R:如何从nlmer输出中提取随机效果
从nlmer输出中提取随机效果，可以通过以下步骤进行：
- 理解随机效果：随机效果是指在统计模型中，与固定效果不同，它是随机变量，表示在不同观测单位之间的变异性。在混合效应模型中，随机效果通常用于建模观测单位之间的随机差异。
- 检查nlmer输出：首先，需要检查nlmer函数的输出结果，确保模型已经成功拟合。nlmer函数是R中用于拟合非线性混合效应模型的函数，它返回一个包含模型参数估计值、拟合优度等信息的对象。
- 提取随机效果：从nlmer输出中提取随机效果，可以使用随机效应的名称或索引。可以通过以下代码示例来提取随机效果：
# 假设nlmer输出为model_output
# 提取随机效果
random_effects <- ranef(model_output)
# 打印随机效果
print(random_effects)在上述代码中，ranef()函数用于提取随机效果，将其存储在random_effects变量中。然后，可以使用print()函数打印随机效果的值。
- 解释随机效果：根据具体的问题和模型，解释随机效果的含义。随机效果通常表示观测单位之间的随机差异，可以用于分析不同观测单位之间的变异性。
- 相关腾讯云产品：根据具体的应用场景和需求，腾讯云提供了一系列与云计算相关的产品和服务。例如，如果涉及到大规模数据存储和处理，可以考虑使用腾讯云的对象存储 COS（https://cloud.tencent.com/product/cos）和弹性MapReduce EMR（https://cloud.tencent.com/product/emr）；如果需要构建高可用性的应用程序，可以使用腾讯云的容器服务 TKE（https://cloud.tencent.com/product/tke）和负载均衡 CLB（https://cloud.tencent.com/product/clb）等。
请注意，以上答案仅供参考，具体的应用场景和推荐产品需要根据实际情况进行评估和选择。
相关·内容
1回答
library(lme4)(nm1 <- nlmer(circumference ~ SSlogisTree Asym 31.646 我试图提取Asym随机效应的标准差(例如31.646)，但我已经尝试过summary(nm1)$varcor$
浏览 13提问于2018-02-19得票数 1
回答已采纳
1回答
., .id = 'shuffle')
ddd 此部分仅提取固定效果。(summary(.x)$Solutions, rownames = "model_term") 但请注意，我没有运行没有任何固定效果的模型，因此输出为空。如何使用相同或相似的代码提取随机效果？我想我可以将“解决方案”更改为其他东西，以便从我运行的没有任何固定效果的模型中提取随机</
浏览 37提问于2020-10-28得票数 1
1回答
我一直在使用"nlme“包中的R Orthodont数据集。只需使用install.packages("nlme");library(nlme);head(Orthodont)查看即可。使用lme4包，我可以使用logistic曲线作为我的函数形式来拟合非线性混合效果模型。我可以选择将渐近线和中点作为随机效果输入
nm1 <- nlmer(distance ~ SSlogis(age,Asym, xmid, scal) ~ (Asym | Subjec
浏览 0提问于2013-03-01得票数 9
回答已采纳
我已经成功地拟合了一个线性混合效果模型，我正在寻找提取单个组的随机效果分量。我知道可以使用以下命令提取随机效果的完整列表然后print(random.effects(模型))给出一个包含两列的组名称和随机效果列表，即使数据本身似乎只有一列我的问题是，是否可以通过组名“查找”与特定组相关联的随机效果，或者，如果不能，我如何才能找到与ran
浏览 2提问于2010-09-10得票数 2
回答已采纳
2回答
线性混合效果模型传统上是以以下方式表示的。Ri = Xi×β+ Zi×bi +εi，其中β表示估计的固定效果，Z表示随机效果。因此，X是经典的设计矩阵。使用R，我希望能够在使用nlme包中的lme拟合模型后提取这两个矩阵。例如，数据集" rails "，也可以在nlme包中找到，包含6个随机选择的铁路轨道上的超声波旅行时间的三个单独测量。我可以拟合一个简单的模型，具有截距固定效果和每个轨道的随机<
浏览 0提问于2013-11-01得票数 6
7回答
我有一个具有固定和随机效果的mer对象。如何提取随机效果的方差估计？这是我的问题的一个简化版本。study <- lmer(Reaction ~ Days + (1|Subject), data = sleepstudy)这会产生一个很长的输出--在本例中不会太长。不管怎样，我该如何显式地选择Groups Name Variance Std.Dev.Subject
浏览 1提问于2011-12-16得票数 46
回答已采纳
我正在尝试从随机效果表中提取单个元素，该表包含在由混合效果模型的摘要调用创建的对象中。具体地说，我想提取每个2级随机效果。)
当我们调用它时，我们得到了输出0.74498367 0.03515508 0.76672652 1.918965
浏览 1提问于2016-05-02得票数 0
0回答
我正在寻找一个类似于在nlme，lme4和brms中使用的ranef()的命令，它将允许我在我的MCMCglmm模型中提取单独的随机效果。在我的数据集中，我有40个提供者，我想为每个提供者提取随机效果，并将它们绘制在毛虫图中。任何建议都是很棒的。谢谢。如果有用，这里是我的MCMCglmm模型：
prior.3 <- list(R = list(R1 = list(V = diag(2), nu = 0.002)),
浏览 11提问于2017-12-02得票数 5
1回答
我需要从我的模型中提取出随机效应的后验估计值和间隔。#load packagem.surv<-lmer(weight ~ Time + Diet + (1|Chick(Chick)时，在第二行代码中会出现以下错误：smranef.surv=as.mcmc(smran
浏览 5提问于2019-11-24得票数 2
回答已采纳
对我来说，最有效的方式是如何包装基于模型的代码(提供起始参数值的lmer、nlmer模型的函数以及nlmer本身的模型规范)，以便根据模型中的年龄区间假人数应用正确的函数和模型？我希望能就如何做到这一点提出一些建议。有一天，我花了一天时间想出如何使nlmer模型所需的函数工作，所以我仍然处于函数初级阶段。我在网站上搜索了其他与R相关的自动化问题，但我没有发现任何类似于我想要做的事情。根据注释中关于使用字符串的建议进行更新
浏览 2提问于2012-02-05得票数 3
我想从一个文件中随机挑选一些行(例如20行)并将其打印到另一个文件中，但我希望有一个固定的种子，以便在输入文件相同的情况下获得相同的输出。我发现的示例选择了几行，它们的输出每次都是不同的，例如：
perl -e '$f="inputfile";$_=`wc -l $f`;@l=split( );$r=int rand(@l[0]);system("head -n$r $f|tail -20")'> out
浏览 2提问于2012-06-21得票数 1
回答已采纳
1回答
我正在使用R中的lmer运行一个混合效果模型，并且在按组绘制模型和提取直线方程时遇到了问题。我想我需要看看固定的和随机的效果，使我的方程的最终条件模型如下(即，cond_ind_waterxsilver)。当我为模型提取这些值时，我得到的截取值比我预期的要高得多。谁能为我提供一些指导，如何从输出中提取模型的值来制作线条，以及如何绘制模型结果？以下是我正在尝试解释的输出</e
浏览 20提问于2019-01-30得票数 0
我正在尝试从我的线性混合效果模型中提取每个组的斜率和截距。该模型是在lme4库中使用lmer构建的，我可以使用jtools库中的interact_plot查看每组的结果。如何获得每条线的斜率和截距？ 我知道我可以使用summary()或summ()来查看固定效果的估计值和随机效果的方差，但我看不到随机效果的估计值。因此，我无法准确计算模型的斜率和截距。> interact_plot(cond_ranin_wat
浏览 35提问于2019-02-05得票数 1
回答已采纳
1回答
如何拟合具有混合效应的nls模型
、、、、
我想要拟合一个随机效应的线性平台模型。我找到了一种将函数与nls()相匹配的方法，但我不知道如何包含随机效应。* coef(p10)["c"]),我想要做的是将z作为一种随机效应，因为从同一z级别收集的所有数据都不是独立的。我知道如何用nlmer函数<e
浏览 0提问于2019-04-21得票数 1
回答已采纳
我希望使用函数从列表中获取x随机元素。你们中有谁能告诉我如何从列表中以列表的形式提取x随机元素吗？ r <- randomRIO (0, n)
xRanElems2 xs n <
浏览 9提问于2022-02-22得票数 2
回答已采纳
7回答
所以假设我有这句话我想要的是在括号之间随机提取一个单词，这是我用awk -vRS="}" -vFS="|" '{print $2}'做的(仍然在随机地提取它们)。输出通常是第二个单词，在我们的例子中是snowing。问题是输出仅为snowing，而我想要的实际输出类似于It's snowing out
浏览 11提问于2021-12-24得票数 2
1回答
最近我参加了SAS的ANOVA课程，并且正在用R重写我的代码。到目前为止，我还没有将随机效应(和混合效应)模型从SAS转换到R。我从R得到的输出与SAS有很大的不同: SS和F值是不同的，对于随机效应我不能得到F检验。我所能得到的最接近的是使用rand()的Chi。所以也许我在R中做错了一切。下面是SAS代码和输出，然后是在R.R中的混合效应模型
浏览 1提问于2018-03-22得票数 2
回答已采纳
1回答
该模型具有4个固定效应和4个随机效应。<- nlmer(deriv_mod ~ list(p1 ~ 1, b1 ~ 1, p2 ~ 1, b2 ~ 1) +
list(p1 ~ 1, b1 ~从文档中可以看出，formula for nlmer也必须有一个梯度组件，因此我首先使用了deriv函数。但是，我不知道如何指定其余的参数？及其相应的4个随机效应(在第二个列表对象中)。但是，我不太清楚如何
浏览 3提问于2017-06-26得票数 9
回答已采纳
2回答
我得到帮助从一个fasta文件中减去一个随机的200序列，如下所示：使用此方法：这是：r=$(shuf -i1-"$((n-200+1))" -n1)
< newfiletail -c+"$r&qu
浏览 0提问于2020-12-04得票数 0
扫码
添加站长 进交流群
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
相关资讯
热门标签
云服务器
ICP备案
对象存储
即时通信 IM
实时音视频活动推荐
腾讯云开发者
