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之前在对最基础的高通量测序数据分析当中,提到了对于差异的富集分析[[6.富集分析二三事]]。其中富集分析需要基因注释数据库作为背景数据。常用的背景数据库就包括K...
之前我们在[[SNP是什么东西?#QTL]]当中提到过,QTL是一种用来预测SNP功能的算法。一般分析SNP影响哪个方面的功能就在前面加什么前缀。[[表观遗传学...
作为一个科研人,每个人都会有自己的研究方向。在进行自己研究的同时,也要实时追踪根据自己研究方向有关的文献。所以今天就来给大家介绍几个用来追踪自己研究方向的方法。
在临床上,我们经常会使用不同的药物来进行治疗的情况。对于每一个药物而言都有自己的作用机制。如果多个药物同时使用的话就会造成不同的不良反应。所以了解不同药物之间的...
对于以往研究的总结是帮助我们了解之前的研究情况,结果以及寻找新的研究方向不可或缺的一步。由于这种总结的必要性,所以也诞生了很多基于不同类型的文章。所以今天就基于...
科研过程当中,我们需要阅读大量的文献。关于文献的阅读,有一个苦恼的地方在于,文章的图和图片描述以及文章结果是分开的。这对于我们阅读的流畅性就造成了很大很大的障碍...
染色体外环状DNA(eccDNA)属于线性的染色体DNA的一个扩展。之前对于eccDNA的基本特征,我们基于一个综述进行了简单的介绍: [[eccDNA基本内容...
关于染色体外环状DNA (Extrachromosomal circular DNA, eccDNA) 也属于最近研究的一个新的热点。eccDNA的功能也在不断...
外泌体(Exosomes)是细胞分泌到胞外的一种纳米级内吞囊泡(40-160nm),含有丰富的内含物(包括核酸、蛋白和脂质等),可以调节受体细胞的...
在关于[[SNP是什么东西?| SNP]]的基本内容介绍中,我们了解了SNP的基本信息。同时也介绍了一个NCBI>SNP 数据库用来检测SNP的基本信息。同时关...
不同的疾病具有不同的发病机制,基于高通量测序数据的疾病相关数据库,可以综合性的了解这个疾病的发病机制。因此在研究一个疾病的时候,通过这类疾病相关数据库,可以很容...
基因转录的过程当中,基因由DNA转录成mRNA的过程受到很多因素的调控。其中就包括了转录因子的调控。转录因子调控的一个主要的过程是转录因子和基因启动子区进行结合...
在 3 月期间 ,总共发表了医学相关在线数据库==30 个==。下面就来给大家介绍一下主要有哪些数据库,以及笔者比较感兴趣的数据库。如果想要所有相关数据库信息的...
在前两天介绍circBase的时候,我们统计了一下目前circRNA方面相关的数据库。使用最多的前10的数据库的时候。除了circBase之外还有很多是用来预测...
之前我们介绍过关于[[ENCODE-转录调控必知数据库]]这个数据库。目前这个数据库更新到了V 5.0的版本。基本界面也发生了变化。所以这里就重新来介绍一下关于...
对于基于转录组数据来评价样本当中的免疫细胞浸润情况的算法已经开发出了很多种了。之前我们在介绍TIMER2.0以及这两个免疫浸润数据库的时候,也提到了很多中算法。...
之前在介绍一些关于生物学基本知识的时候,提到过[[SNP是什么东西?]]以及[[基因突变需要了解那些内容?]]。这类的变异都是通过改变基因序列来影响基因的功能。...
在每一个基因的序列当中包含了很多基因特征性的信息,比如:[[SNP是什么东西?| 基因SNP信息]];DNA甲基化的CG信息或者[[转录因子调控]]的motif...
之前介绍为什么要用文献管理软件?,[[文献管理软件介绍]]的时候,提到了一个文件管理软件叫做Zotero。之前就很推荐是有Zotero进行文献以及网络资源管理。...
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