1回答
我正在尝试将rpy2 (2.3.4版)库导入Ubuntu12.10机器上的Python (3.2.3版)。rpy2文档说rpy2可以在所有Python3版本下工作，我还找到了其他与rpy2和Python3.2相关的主题，这些主题表明这两个版本应该一起工作。无论如何，当我尝试导入模块时：
from rpy2 import robjects
结果是这样的：
Traceback (most recent call last):
File "<console>", line 1, in <module>
File "/usr/local/lib/
浏览 2提问于2013-03-30得票数 0
回答已采纳
1回答
无法安装rpy2
、、
在Mac10.12.6上，pip install rpy2给了我“rpy2失败的建筑车轮”
我试过。知道下一步该看什么吗？
以下是错误日志：
----------------------------------------
Failed building wheel for rpy2
Running setup.py clean for rpy2
Failed to build rpy2
Installing collected packages: rpy2
Running setup.py install for rpy2 ... error
Complete out
浏览 4提问于2017-10-22得票数 1
我正在尝试从下载的源归档文件' rpy2 -2.2.1.tar.gz‘安装rpy2。我一直在按照rpy2 提供的安装说明进行操作。这就是我正在做的事情：
tar -xzf rpy2-2.2.1.tar.gz
cd ~/Desktop/rpy2-2.2.1
python setup.py build install
下面是尝试的终端输出：
running build
running build_py
creating build
creating build/lib.macosx-10.6-intel-2.7
creatin
浏览 2提问于2011-06-30得票数 2
我一直试图在MacOSX10.9上安装rpy2，但我一直无法这样做。我认为R共享库存在问题，但我看到R是默认安装共享库选项的。任何帮助都将不胜感激！
这是日志：
Downloading from URL https://pypi.python.org/packages/source/r/rpy2/rpy2-2.3.9.tar.gz#md5=86851a56f637e7b87709eb2b91dc5075 (from https://pypi.python.org/simple/rpy2/)
Running setup.py (path:/private/tmp/pip_build_root/
浏览 4提问于2014-03-21得票数 5
我正在尝试在RedHat6上安装rpy2。我已经按照这里的说明升级到了R3.3.3：
当我执行rpy2安装时，它会失败，并显示以下信息：
$ sudo /usr/local/bin/pip2.7 install rpy2
Collecting rpy2
Using cached rpy2-2.8.6.tar.gz
Requirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): six in /usr/local/lib/python2.7/site-packages (from rpy2)
Requirement already sati
浏览 3提问于2017-07-16得票数 0
2回答
升级Rpy2版本
、、、
我以前在我的电脑上安装了rpy2，使用了来自的合适的轮子。但是，现在我需要升级到最新版本的rpy2。我做了以下工作：
pip install rpy2 --upgrade
但这没有成功，给了我以下错误：
ERROR: Command errored out with exit status 1: python setup.py egg_info Check the logs for full command output.
这个错误在我第一次尝试安装rpy2时弹出，最后从下载了预编译的二进制文件。
在我的系统环境变量中有：
C:\Users\96171\AppData\Local\Pro
浏览 5提问于2020-03-01得票数 1
如何在colab.research.google上安装rpy2？我尝试了这个命令：
pip install rpy2
import rpy2
但它不起作用。这是获取的错误：
Collecting rpy2
Using cached https://files.pythonhosted.org/packages/02/d1/074ffbbe7b4bf74c60b75d74c8e67a1e4515b0d85f85cd6540e39610754a/rpy2-2.9.5.tar.gz
Complete output from command python setup.py egg_info:
Err
浏览 8提问于2019-01-26得票数 1
I在使用pip的角色中:在虚拟环境中：
- name: pip Install packages into virtualenv
pip: >
name={{ item }} virtualenv="{{ home }}/{{ venv_name }}"
virtualenv_site_packages="no"
with_items:
- rpy2
安装rpy2时出现此错误
failed: [vagrant] => (item=rpy2) => {"cmd": "/home/toto/v
浏览 1提问于2016-05-02得票数 0
1回答
无法安装RPy2
、、
在尝试安装RPy2时，我得到了以下输出。我做错了什么？未满足哪些前提条件？
username@usernameVB:~$ pip install rpy2
Collecting rpy2
Using cached https://files.pythonhosted.org/packages/f1/98/c7652cc9d7fc0afce74d2c30a52b9c9ac391713a63d037e4ab8feb56c530/rpy2-2.9.4.tar.gz
Requirement already satisfied: six in ./miniconda3/lib/python3
浏览 18提问于2018-07-27得票数 0
在Ubuntu12.04上安装rpy2时出现错误的原因是什么？
easy_install rpy2
Searching for rpy2
Reading http://pypi.python.org/simple/rpy2/
Best match: rpy2 2.3.9
Downloading https://pypi.python.org/packages/source/r/rpy2/rpy2-2.3.9.tar.gz#md5=86851a56f637e7b87709eb2b91dc5075
Processing rpy2-2.3.9.tar.gz
Running rpy2-2.3.9/se
浏览 0提问于2014-04-07得票数 3
我试过他的；rpy2安装错误，但也没什么用。我试过很多次！请帮帮我！
Collecting rpy2
Using cached rpy2-2.9.2.tar.gz
Complete output from command python setup.py egg_info:
rpy2 is no longer supporting Python < 3. Consider using an older rpy2 release when using an older Python release.
---------------
浏览 0提问于2018-01-22得票数 1
回答已采纳
1回答
我已经尝试了从源代码(python setup.py安装)和macports安装rpy2 (成功终止)，在尝试导入rpy2时，我收到以下错误：
/Library/Python/2.7/site-packages/rpy2/rinterface/__init__.py in <module>()
76
77
---> 78 from rpy2.rinterface._rinterface import *
79
80
ImportError: dlopen(/Library/Python/2.7/site-packages/rp
浏览 2提问于2011-08-01得票数 1
回答已采纳
如何用Python从theme_classic中的rpy2访问rpy2？即：
有办法从rpy2中使用它吗？
浏览 5提问于2013-08-30得票数 0
回答已采纳
我无法在Ubuntu14.04.2LTS上获得rpy2。我有python版本2.7.6并运行
sudo安装rpy2
看上去很成功。
Collecting rpy2
Using cached rpy2-2.6.1.tar.gz
Requirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): six in /usr/local/lib/python2.7/dist-packages (from rpy2)
Requirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): singled
浏览 3提问于2015-07-24得票数 0
回答已采纳
1回答
我正在使用基于Debian的Linux，并试图用pip3安装rpy2。
当类型：
sudo pip3 install rpy2
我得到了
user@huayra:~$ sudo pip3 install rpy2
Collecting rpy2
Using cached rpy2-2.9.2.tar.gz
Complete output from command python setup.py egg_info:
Error: Tried to guess R's HOME but no command 'R' in the PATH.
----
浏览 0提问于2018-01-20得票数 3
回答已采纳
Python3.7.3，rpy2 3.2.0，下面的代码：
from rpy2 import robjects
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File ".virtualenvs/flask3/lib/python3.7/site-packages/rpy2/robjects/__init__.py", line 14, in <module>
import rpy2.rinterface as ri
浏览 3提问于2019-10-15得票数 5
回答已采纳
2回答
安装rpy2
、、
我在Windows7上使用Anaconda运行Python3.5，我想使用rpy2。我已经安装了R3.3，它在RStudio中运行得非常好。
pip install rpy2
返回
“试图猜测R的家，但路径上没有R命令”
我遵循了一个建议的解决方案，下载了rpy2 2.8，然后
cd Downloads
pip install rpy2-2.8.0+r33-cp35-cp35m-win32.whl
这似乎是可行的(返回“成功安装rpy2-2.8.0")。
然而，
import rpy2
在间谍返回
“没有名为‘rpy2’的模块”
求你帮帮我我迷路了。
浏览 0提问于2016-05-23得票数 0
回答已采纳
寻找关于在python脚本中使用来自WSL的vscode的rpy2的帮助。我无法启动导入。 如果我尝试运行以下代码： import rpy2
print(rpy2.__version__) 我得到以下AttributeError： AttributeError: partially initialized module 'rpy2' has no attribute '__version__' (most likely due to a circular import) 如果我尝试import rpy2.rpackages，我得到以下错误： ModuleNo
浏览 50提问于2021-11-21得票数 0
回答已采纳
我想通过我的一个蟒蛇环境来使用rpy2。我通过打开该环境的终端并按照运行conda install -c r rpy2来安装它。我也运行了pip install rpy2 ，但是
Requirement already satisfied: rpy2 in c:\users\rcardoso\.conda\envs\smartwatt\lib\site-packages (2.9.4)
Requirement already satisfied: six in c:\users\rcardoso\.conda\envs\smartwatt\lib\site-packages (from rpy
浏览 28提问于2020-05-07得票数 1
试图通过以下方式在Mac塞拉利昂上安装rpy2
sudo pip install rpy2
在命令行上。获取此错误：
The directory '/Users/hodor/Library/Caches/pip/http' or its parent directory is not owned by the current user and the cache has been disabled. Please check the permissions and owner of that directory. If executing pip with sudo, you
浏览 3提问于2017-05-23得票数 1
尝试加载时出现以下错误
>>> from rpy2 import robjects
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "C:\Python26\lib\site-packages\rpy2\robjects\__init__.py", line 14, in <m
odule>
import rpy2.rinterface as rinterface
File "C
浏览 1提问于2011-04-23得票数 2
如果有人能在这里帮我，我会很高兴的。
我使用的是ubuntu13.10和Python2.7，R 3.0.1，并且我已经成功地按照rpy2安装指南进行了测试。
当使用这个命令python -m 'rpy2.tests'通过提示符运行测试时，我得到以下错误：
rpy2 version: 2.3.8
built against R version: 3-0.1--62743
............................................................................................ .............
浏览 0提问于2013-11-26得票数 1
#rstats中的interactive()是否基于一些可设置的选项？
我正在将下载计时器(和其他cruft)打印到使用snakemake/rpy2管道构建的Rmarkdown pdf。诚然，我可以使用Rscript而不是rpy2来运行我的R代码，但是使用rpy2似乎要整洁得多。
理想情况下，我希望使用rpy2链接到一个R-session，并且只指示R正在以非交互方式运行。但我想不出该怎么做
浏览 0提问于2018-08-21得票数 0
我正在尝试安装rpy2软件包，并收到以下两个错误：
C:\python27>easy_install rpy2
Searching for rpy2
Reading http://pypi.python.org/simple/rpy2/
Reading http://rpy.sourceforge.net
Best match: rpy2 2.3.3
Downloading http://pypi.python.org/packages/source/r/rpy2/rpy2-2.3.3.tar.gz#md5=6cd95eb70645577cb53198ef0a32395e
Proces
浏览 0提问于2013-03-09得票数 8
我在使用rpy2时收到错误。我认为主要问题是rpy2链接到一个旧的R版本，这个版本可能在我的系统上已经不存在了。 我在一段时间之前安装了rpy2，当时可能有一个更老的R版本。我试图通过重装rpy2来解决这个问题，但是没有成功。 python3 -m rpy2.tests 通向 /usr/local/lib/python3.5/dist-packages/rpy2-2.9.5-py3.5-linux-x86_64.egg/rpy2/rinterface/__init__.py:146: RRuntimeWarning: Warnmeldung:
warnings.warn(x, RRunti
浏览 32提问于2019-01-05得票数 0
回答已采纳
在我的计算机上使用pip to install rpy2时，我得到了这个错误：
C:\Python27\Scripts>pip install rpy2
Collecting rpy2
Using cached rpy2-2.8.2.tar.gz
Complete output from command python setup.py egg_info:
Warning: Tried to guess R's HOME but no command (R) in the PATH.
----------------------------------
浏览 30提问于2016-08-29得票数 0
回答已采纳
2回答
我是一个相当新的R用户，并且已经开始使用Emacs Speaks (ESS)。我还使用rpy2 (一个到R的python接口)，在这里我可以在运行在Emacs中的ipython shell中启动一个R进程。
有没有可能让ESS和rpy2以某种方式共享相同的R进程，这样我就可以在Python/rpy2中编写一些代码来设置一些R对象，然后切换到ESS并直接运行R命令，而不使用python/rpy2？
例如，我可以在Emacs中使用M-x R启动R，然后在我的ipython会话中让rpy2.robjects.r指向或使用这个正在运行的R进程；或者我可以使用rp2.robjects.r在python中
浏览 3提问于2011-02-26得票数 3
回答已采纳
我使用高山作为我的dockerfile中的基础图像。我正在尝试在我的dockerfile文件中安装R和rpy2。RUN apk add R R-dev pip3 install rpy2 ~ # python3 -m 'rpy2.tests'
/usr/local/lib/python3.6/site-packages/rpy2/rinterface/__init__.py:186: RRuntimeWarning: Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) :
unable to load shared objec
浏览 60提问于2019-05-18得票数 1
1回答
在Django中安装rpy2时，我遇到了多个问题。当我写的时候
pip install rpy2
它给了我Visual studio安装错误，我已经满足了视觉相关错误的所有要求，但它仍然没有解决我提到过它
当我使用轮子(.whl)文件安装rpy2时，它被安装了，但是当我运行我的rpy2代码时，它给出了C堆栈限制错误
有什么办法可以解决我长期存在的问题吗？？
浏览 2提问于2018-08-29得票数 0
我尝试在conda环境中的Mac上安装最新版本的rpy2，方法是进入Conda Navigator中的环境，单击我的环境，然后搜索rpy2。但是，这个最新版本没有显示出来。 我还尝试通过终端进行安装，使用： pip install rpy2 这将生成以下错误消息： Could not fetch URL https://pypi.python.org/simple/rpy2/: There was a problem confirming the ssl certificate: [SSL: TLSV1_ALERT_PROTOCOL_VERSION] tlsv1 alert protoco
浏览 149提问于2020-04-28得票数 3
看起来rpy2在Python3和Python2中的行为并不完全相同。特别是，在Python2.7.x中，我可以将与标量进行比较，而在Python3.5.x中，如果我尝试这样做，则会引发以下错误：
TypeError: unorderable types: IntVector() > int()
下面是我的代码片段：
>>> from rpy2 import robjects
>>> x = robjects.IntVector([5, -1])
>>> x > 0
下面是我的pip freeze的摘录(在两个环境中都是一样的)：
浏览 10提问于2016-09-03得票数 1
回答已采纳
Django展示了两个与rpy2相关的包
Django-rpy2
rpy2
它们是不是都不同，就像我熟悉的rpy2一样，但是Django-rpy2提供了什么？我在django-rpy2文档中找不到任何东西。这都是关于什么的？
谢谢
浏览 1提问于2018-08-25得票数 0
回答已采纳
我想在我的实验室顶部使用rpy2库。但是今天早上我没能安装好。
这里有几个问题。任何建议都将不胜感激！
尝试1
使用pip install rpy2。结果显示：
Complete output from command python setup.py egg_info:
Error: Tried to guess R's HOME but no command (R) in the PATH.
----------------------------------------
Command "python setup.py egg_info" fai
浏览 3提问于2016-03-26得票数 3
回答已采纳
我正在尝试构建一个Docker容器，它应该是bookworm并运行python 3.9。默认情况下，bookworm默认安装python 3.10。我必须使用bookworm，因为它是生产的要求。
问题是NumPy与它不兼容。所以我不得不使用python 3.9。现在，我得到了一个错误，无法从rpy2安装requirements.txt包。
我的码头档案
FROM debian:bookworm-20210816-slim
COPY ./requirements.txt /mmm/requirements.txt
WORKDIR /mmm
RUN apt-get -y update
RU
浏览 15提问于2022-07-13得票数 0
2回答
import numpy
import rpy2
from rpy2 import robjects
import rpy2.robjects.numpy2ri
r = robjects.r
rpy2.robjects.numpy2ri.activate()
x = numpy.array( [1, 5, -99, 4, 5, 3, 7, -99, 6] )
mx = numpy.ma.masked_values( x, -99 )
print x # works, displays all values
print r.sd(x) # works, but uses
浏览 3提问于2012-02-29得票数 1
回答已采纳
我已经通过pip install rpy2安装了rpy2。在此之后，在Jupyter笔记本中，导入工作正常： import rpy2
print(rpy2.__version__) 它返回3.1.0。但是，当我键入此import rpy2.robjects as robjects时，我得到以下错误： ValueError: The system "%s" is not supported. 有人知道这个错误是从哪里来的吗?知道如何解决它吗？
浏览 202提问于2019-09-17得票数 2
我有一个运行在kubernetes集群上的jupyterhub和kubespawner。据我所知，kubespawner是通过kubernetes在我的集群上启动dockers，这些dockers拥有自己的python环境和存储区。
对于某些用户，我正在尝试导入rpy2 (或者其他什么，这并不重要)，但是包并没有安装。
我的问题：
这些dockers从哪里得到他们的python环境(例如，有没有我可以在某个地方编辑的dockerfile )？
如何仅为这一个docker会话安装rpy2？
如何为该用户安装rpy2 (如果可能)？
如何为集线器上的每个人安装rpy2？
浏览 14提问于2017-03-14得票数 0
回答已采纳
我一直试图保持我的环境非冗余和清洁，所以我做了一个R环境，并删除了所有其他现有的R在我的电脑。
该环境称为r-conda，它位于：
/Users/jespinoz/anaconda/envs/r-conda/bin/R
我意识到我没有安装rpy2，并且通过conda安装它，它想安装一个新版本的R和所有我不想要的r-essentials，因为我已经有了一个完美的R环境。
我意识到可以为rpy2环境中关联的Python安装R conda：
source activate r-conda
pip install rpy2
source deactivate
但并不是所有的路都排列好了
如何使rpy2
浏览 3提问于2017-02-09得票数 6
1回答
无法使用Rpy2
、、
为什么我试图在Python中加载Rpy2，解释器会找到模块，但是当我尝试从它导入任何内容时，它会返回一个错误：
例如：
import rpy2 # No errors, although it does not print anything
但
import rpy2.robjects
返回以下错误：
/home/jimmy/.python_easy_install/rpy2-2.3.0beta1-py2.7-linux-x86_64.egg/rpy2/rinterface/_rinterface.so:未定义符号: Rf_translateCha rUTF8
我按照网站上的说明：
浏览 3提问于2012-11-06得票数 0
我正在尝试安装rpy2，并且我面临着一个常见的问题。不幸的是，我找到的所有解决方案都是针对win7的
我已经安装了Python2.7和R2.15。然后我在终端上写字
easy_install rpy2
或者，或者
pip install rpy2
相同的结果：
Tried to guess R's HOME but no R command in the PATH
我该怎么做？
浏览 1提问于2013-11-26得票数 10
我在Ubuntu20.04上使用Anaconda。我已经在虚拟环境(与基本环境不同)中安装了rpy2和conda install rpy2，当我想运行from rpy2.rinterface import RRuntimeError时，我得到了下一个错误：
from rpy2.rinterface import RRuntimeError
(/home/myuser/anaconda3/envs/myenvorment/lib/python3.7/site-packages/rpy2/rinterface.py)：无法从'rpy2.rinterface‘导入名称'RRunt
浏览 5提问于2020-04-24得票数 1
回答已采纳
我在MacOS 10.6.4上安装了EPD7.1的学术版。我通过调用`easy_install Rpy2安装了rpy2
Searching for rpy2
Reading http://pypi.python.org/simple/rpy2/
Reading http://rpy.sourceforge.net
Best match: rpy2 2.2.4
Downloading http://pypi.python.org/packages/source/r/rpy2/rpy2-2.2.4.tar.gz#md5=0192a3c05d8d97971e2bcf888944aff5
Proces
浏览 0提问于2011-12-05得票数 0
我想做什么？
在python中，我试图使用R.的VIF包的car函数来计算VIF (方差膨胀因子)，在导入car包时，我使用了rpy2的importr函数，如下所示。
from rpy2.robjects.packages import importr
car = importr('car')
，那么发生了什么？
但是，在运行Google代码之后，我得到了以下错误。
PackageNotInstalledError: The R package "car" is not installed.
据我所知，这是说包car没有安装。
，那么，我的问题
在Google中
浏览 12提问于2021-03-24得票数 1
回答已采纳
我是mac上的一个新手，我的python安装拒绝承认我的Mac上存在rpy2模块。它看起来只把它看作是Python2.6模块。如何使它在2.7中可见？我需要降级我的蟒蛇吗？如果是，怎么做？建议在RPy2网页()上使用Python2.6。谢谢!
mayumi@MAYUMI-iMac~:/ python --version
Python 2.7.6
mayumi@MAYUMI-iMac~:/ pip install rpy2
Requirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): rpy2 in /Library/Python/2.6/s
浏览 2提问于2013-11-15得票数 0
回答已采纳
我想使用RPy2从Python中的R包中调用函数。我使用conda安装了RPy2，并意识到它在conda中安装了一个新的R副本。我不想这样。我只想拥有和使用一个R，默认的一个在/usr/lib/R中。
怎么做？如何强制conda、Python和RPy2使用安装在/usr/lib/R中的默认R？
浏览 2提问于2018-07-23得票数 8
手动安装R和rpy2
安装成功，但出现上述错误。请帮帮我?
一些有用命令的输出：
>>> import rpy2
>>> rpy2.__path__
['/home/ashish/miniconda2/lib/python2.7/site-packages/rpy2-2.8.2-py2.7-linux-x86_64.egg/rpy2']
>>> import rpy2.robjects
cannot find system Renviron
/home/ashish/miniconda2/lib/python2.7/site
浏览 2提问于2016-09-06得票数 5
我目前正在调查的问题描述如下:我的计算机是Win10，我只在它上面安装了一个anaconda3.5.3。使用where python，我的计算机上只有一个python。我从uefi网站下载了一个rpy2python轮子文件，并使用pip install进行安装。 当我在C盘中导入rpy2的时候，它已经很好了，导入rpy2，导入rpy2.robjects都没问题。 但是当我在自己的项目中导入rpy2时，我只能先导入rpy2，当我导入rpy2.robjects时，程序会说找不到rpy2模块。 最后我发现的问题是，在我的项目中，我偶尔建立了一个rpy2.py文件，当我第一次导入rpy2时，它会自动
浏览 27提问于2021-02-07得票数 0
2回答
我想使用一些要求R版本3.4及以上的R包。我想通过rpy2 (2.8)访问python (3.6.1)中的这些包。
我安装了RVersion3.4，它位于/Library/Frameworks/R.framework/Resources中，但是，当我使用pip3 install rpy2安装并使用/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/bin/python3.6)中的python3.6.1作为我的解释器时，我得到了错误：
追溯(最近一次调用)：文件"/Users/vincentliu/PycharmProjects/magi
浏览 8提问于2017-06-29得票数 2
回答已采纳
1回答
我试图在python2.7.14上安装rpy2，在MacOSHighSiererVersion10.13.2上安装，但是当我尝试编写命令时
pip install rpy2
我得到以下输出：
Collecting rpy2
Using cached rpy2-2.9.2.tar.gz
Complete output from command python setup.py egg_info:
rpy2 is no longer supporting Python < 3. Consider using an older rpy2 release when using
浏览 1提问于2018-03-31得票数 4
回答已采纳
3回答
我正在尝试安装rpy2。我已经安装了R和rpy2。我尝试将rpy2.robjects作为robjects导入。
我得到以下错误：
Traceback (most recent call last):
File "<pyshell#3>", line 1, in <module>
import rpy2.robjects as robjects
File "C:\Python27\lib\site-packages\rpy2\robjects\__init__.py", line 15, in <module>
浏览 1提问于2014-02-04得票数 0
扫码
添加站长 进交流群
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
相关资讯
热门标签
云服务器
ICP备案
对象存储
腾讯会议
实时音视频活动推荐
腾讯云开发者
