPV-)头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)是HNSCC的一个主要亚型,与HPV阳性疾病相比,其临床结局较差,对放化疗以及针对EGFR和PD-1的治疗...
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