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函数格式：Series.sort_values(ascending=True, inplace=False)
本次演示我们以R自带的数据集diamonds为例进行绘图，由于数据量比较大我们使用tidyverse随机抽取1000条数据进行演示。
Anaconda：https://www.anaconda.com/（此处请留意安装路径）
上一期我们介绍了如何人工进行亚群注释，本期我们来介绍单细胞转录组数据的自动注释方法：SingleR。
前几期我们确定了我们想要的cluster，接下来就需要进入标志物识别阶段，此步骤可以帮助我们验证某些类群的身份，推测未知类群的身份，即：细胞亚群注释。
本次我们介绍Pandas数据统计函数，如针对数值类型的统计（获取样本个数、平均值、标准差、极值等）；针对非数值类型的统计（获取每个类型的个数）以及计算相关系数和...
在数据分析时，原始数据往往不能满足我们的需求，经常需要按照一定条件创建新的数据列或者修改原有数据列，然后进行后续分析。
本文框架 0. 导入Pandas 1. 数据读取与预处理 2. 使用单个label值筛选数据 3. 使用列表名批量筛选 4. 使用区间进行范围筛选 5. 使用...
上一期介绍了将文件加载到Pandas对象，这个对象就是Pandas的数据结构。本次我们就来系统介绍一下Pandas的数据结构。
本文框架 0.导入Pandas 1.读取csv文件 1.1 查看读取前的csv数据 1.2 读取数据 1.3 初步数据探索 2. 读取txt文件 2.1 查看...
上期推文单细胞转录组 | 多样本处理与锚定法整合介绍了使用锚定法进行多个样本整合，本期我们来介绍另一个多样本整合的主流方法：Harmony。
前几期我们介绍了对单个样本进行处理，本次我们介绍如何处理多个样本以及如何对多样本进行整合矫正。
单细胞测序的细胞数目成千上万，在后续分析中需要对其进行注释，但是对每一个细胞都进行注释不现实，因此我们需要对这些细胞进行聚类，这样只需要对聚类生成的cluste...
假设一共1000个细胞，每个细胞只有一个基因（基因Ⅰ）的表达，那么这些细胞会分布在以基因Ⅰ为x轴的一维坐标轴上；如果每个细胞有两个基因（基因Ⅰ、基因Ⅱ）表达，那...
细胞周期一般包括G1（DNA合成前期）、S（DNA合成期）、G2（DNA合成后期）以及M（细胞分裂期）。
BUSCO能利用单拷贝同源基因数据库对基因组序列的完整性进行分析。BUSCO的核心原理是调用hmmsearch将待分析的基因组（转录组序列或蛋白序列）和单拷贝同...
原核生物的基因没有内含子，其基因预测相对真核生物简单。本期将以大肠杆菌基因组为例，讲解如何使用GeneMarks对原核基因组进行预测。
本期将演示如何使用FastQC对二代测序数据进行质控以及对质控报告进行全方位的解读。
三代测序错误率比较高，一般组装后需要进行纠错来提高准确度。本次介绍使用racon来对三代基因组进行纠错优化。
三代测序错误率比较高，一般组装后需要进行纠错来提高准确度。本次介绍使用Pilon通过引入二代测序数据来对三代基因组进行纠错，此外Pilon还支持对二代测序数据拼...
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