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R语言可视化

R语言可视化顺便以此夯实R语言基础操作

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可视化—好看的Venn图配色

数据可视化

今天看到一个好看的Venn配色，就扒下来用了，这里做简单记录。如下面的代码是分别从OMIM、Genecard、Disgnet数据库中导入某个疾病的靶点基因，现在我想把三个数据库中共有的靶点基因数量用Venn图呈现一下。

sheldor没耳朵

2024-11-13

1751

可视化—KEGG富集图中如何展示特定的通路

如果我们要展示特定通路，需要提前筛选，如我只关注炎症和免疫反应相关的通路（查资料且保证原始k k@result中有对应通路）。

sheldor没耳朵

2024-11-01

4153

可视化—Upset图绘制

我们在可视化集合之间关系的时候，常常会绘制韦恩图。但随着集合的增多，韦恩图显示的关系会越来越复杂，很难一眼看出其中的信息。这种情况下我们需要使用 UpSetR 包来反映集合间的关系。

sheldor没耳朵

2024-11-01

1590

Alluvial plot 冲积图绘制

数据可视化

Alluvial plot（冲积图）是一种流程图，最初设计用于展示网络结构随时间的变化。这种图表特别适用于展示数据中的分类如何从一个组别流向另一个组别，例如在分析不同子类型样本中的细胞如何在不同聚类中分布，或者在不同数据集中的细胞如何在不同聚类中分布的情况。

sheldor没耳朵

2024-09-19

1860

R语言可视化—饼图

r 语言数据可视化

今天开始进行R语言可视化的练习，主要参照的是文献《Preoperative immune landscape predisposes adverse outcome in hepatocellular carcinoma patients with liver transplantation》中的配图，尽量复现，顺便以此夯实R语言基础操作。今天复现文章中的Fig.1A，即饼图绘制。

sheldor没耳朵

2024-08-14

1810

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