在Linux操作系统中,可以使用各种命令和工具来处理和转换文本文件。当需要将以逗号分隔的CSV文件转换为以制表符分隔的TSV文件时,可以使用一些简单的命令和技巧来实现。本文将详细介绍如何在Linux中将CSV文件转换为TSV文件。
写在开篇 不知道你们有没有过这样的经历:我们去某些网站注册帐号,当你在设置密码的时候,网站会提示你密码的长度范围,以及对应的规则限制,现在假设我们不知道正则表达式,作为程序员,该如何去实现这样一个密码
cut应用场景:通常对数据进行列的提取 (在工作中,我们通常会对数据库或者查出来的日志进行列的提取)
我有一个制表符分隔的文件,有超过2亿行。 什么是最快的方式在Linux中将其转换为CSV文件? 这个文件确实有多行标题信息,我需要在路上去除,但标题的行数是已知的。 我已经看到了sed和gawkbuild议,但是我想知道是否有“首选”的select。
首先正则表达式分为三类(man grep可以看到,分别是basic RegExs,extended RegExs,perl RegExs)
在linux下一般用while read line与for循环按行读取文件。现有如下test.txt文件:
现在学的是Linux中的正则表达式,最常应用正则表达式的命令是linux三剑客:grep(egrep),sed,awk。
假设fasta文件名为: aligned_fasta.fasta 读取fasta文件,转化:
是的,\t 是指制表符(tab),它通常用作字段分隔符在 TSV(Tab-Separated Values)格式的文件中。TSV是一种简单的文本格式,它使用制表符来分隔每一列中的值,而每一行则代表一个数据记录。
要注意的是,有些命令不支持正则模式,比如fs、find等,有些是支持正则的,比如grep、awk、sed等。正则的语法和js中的正则几乎没有区别,下面仅简单罗列下常用的正则:
编写shell脚本时,您可能需要将多行文本或代码块传递给交互式命令,例如tee,cat或sftp。在Bash和其他类似Zsh的shell中,Here document(Heredoc)是一种重定向,允许您将多行输入传递给命令。
tr命令可以对来自标准输入的字符进行替换、压缩和删除。它可以将一组字符变成另一组字符,经常用来编写优美的单行命令,作用很强大。
awk是一种用于处理文本、模式匹配的编程语言。与sed和grep,俗称Linux下的三剑客。学会 awk 等于你在 Linux 命令行里,又多了一种处理文本的选择。这篇文章重点教你如何使用,看完这篇文章,就大致知道如何使用了,力求简单使用。
这里会报错: Reading liftover chains Mapping coordinates invalid signed integer: "+"
-多年互联网运维工作经验,曾负责过大规模集群架构自动化运维管理工作。 -擅长Web集群架构与自动化运维,曾负责国内某大型金融公司运维工作。 -devops项目经理兼DBA。 -开发过一套自动化运维平台(功能如下): 1)整合了各个公有云API,自主创建云主机。 2)ELK自动化收集日志功能。 3)Saltstack自动化运维统一配置管理工具。 4)Git、Jenkins自动化代码上线及自动化测试平台。 5)堡垒机,连接Linux、Windows平台及日志审计。 6)SQL执行及审批流程。 7)慢查询日志分析web界面。
cut是一个选取命令,。一般来说,选取信息通常是针对“行”来进行分析的,并不是整篇信息分析的。
前篇文章由案例驱动,总结了Sell中的基本语法,这篇文章带大家由案例驱动学习下Sell中的自带的工具命令。
在正则表达式中,还有很多的内容值得学习。 之前的两篇中列举了很少的一部分。没有做更多的分析。 -->字符组 下面的例子可以根据字符组来灵活匹配。比如输入了Good cat或者Good hat就可以通过字符组来进行匹配。[ch] $ echo "Good cat"|sed -n '/[ch]at/p' Good cat $ echo "Nice hat"|sed -n '/[ch]at/p' Nice hat $echo "Yes" |sed -n '/[Yy][Ee][Ss]/p' Yes 当然了匹
说明:Linux pstree命令将所有行程以树状图显示,树状图将会以 pid (如果有指定) 如果有指定使用者 id,则树状图会只显示该使用者所拥有的行程。
精心整理了生物信息学中常用的 Linux 命令,很不容易。所有命令的用法都经本人亲自测试。掌握这些命令,是每一个生信人基本的自我修养。
作者精心整理了生物信息学中常用的 Linux 命令,很不容易。所有命令的用法都经本人亲自测试。掌握这些命令,是每一个生信人基本的自我修养。
正则表达式在处理数据时非常有用,它凭借强大的模式匹配功能,能够用来精确地过滤文本数据,提取有用的数据信息。
使用while true循环,>/dev/null 2>&1 将程序的输出重定向到/dev/null,同时包括标准错误和标准输出。
[] eg: TATA-box 则可表示为:TATAATAAT. (这里的塔塔盒是指TATAWAWN 其中W=A/T N=ATC/G)
paste命令会把每个文件以列对列的方式,一列列地加以合并 ,他就是相当于把两个不同的文件内容粘贴在一起,形成新的文件。
Shell 脚本作为数据处理的得力助手,在文本清洗、数据格式转换等领域扮演着重要角色。本文将带您深入探索 Shell 脚本在数据处理中的实际运用。我们将介绍几个实用的例子,展示如何利用简单的脚本命令处理文本文件和数据,清洗格式、提取信息。让我们一起来揭开这个充满实用技巧的数据处理世界。
注意Windows系统文件格式与Linux系统不一样,将Windows的文件上传后需要转换格式,才能使用Linux命令操作
还有这一种方式,使用cp指令flag.php中的文件写入2.txt,直接打开就能得到flag。
Linux 文本处理三剑客grep、sed、awk,这三个命令在工作和面试过程中出现的频率非常高,有时候很复杂的需求,一条简单的命令就可以实现,今天就先学习一下最强大的awk。
作者 likegeeks 译者 张斌 我们每天都会使用Linux命令行,但由于实践不多,我们可能会忘记一些Linux命令行技巧。在本文中,我将向你展示一些你可能会忘记或可能对你来说较新的Linux命令
linux 有大量的配置文件,所以 linux 的文本处理工具也是比较多的,常用的有 less vi head tail cat grep sed awk …. 。其中编辑一些配置文件,及查看日志时,常用的工具就是 vim 和 less ,而且它两的快捷键又很相似,所以学会 vim 的使用还是挺必要的。
echo是Linux bash和C shell中最常用和最广泛使用的内置命令之一。 echo的语法: echo [option(s)] [string(s)] 1.输入一行文本并显示在标准输出上 $ echo rumenz is a community of Linux Nerds 输出以下文本: rumenz is a community of Linux Nerds 2.声明一个变量并打印它的值。例如:声明一个变量x并分配其值 =10. $ x=10 打印: $ echo The value o
sed很早就支持正则表达式了,这在文件处理中非常有用,以下列出一些常见用法(GNU SED版本)。
继续总结一下linux 的文本处理。包括但不限于awk, sed, paste,split,grep....
本文将介绍Linux下使用Shell处理文本时最常用的工具:find、grep、xargs、sort、uniq、tr、cut、paste、wc、sed、awk;
今天在写一个脚本的时候,遇到了很多字符过滤的问题,感觉还是有些技术含量的,这里记录下来,以便后续参阅。
本文将介绍Linux下使用Shell处理文本时最常用的工具:find、grep、xargs、sort、uniq、tr、cut、paste、wc、sed、awk;提供的例子和参数都是最常用和最为实用的;对shell脚本使用的原则是命令单行书写,尽量不要超过2行;如果有更为复杂的任务需求,还是考虑python吧.
用于文本搜索,匹配文件内容,语法格式为:grep pattern filename,例如:
Linux Shell是一种基本功,由于怪异的语法加之较差的可读性,通常被Python等脚本代替。既然是基本功,那就需要掌握,毕竟学习Shell脚本的过程中,还是能了解到很多Linux系统的内容。
在 Linux 环境下编写 Shell 脚本时,能够灵活处理函数的返回状态以及获取脚本的实际路径是非常有用的技能。本文将详细介绍如何让函数返回执行状态而不是退出脚本,并推荐使用的获取脚本所在位置的方法。
是对字符串操作的一种逻辑公式,就是用事先定义好的一些特定字符、及这些特定字符的组合,组成一个“规则字符串”,这个“规则字符串”用来表达对字符串的一种过滤逻辑。
我们可以在执行shell脚本时实时传递参数从而指定某些具体的参数(在本例中包括表格的样式、颜色等),脚本中获取参数的格式为$n。其中除n为0表示执行的文件名外,1表示第一个参数,2表示第二个参数,以此类推。
前言 这两天自己挽起袖子处理日志,终于把AWK给入门了。其实AWK的基本使用,学起来也就半天的时间,之前总是靠同事代劳,惰性呀。 此文仅为菜鸟入门,运维们请勿围观。 下面是被处理的日志的示例,不那么标准,但不标准的日志正是标准的情况。 [2015-08-20 10:00:55.600] - [192.168.0.73/192.168.0.75:1080 com.vip.xxx.MyService_2.0 0 106046 100346 90ms 110ms] 基本语句 最基本的语句,以空格做分割,提取所
本文将介绍Linux下使用Shell处理文本时最常用的工具:find、grep、xargs、sort、uniq、tr、cut、paste、wc、sed、awk; 提供的例子和参数都是最常用和最为实用的; 我对shell脚本使用的原则是命令单行书写,尽量不要超过2行; 如果有更为复杂的任务需求,还是考虑python吧; find 文件查找 查找txt和pdf文件 find . \( -name "*.txt" -o -name "*.pdf" \) -print 正则方式查找.txt和pdf find . -
find、grep、xargs、sort、uniq、tr、cut、paste、wc、sed、awk;
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云