,gtsummary是一个用于生成高质量、可定制的汇总表的R包。它提供了一种简单而灵活的方式来创建复杂的汇总表,包括描述性统计、分组统计、交叉表、多变量分析等。
gtsummary的优势在于其易用性和灵活性。它提供了一套直观的函数和参数,使得用户可以轻松地创建各种类型的汇总表。同时,gtsummary还支持自定义主题和样式,使用户能够根据自己的需求定制表格的外观。
在使用gtsummary创建复杂汇总表时,可以按照以下步骤进行操作:
下面是一个示例代码,演示了如何使用gtsummary创建一个复杂的汇总表:
# 安装和加载gtsummary包
install.packages("gtsummary")
library(gtsummary)
# 准备数据
data <- read.csv("data.csv")
# 创建汇总表
summary_table <- data %>%
tbl_summary(
by = group_var,
missing = "no",
statistic = list(all_continuous() ~ "{mean} ({sd})",
all_categorical() ~ "{n} / {N} ({p}%)")
)
# 定制汇总表
summary_table <- summary_table %>%
add_p(test = all_continuous() ~ t.test,
comparisons = list(c("group1", "group2")),
pvalue_fun = ~style_pvalue(.x, digits = 2)) %>%
add_n()
# 输出汇总表
summary_table %>%
as_gt() %>%
print()
在这个示例中,我们使用了一个名为data.csv的数据集,并根据group_var变量进行分组汇总。汇总表中包含了所有连续变量的均值和标准差,以及所有分类变量的频数、样本量和百分比。我们还使用了t.test函数对连续变量进行了两组间的显著性检验,并使用style_pvalue函数对p值进行了格式化处理。最后,我们将汇总表转换为gt对象,并打印出来。
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