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HUBU生信

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使用c#连接sqlserver

连接数据库是一个常见的操作，现在主流的关系数据库主要是sqlserver，mysql，Oracle，今天来聊一聊使用c#如何连接sqlserver。

戈贝尔光和热

2018-12-27

3.5K0

用shell脚本实现转录组测序中解压-比对-计算基因表达量一体化

这个脚本需要的软件有：hisat2，SRA-toolkit，samtools，htseq-count 有兴趣的同学可以自己去下载并安装好，记得要配置好环境变量！脚本所用到的参考基因组可以从hisat2官网下载，参考基因组注释文件可以从gencode数据库下载脚本如下 #!/bin/bash #把sra文件都存放在Sra文件夹里面 #参考基因组和注释文件都在hg19文件夹里面 #qiujunhui 1801963472@qq.com mkdir Fastq_out #创建一个存放SRA-toolkit解

戈贝尔光和热

2018-12-27

1.2K0

第二次RNA-seq实战总结（1）软件的准备

在经历了第一次做·RNA-seq的摸爬滚打之后，我大概对RNA-seq的流程和要使用的软件有了一些了解，并知道了它们的用法，于是便做了第二次的RNA-seq，然后想做一个总结笔记 1.原始数据下载软件Aspera Aspera用于下载sra原始数据将Aspera connect安装在Linux上代码如下

戈贝尔光和热

2018-12-27

9540

第二次RNA-seq实战总结(2)-数据下载并进行数据处理

原始数据来源于这篇文章https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE50177 这篇文章的数据适中，不仅可以用来做RNA-seq，后面我们

戈贝尔光和热

2018-12-27

1.2K0

第二次RNA-seq实战总结(3)-用DESeq2进行基因表达差异分析

DESeq2是一个用于分析基因表达差异的R包，具体操作姚在R语言中运行 1.R语言安装DESeq2

戈贝尔光和热

2018-12-27

4.2K0

一些生信工具的总结

2.ncbi中SRA的ftp下载链接为： ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/sra/， SRA数据库的格式为：

戈贝尔光和热

2018-12-27

9160

（python小白必看！）python爬虫详细讲解：静态单网页的内容爬取爬取对象：百度贴吧湖北大学吧

之前发了一篇关于文件处理小实验的文章，不知道大家有没有看呢？那篇文章真的很关键，之前我本以为没有爬取成功的原因是因为我的文件处理部分出现的问题，后来经过两个小测试之后才发现并不是我的文件处理出现了问题，而是提取url的过程中出现了问题。

戈贝尔光和热

2018-12-27

7560

python爬虫：利用函数封装爬取多个网页，并将爬取的信息保存在excel中（涉及编码和pandas库的使用）

在之前的文章中，我们已经爬取了单网页的湖北大学贴吧的信息。仔细想一想，单网页也才只有50条信息，如果你想找到女神在哪些时间段发了哪些帖子，这么点信息是远远不够的········（毕竟，女神并不会天天发帖，贴吧每天的发帖数量肯定远远不止50条），所以，为了老铁们的幸福生活/注：并不是为了我自己，因为我女神是我女朋友（不加这句话，怕是要跪搓衣板板）/现在有必要更深入的探讨一下怎么爬取多网页的信息。

戈贝尔光和热

2018-12-27

3.3K0

python爬虫：爬取58同城武汉地区商品房信息（最后碰到了58同城的反爬机制，吓得我不敢说话···）

今天外面天气有些古怪，女朋友明天又要考试，整整一天都在图书馆背书。遇到这种情况，像我这么懒的人，肯定就只有在宿舍玩游戏了。可是，，，玩游戏真的很无聊耶，我都玩腻了。所以，写完线代作业，只好又来了解一下数据结构和python。这波理由很充分，哈哈哈哈

戈贝尔光和热

2018-12-27

2K0

python：处理字符串的另一大神器——正则表达式，利用正则提取豆瓣电影排行榜信息

在之前的文章中，我们已经学会了使用bs4库中的BeautifulSoup，用于获取网页源代码中的标签。今天来一起学习一下正则表达式。

戈贝尔光和热

2018-12-27

9470

python爬虫：爬取笔趣小说网站首页所有的小说内容，并保存到本地(单线程爬取，似乎有点慢)

这几天在进行新的内容学习，并且在尝试使用据说是全宇宙唯一一款专门开发python的ide工具，叫做pycharm。

戈贝尔光和热

2018-12-27

2.2K0

python基础知识：类，对象，模块三者的区别

面向对象技术是目前流行的系统设计开发技术，它包括面向对象分析和面向对象程序设计。面向对象程序设计技术的提出，主要是为了解决传统程序设计方法--结构化程序设计所不能解决的代码重用问题。 "面向过程"(Procedure Oriented)是一种以过程为中心的编程思想。这些都是以什么正在发生为主要目标进行编程，不同于面向对象的是谁在受影响。与面向对象明显的不同就是封装、继承、类而python就是典型面向对象的编程语言。

戈贝尔光和热

2018-12-27

1.3K0

（更新）python爬虫实战：模拟登录12306（主要讲解验证码的突破）

刚刚刷完慕课，写完线代作业，现在是时候来一波验证码的突破测试了。在开始之前，我相信有很多朋友会问我：为什么要选择突破12306的验证码？大家应该都知道，12306每天的火车票的数量都是有限的，如果有很多人都能够通过爬虫来进行抢票，那么，让那些不懂爬虫的人应该怎么办呢？所有12306的反爬措施肯定是很到位的，既然反爬很强，那么也就是我们应该试着突破的对象。不因为别的，只是为了提高自己的技术，仅此而已。话不多说，下面进入正题。

戈贝尔光和热

2018-12-27

3.1K0

数据结构：链表的头插法和尾插法

在头节点的后面进行插入操作，后一个插入进来的值，在前一个插入进来的值与头节点之间。

戈贝尔光和热

2018-12-27

2.1K0

对希尔排序的一点理解

希尔排序实际上是一种特殊的插入排序，它是通过对直接插入排序的一些特点的利用，从而达到化简得效果。具体内容为：

戈贝尔光和热

2018-12-27

4020

插入排序算法：直接排序与折半排序

/直接插入排序/ void Straight_Insert_Sort(Sqlist &L) { int j; for (int i = 2; i <= L.length; i++) { L.R[0] = L.R[i]; for (j = i - 1; L.R[j].key > L.R[0].key; j--) { L.R[j + 1] = L.R[j]; } L.R[j + 1] = L.R[0]; } } 我们假定记录中的第一个关键字为有序，现在，需要将从第二个关键字开始的所有记录插入到表中。

戈贝尔光和热

2018-12-27

6260

对KMP算法中next数组的深入理解（这个算法真有点难懂）

首先了解kmp算法是干嘛的，它的作用是进行一个模式匹配，即在一个字符串中寻找是否存在某一个子串，比如在aabbccabc这个主串中是否存在abc这个模式串，并且输入他们匹配时，在主串的位置，如上例中，就应该输出的是“在第7个位置他们进行匹配”。这就是kmp算法的作用。

戈贝尔光和热

2018-12-27

4.1K0

利用栈写一算法解决特定序列识别判断问题

question：试写一算法，识别依次读入的一个以@为结束字符序列是否为形如“序列1&序列2”模式的字符序列。其中序列1和序列2均不含字符&，且序列2是序列1的逆序列。例如，‘a+b&b+a’是属于该模式的字符序列，而'1&3&3&1'则不满足该字符序列。

戈贝尔光和热

2018-12-27

7850

turtle作图：用turtle画一个小猪佩奇（详解！）

之前的一篇文章大致说了一下turtle这个模块的基本操作，不知道的朋友可以去看看，真的超级简单：python：turtle作图基础。

戈贝尔光和热

2018-12-27

3.7K0

shell脚本统计磁盘分区使用率

shell脚本统计磁盘分区使用 #!/bin/bash #统计磁盘分区使用率 rate=$( df -h | grep "/dev/sda1" | awk '{print $5}' | cut -d "%" -f1 ) #把分区使用率作为变量赋值给rate if [ $rate -le 80 ]; then echo"It's Ok!" else echo"Warning /dev/sda1 is over 80%!" 使用率可以自己修改全文结束,欢迎在评论区讨论~

戈贝尔光和热

2018-12-27

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