三兔测序学社

文章/答案/技术大牛

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发表了文章 2天前2026-01-27 13:33:34

探索ImmGen:6-自定义基因集分析

在DataBrowsers页面，是所有分析模块的汇总界面。在这个页面中，许多模块已经在之前提及。本文主要来探索MyGeneset这个分析模块功能。是免疫基因集的...

三兔测序学社 2天前2026-01-27 13:33:35

编码、工具、数据、芯片、数据库

发表了文章 2天前2026-01-27 13:33:19

探索ImmGen:5-基因字典

ImmGen最新的功能：genepage：基因字典。在这个页面中，有以下几个模块：

三兔测序学社 2天前2026-01-27 13:33:19

工具、开发、数据、网络、编码

发表了文章 2天前2026-01-27 13:32:38

探索ImmGen: 4-小鼠器官免疫细胞基因空间图谱

ImmGenMaps是免疫基因组计划联盟（ImmGen）启动的全新开源项目，旨在利用空间转录组学技术绘制小鼠器官中免疫细胞的综合空间图谱。该项目第一阶段将生成2...

三兔测序学社 2天前2026-01-27 13:32:39

工具、开发、数据、开源、数据分析

发表了文章 2天前2026-01-27 13:32:12

探索ImmGen: 3-查询小鼠基因表观遗传修饰

在ImmGen 的Chromatin模块，不同组织不同免疫细胞发育阶段或刺激后的开放染色质区域ATAC-seq数据、组蛋白修饰CUT&RUN以及转录因子分析。

三兔测序学社 2天前2026-01-27 13:32:12

cut、dp、可视化、数据

发表了文章 2天前2026-01-27 13:31:31

探索ImmGen:2-T细胞综合图谱

immgen T 开源项目”联合41个实验室，绘制了包含62万余个细胞的小鼠T细胞综合图谱，整合多组学数据揭示了8大类及114个亚群，旨在全面解析T细胞在不同组...

三兔测序学社 2天前2026-01-27 13:31:31

开源、地图、工具、数据、搜索

发表了文章 2天前2026-01-27 13:31:09

探索ImmGen: 1-基因表达查询

Immunological Genome Project”免疫基因组计划（ImmGen）是一个小鼠免疫百科全书平台。其核心目标是通过高通量基因组学技术，深度解析...

三兔测序学社 2天前2026-01-27 13:31:10

网络、人工智能、编码、工具、数据

发表了文章 16天前2026-01-13 19:44:23

探索SLE：从CDCP网站在线分析SLE与DLE皮肤单细胞数据

CDCP（Cell-omics Data Coordinate Platform，细胞组学数据协调平台）。这是一个非常优秀的国产单细胞数据库（https://d...

三兔测序学社 16天前2026-01-13 19:44:23

数据、数据库、网站、cell、可视化

发表了文章 16天前2026-01-13 19:43:51

探索SLE：cellxgene数据库在线分析Science期刊发表的系统性红斑狼疮患者外周血单细胞数据集

网址：https://cellxgene.cziscience.com/gene-expression

三兔测序学社 16天前2026-01-13 19:43:52

数据库、https、com、expression、数据

发表了文章 24天前2026-01-05 10:37:23

ABC Portal :一个专注于血液和免疫细胞的‌单细胞转录组数据库

ABC Portal 是一个专注于血液和免疫细胞的‌单细胞转录组数据库（http://abc.sklehabc.com）‌，旨在为血液学和免疫学研究提供交互式分...

三兔测序学社 24天前2026-01-05 10:37:23

工具、可视化、数据、网络、数据库

发表了文章 24天前2026-01-05 10:37:10

探索SLE：从ABCportal网站在线分析系统性红斑狼疮患者外周血单细胞数据

ABC Portal 是一个专注于血液和免疫细胞的‌单细胞转录组数据库（http://abc.sklehabc.com）‌，旨在为血液学和免疫学研究提供交互式分...

三兔测序学社 24天前2026-01-05 10:37:11

数据库、网站、可视化、数据、网络

发表了文章 2025-12-292025-12-29 12:57:08

超级增强子系列10: bedtools筛选Lost/Gained超级增强子

在进行不同组别超级增强子区域的比较，通常会进行交集分析，并根据结果将超级增强子分为Maintained (维持，交集部分），Lost(在实验组丢失），Lost(...

三兔测序学社 2025-12-292025-12-29 12:57:08

工具、可视化、软件、数据、服务器

发表了文章 2025-12-292025-12-29 12:57:03

超级增强子系列9: ggseqlogo进行Motif文件可视化

在MEME等在线motif发现工具中，输出的motif通常以比特（bits）形式表示信息含量如图1所示，反映的是每个位置相对于背景的保守性，而非碱基出现的...

三兔测序学社 2025-12-292025-12-29 12:57:03

file、工具、可视化、数据、数据库

发表了文章 2025-12-292025-12-29 12:56:56

【免疫学实验】揭秘蛋白互作：免疫沉淀与免疫共沉淀

在抗体研发和蛋白质研究中，我们常常需要从复杂的细胞环境中“钓”出特定的目标蛋白。今天，我们就来聊聊两种核心的“打捞”技术：免疫沉淀（Immunoprecipit...

三兔测序学社 2025-12-292025-12-29 12:56:56

研发、原理、ip、翻译

发表了文章 2025-12-292025-12-29 12:56:51

【免疫学实验】抗体标记与显微成像技术全解析

在免疫学研究中，抗体因其能稳定且特异性地结合抗原，常被用作识别细胞、组织或生物流体中特定分子的“探针”。

三兔测序学社 2025-12-292025-12-29 12:56:52

原理、基础、可视化、视频

发表了文章 2025-12-292025-12-29 12:55:40

【免疫学实验】单克隆抗体技术

原因：即使是针对单一抗原决定簇（如半抗原）产生的抗体，其结构也存在差异（异质性）。这可以通过等电聚焦实验验证：识别相同抗原的抗体在电泳后会显示出不同的等电点，...

三兔测序学社 2025-12-292025-12-29 12:55:41

编码、连接

发表了文章 2025-12-292025-12-29 12:55:35

【免疫学实验】放射免疫法、酶联免疫吸附法和竞争抑制分析

放射免疫法（RIA）和酶联免疫吸附法（ELISA）是利用抗体和抗原直接结合的检测方法，两者原理相同，但其检测的方式不同。放射免疫分析常用于测量血液和组织液中的激...

三兔测序学社 2025-12-292025-12-29 12:55:35

连接、数据采集、原理、基础

发表了文章 2025-12-292025-12-29 12:55:27

【ChiP-seq分析】超级增强子系列8: motif 富集分析工具XSTREME输出文件解释

progress.log：记录分析过程中的关键步骤和时间戳，便于追踪分析进度和调试问题。sea_msgs.txt / streme_msgs.txt：分别记录S...

三兔测序学社 2025-12-292025-12-29 12:55:27

数据库、表格、工具、数据、统计

发表了文章 2025-12-292025-12-29 12:55:17

【ChiP-seq分析】超级增强子系列7: 用MEME进行超级增强子转录因子motif 富集分析实战

超级增强子（Super Enhancers, SEs）是一类具有高度转录活性的调控区域，通常富集大量转录因子结合位点，驱动关键基因（如发育调控基因、癌基因）的表...

三兔测序学社 2025-12-292025-12-29 12:55:17

算法、统计、优化、工具、数据

发表了文章 2025-12-292025-12-29 10:14:24

【ChIP-seq分析】超级增强子系列6：GREAT-基因组调控元件专业注释富集工具

GREAT（基因组区域注释富集工具）是一种直接对基因组区域进行的功能富集分析。是一种基因顺式调控元件基因注释工具，如增强子、超级增强子、转录因子结合区域等。该...

三兔测序学社 2025-12-292025-12-29 10:14:25

统计、工具、基础、数据、算法

发表了文章 2025-12-292025-12-29 10:11:11

【免疫学笔记】血球凝集和血型分型

大多数血清学定量分析采用直接测定抗体与抗原结合量的方法，也有某些重要的检测方案是基于抗体对其结合的抗原物理状态的改变。例如，当抗原位于细菌等大颗粒的表面时，抗体...

三兔测序学社 2025-12-292025-12-29 10:11:11

开发、连接、系统、笔记、测试

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