我对Spark/CosmosDB/Python非常陌生,所以我正在研究MS站点和GitHub的代码示例,同时尝试自己创建一些东西。经过与Spark连接器的长期斗争,我能够从CosmosDB收集中读取数据.现在,我想做相反的(插入),但发现了另一个障碍。下面是我要介绍的示例:写信给宇宙数据库部分。
我能够从宇宙阅读,并做一些数据,但我不能插入回宇宙。下面是我稍微修改过的代码:
%%configure
{ "name":"Spark-to-Cosmos_DB_Connector",
"jars": ["wasb:///example/jars/1.0.0/azure-cosmosdb-spark_2.2.0_2.11-1.1.0.jar", "wasb:///example/jars/1.0.0/azure-documentdb-1.14.0.jar", "wasb:///example/jars/1.0.0/azure-documentdb-rx-0.9.0-rc2.jar", "wasb:///example/jars/1.0.0/json-20140107.jar", "wasb:///example/jars/1.0.0/rxjava-1.3.0.jar", "wasb:///example/jars/1.0.0/rxnetty-0.4.20.jar"],
"conf": {
"spark.jars.excludes": "org.scala-lang:scala-reflect"
}
}
# Read Configuration
readConfig = {
"Endpoint" : "https://doctorwho.documents.azure.com:443/",
"Masterkey" : "SPSVkSfA7f6vMgMvnYdzc1MaWb65v4VQNcI2Tp1WfSP2vtgmAwGXEPcxoYra5QBHHyjDGYuHKSkguHIz1vvmWQ==",
"Database" : "DepartureDelays",
"preferredRegions" : "Central US;East US2",
"Collection" : "flights_pcoll",
"SamplingRatio" : "1.0",
"schema_samplesize" : "1000",
"query_pagesize" : "2147483647",
"query_custom" : "SELECT c.date, c.delay, c.distance, c.origin, c.destination FROM c WHERE c.origin = 'SEA'"
}
# Connect via azure-cosmosdb-spark to create Spark DataFrame
flights = spark.read.format("com.microsoft.azure.cosmosdb.spark").options(**readConfig).load()
flights.count()
# Write configuration
writeConfig = {
"Endpoint" : "https://doctorwho.documents.azure.com:443/",
"Masterkey" : "SPSVkSfA7f6vMgMvnYdzc1MaWb65v4VQNcI2Tp1WfSP2vtgmAwGXEPcxoYra5QBHHyjDGYuHKSkguHIz1vvmWQ==",
"Database" : "DepartureDelays",
"Collection" : "flights_pcoll",
"Upsert" : "true"
}
# Write to Cosmos DB from the flights DataFrame
flights.write.format("com.microsoft.azure.cosmosdb.spark").options(**writeConfig).save()
所以,当我尝试运行这个程序时,我得到:
An error occurred while calling o90.save.
: java.lang.UnsupportedOperationException: Writing in a non-empty collection.
快速搜索后,我尝试将模式(“追加”)添加到我的最后一行:
flights.write.format("com.microsoft.azure.cosmosdb.spark").mode("append").options(**writeConfig).save()
不幸的是,这给我留下了一个我无法理解的错误:
An error occurred while calling o127.save.
: org.apache.spark.SparkException: Job aborted due to stage failure: Task 2 in stage 4.0 failed 4 times, most recent failure: Lost task 2.3 in stage 4.0 (TID 90, wn2-MDMstr.zxmmgisclg5udfemnv0v3qva3e.ax.internal.cloudapp.net, executor 2): java.lang.NoClassDefFoundError: com/microsoft/azure/documentdb/bulkexecutor/DocumentBulkExecutor
下面是完整的堆栈跟踪:巴斯托箱错误
有人能帮我解决这个错误吗?在使用我自己的cosmosDB时,我也收到了完全相同的错误,而不是文档中的示例错误。
我用的是带PySpark3内核的木星笔记本。星火版本2.2,HDInsight集群3.6。
编辑--我不想坐等回复,所以我在Scala上尝试了同样的方法。你猜怎么着?相同的错误(或至少非常相似):Scala误差
下面是我的Scala代码:
%%configure
{ "name":"Spark-to-Cosmos_DB_Connector",
"jars": ["wasb:///example/jars/1.0.0/azure-cosmosdb-spark_2.2.0_2.11-1.1.0.jar", "wasb:///example/jars/1.0.0/azure-documentdb-1.14.0.jar", "wasb:///example/jars/1.0.0/azure-documentdb-rx-0.9.0-rc2.jar", "wasb:///example/jars/1.0.0/json-20140107.jar", "wasb:///example/jars/1.0.0/rxjava-1.3.0.jar", "wasb:///example/jars/1.0.0/rxnetty-0.4.20.jar"],
"conf": {
"spark.jars.excludes": "org.scala-lang:scala-reflect"
}
}
import org.apache.spark.sql.types._
import org.apache.spark.sql.Row
import org.apache.spark.sql.SaveMode
import com.microsoft.azure.cosmosdb.spark.schema._
import com.microsoft.azure.cosmosdb.spark._
import com.microsoft.azure.cosmosdb.spark.config.Config
val readConfig = Config(Map(
"Endpoint" -> "https://$my_cosmos_db.documents.azure.com:443/",
"Masterkey" -> "$my_key",
"Database" -> "test",
"PreferredRegions" -> "West Europe",
"Collection" -> "$my_collection",
"SamplingRatio" -> "1.0"
))
val docs = spark.read.cosmosDB(readConfig)
docs.show()
val writeConfig = Config(Map(
"Endpoint" -> "https://$my_cosmos_db.documents.azure.com:443/",
"Masterkey" -> "$my_key",
"Database" -> "test",
"PreferredRegions" -> "West Europe",
"Collection" -> "$my_collection",
"WritingBatchSize" -> "100"
))
val someData = Seq(
Row(8, "bat"),
Row(64, "mouse"),
Row(-27, "test_name")
)
val someSchema = List(
StructField("number", IntegerType, true),
StructField("name", StringType, true)
)
val someDF = spark.createDataFrame(
spark.sparkContext.parallelize(someData),
StructType(someSchema)
)
someDF.show()
someDF.write.mode(SaveMode.Append).cosmosDB(writeConfig)
也许这将有助于故障排除。
谢谢!
发布于 2018-04-06 04:54:53
对于使用python
时的第一个问题,请注意您使用的是doctorwho
Azure Cosmos DB集合。这是一个演示集合,在这里我们提供了只读键,但没有写键。因此,您正在接收的错误是缺乏对集合的写访问权限。
对于第二个问题,来自pastebin的错误看起来是一样的。说到这里,一些快速的观察:
azure-cosmosdb-spark
> 使用木星笔记本。发布于 2018-05-18 11:55:18
经过与微软工程师的沟通和我自己进行的几次测试后,我发现Spark连接器存在一些问题。简单地说,最好的连接器版本是1.0.0,日期为15-11-2017年11月(Spark2.1和2.2)。下面的链接到存储库是一些对我有用的解决方案/解决方案。你可以试着用它们来为你找到最好的解决方案。
1)如果您使用Spark2.1或2.2,请使用1.0.0版中的连接器(上面的链接)。在我撰写此答案时(18-5-2018年),连接器的最新版本为1.1.1,日期为23-2018年3月-2018年3月--当需要将数据帧写入Cosmos DB或试图计数从Cosmos读取的超过50k的文档数据帧(无SQL db的50k文档是什么?)。
2)如果使用Spark2.1,->木星将与1.0.0连接器一起工作。如果你使用星火2.2 ->不要使用木星笔记本-它有一些问题,使用外部软件包,特别是在星火2.2安装。请使用齐柏林飞艇笔记本代替(与1.0.0连接器)。一旦你打开齐柏林飞艇,在右上角点击用户,然后是解释器.转到Livy解释器设置,单击“编辑并添加包坐标:com.microsoft.azure:azure-cosmosdb-spark_2.2.0_2.11:1.0.0
”
保存并重新启动解释器。然后使用livy2解释器创建一个新的笔记本。请注意,在齐柏林飞艇的每个单元格中,您必须在第一行中添加%pyspark
魔术命令。运行第一个单元格将持续1-2分钟,因为启动整个应用程序。
3)您可以直接使用群集,而不是使用笔记本。在创建集群时,使用sshuser和密码,使用putty到您的集群中:
然后启动pyspark,附加uber-jar文件(您必须从存储库下载uber-jar文件,然后将其上传到连接到集群的blob存储。在我的案例中,文件位于名为示例的文件夹中(容器根目录中的第一级文件)。这里我还使用了1.0.0连接器。以下是命令:
pyspark --master yarn --jars wasb:///example/azure-cosmosdb-spark_2.2.0_2.11-1.0.0-uber.jar
当火花准备好后,你可以粘贴和运行你的命令,一切都应该正常工作。
如果您有什么问题或有什么不清楚的地方,请告诉我。
发布于 2018-05-18 12:03:15
由于我找不到合适的解决方案,所以我想分享一下我的工作配置。我的配置用于HDI 3.6和Spark2.1。使用朱庇特笔记本的PySpark脚本成功地读写了宇宙文档DB中的数据。
%%configure
{
"name":"Spark-to-Cosmos_DB_Connector",
"jars": ["wasb:///cosmos-libs/azure-cosmosdb-spark_2.1.0_2.11-1.0.0-uber.jar"],
"conf": {"spark.jars.excludes": "org.scala-lang:scala-reflect,org.apache.spark:spark-tags_2.11"}
}
读写信任、读取和保存命令与问题中所描述的完全相同。Write配置具有WritingBatchSize
描述的附加参数这里。优步jar我从这个位置下载的。
https://stackoverflow.com/questions/49669292
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