应用管理概述

最近更新时间:2024-06-28 11:56:41

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应用简介

应用指生信分析的一套应用流程,通常使用流程描述语言编写的标准化的、参数化的生物信息分析流程,清晰地定义了分析的输入输出、运行环境和软件依赖,例如 WGS(Whole Genome Sequencing)、WES(Whole Exome Sequencing) 的分析流程。本平台支持使用 Workflow Description Language (WDL) 和 Nextflow 两种流程语言进行应用编辑。 您可以根据需求,选择直接从 Git 仓库引用或导入应用,或从零开始创建一个全新应用,您也可以选择导入平台提供的公共应用到自己的工作项目中。

应用管理

WDL 应用

平台支持使用 WDL 流程语言进行应用编辑, WDL 应用指通过 WDL 语言创建的应用。您可以从零开始创建一个全新应用或直接通过导入 Git 仓库代码文件,也可以选择导入平台提供的公共应用到自己的工作项目中。目前,组学平台支持两种应用编辑模式:应用编辑(代码编辑)应用编辑(图形编辑)。代码编辑模式自由灵活,适合定义复杂的逻辑依赖关系,而图形编辑模式简单易用,能帮助您快速搭建应用框架。您可以根据需要,选择合适的编辑模式开发您的应用。编辑过程中,每一次更新应用都将会被保存为一条历史记录,便于您在时间轴中回溯编辑历史。编辑完成后,您可以选择发布应用的正式版本,对应用进行版本管理。应用创建完成后,您可以选择运行环境,设置运行参数,快速使用腾讯云资源,运行应用的最新版本或历史发布版本。

Nextflow 应用

平台支持通过引用 Git 仓库快速创建 Nextflow 应用。Nextflow 应用指通过 Nextflow 语言创建的应用,您无需在平台从头开始编写代码,可以直接利用已有的 Git 仓库。应用创建完成后,您可以选择运行环境,设置运行参数,快速使用腾讯云资源运行应用,具体操作可参考 Nextflow 应用管理