生信星球 day 3 —— 橙子🍊
原创
安装一切顺利，愉快学习的一天，感谢生信星球，感恩豆豆花花，继续磕cp
安装操作记录
1. 进入镜像网站 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/
清华大学conda镜像网站
2. 查看linux服务器位数
uname -a选择对应的64位，.sh是脚本文件后缀；注：64-bit（x86_64）、32-bit(x86)
3. 选择相应的miniconda，右键复制链接网址
x86_64.sh
4. 将miniconda脚本安装至biosoft文件夹中
cd biosoft
wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh5. 安装miniconda
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh #记得用tab安装过程中会出现很多的版权信息，持续按回车跳过；当出现“Do you accept the license terms? yes|no”时，说明安装要开始了，linux系统能yes就yes，主打听话就好
图源生信星球
安装成功
6. 激活conda，注意空格
source ~/.bashrc
conda出现帮助文档，说明成功
来源生信星球
7. 添加镜像网站
使用北外的镜像
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes使用conda记录（linux的软件商店）
1. 查看当前服务器安装的所有软件
conda list2. 安装软件
conda install fastqc -y #-y是yes，即安装过程中conda问的问题，全部回答yes
fastqc --help出现帮助文档，说明安装成功
conda remove fastqc -y卸载软件
Conda环境
1. 查看当前环境
conda info --envs前面带*的就是当前激活的（base）
2. 新建环境
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
conda info --envs比如要处理转录组数据，先建立一个名叫rnaseq的conda环境，然后指定python版本是3，安装软件fastqc、trimmomatic；安装完确认一下。
3. 激活新环境
conda activate rna-seq相当于进入该环境，类似于cd 目录
conda deactivate退出当前环境
原创声明：本文系作者授权腾讯云开发者社区发表，未经许可，不得转载。
如有侵权，请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。
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