Python中可以使用 lifelines 库来进行 Kaplan-Meier 生存曲线估计,并计算较低的 95% 置信区间。
首先,确保已经安装了 lifelines 库。可以使用以下命令进行安装:
pip install lifelines
接下来,导入所需的库和模块:
import pandas as pd
from lifelines import KaplanMeierFitter
然后,准备数据。假设有一个包含生存时间和事件发生情况的数据集,可以将其加载到 Pandas 的 DataFrame 中:
data = pd.DataFrame({
'time': [10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55],
'event': [1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 1]
})
在上述示例中,'time' 列包含生存时间,'event' 列表示事件发生情况(1 表示事件发生,0 表示未发生)。
接下来,创建一个 KaplanMeierFitter 对象,并使用数据拟合生存曲线:
kmf = KaplanMeierFitter()
kmf.fit(data['time'], data['event'])
现在,可以使用 plot() 方法绘制生存曲线图:
kmf.plot()
要计算较低的 95% 置信区间,可以使用 confidence_interval_survival_function() 方法:
confidence_interval = kmf.confidence_interval_survival_function_
最后,打印出较低的 95% 置信区间:
print(confidence_interval)
以上就是使用 Python 中的 lifelines 库进行 Kaplan-Meier 生存曲线估计,并计算较低的 95% 置信区间的方法。
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