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在RNA-seq、微阵列等基因差异表达分析中，DESeq2、edgeR和limma是最常用的三大工具。之前我们分别介绍了这三款软件，它们都可以在Galaxy云平...
在生物信息学领域，网络分析是一项不可或缺的重要技能，可以分析基因蛋白质等的复杂的关联，也可以绘制出令人赏心悦目的网络图。本期为大家分享自己总结的几个常用的网络分...
看到有些朋友还在手搓 Bulk 转录组分析流程，然后碰到问题又在群里提问。今天我们就来盘点一下 usegalaxy.cn 平台上被广泛使用的 Bulk 转录组分...
你是否曾因生信分析的高门槛而却步？是否在软件安装和环境配置中耗尽耐心？Galaxy生物信息云平台正以零代码、全流程、可重复的特性，掀起一场生信分析的效率革命！
大家好！今天给大家介绍一款在生物信息学领域广泛使用的多序列比对工具——MUSCLE（Multiple Sequence Comparison by Log-Ex...
有项目需要用到BRIG软件画圈图。这软件虽然发表于10多年前，并且已经不再更新。但现在依然受到不少人的欢迎。可能是因为其提供桌面UI界面，对新手小白友好的缘故。
首先 SPNserotype，找了一圈，愣是没找到下载地址，作罢。而 PneumoCaT 要求输入 FASTQ 文件，看其帮助信息可知：
关键词：WES 胚系变异检测流程。GATK 最佳实践，GRCh37，二代 Paired-End 数据（Illumina / BGI）
本文以人 WES 测序数据为例，演示 DeepVariant 软件进行变异检测的基准测试过程。
识别差异丰度微生物是微生物组研究的常见目标，多种方法交替用于此目的，但很少有大规模研究系统探讨这些工具交替使用的适宜性及差异的程度和重要性。今天我们要学习的这篇...
进入网站：usegalaxy.cn，在左侧工具搜索框中输入：deseq2，结果中第一个便是。
标题：Integrated whole-exome and bulk transcriptome sequencing delineates the dynam...
于是就轻易答应了下来。没成想，这一干就是一周，跨年都快到10点了才开始。只能说，这就是生信人的命。大家说还有坚持的必要吗？
RNA 测序（RNA-seq）是转录组研究的重要技术，自其问世以来已开发出数百种分析工具。今天我们来重温这篇Nature Communication论文，来全面...
大家好，今天要给大家介绍一个在基因组组装领域非常实用的工具——RagTag。RagTag 是一套基于参考基因组的软件工具集，这个由加州大学开发的工具包，主要用于...
标题：RNA-seq data science: From raw data to effective interpretation
在生物医学领域，转录组分析是研究基因表达调控的重要手段，它能帮助我们了解细胞在不同生理病理状态下的基因表达变化，从而揭示生命过程的奥秘。而在转录组数据分析中，有...
当你在处理一份土壤样本的宏基因组数据时，突然发现测序结果中出现意料之外的微生物信号——是样本污染？还是新物种的线索？这时候，你需要快速扫描整个NCBI RefS...
在进行基因组组装质量控制时，科研人员常常面临一个难题：如何快速判断新组装的基因组与参考基因组之间的差异？传统方法需要逐个碱基比对，既耗时又难以发现结构变异。而C...
VCF（Variant Call Format）文件存储了染色体位置、突变类型、质量评分等信息。它包含三个部分：
