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数据科学(冷冻工厂)

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单细胞空间|在Seurat中对基于图像的空间数据进行分析(1)
在这篇指南[1]中,我们介绍了Seurat的一个新扩展功能,用以分析新型的空间解析数据,将重点介绍由不同成像技术生成的三个公开数据集。
数据科学工厂
2024-06-21
1070
实战|YOLOv10 自定义目标检测
由清华大学的研究团队基于 Ultralytics Python 包研发的 YOLOv10,通过优化模型结构并去除非极大值抑制(NMS)环节,提出了一种创新的实时目标检测技术。这些改进不仅实现了行业领先的检测性能,还降低了对计算资源的需求。大量实验结果证明,YOLOv10 在不同规模的模型上都能提供卓越的准确率和延迟之间的平衡。
数据科学工厂
2024-06-21
2450
Linux|如何安装和运行多个 glibc 库
GNU C 库 (glibc) 是 Linux 操作系统的基本组件,为各种应用程序提供基本功能。在某些情况下,您可能需要安装多个版本的 glibc 以支持不同的应用程序或确保与旧软件的兼容性。本指南[1]将向您展示如何使用简单的步骤在 Linux 系统上安装和管理多个 glibc 库。
数据科学工厂
2024-06-19
1120
Docker|了解容器镜像层(1)
容器非常神奇。它们允许简单的进程表现得像虚拟机。在这种优雅的底层是一组模式和实践,最终使一切运作起来。在设计的根本是层。层是存储和分发容器化文件系统内容的基本方式。这种设计既出人意料地简单,同时又非常强大。在今天的帖子[1]中,我将解释什么是层以及它们的概念性工作原理。
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2024-06-18
790
什么是大型语言模型 ?
2023年11月,我偶然间听闻了OpenAI的开发者大会,这个大会展示了人工智能领域的革命性进展,让我深深着迷。怀着对这一领域的浓厚兴趣,我加入了ChatGPT,并很快被激发了学习其背后的大型语言模型(LLMs)技术的热情。然而,像许多人一样,我对LLMs一窍不通,不知道如何入门。
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2024-06-18
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Python:从头创建 Asyncio (1)
现在,asyncio 已成为 Python 社区中的热门话题,并且名副其实——它提供了一种非常出色的处理 I/O 密集型程序的方法!在我探索 asyncio 的过程中,我起初并不太明白它的工作原理。但随着深入学习,我意识到 asyncio 实际上是在 Python 生成器的基础上增加了一层非常便利的封装。
数据科学工厂
2024-06-18
810
Signac|成年小鼠大脑 单细胞ATAC分析(2)
在本教程中,我们将探讨由10x Genomics公司提供的成年小鼠大脑细胞的单细胞ATAC-seq数据集。本教程中使用的所有相关文件均可在10x Genomics官方网站上获取。
数据科学工厂
2024-06-18
670
Docker|了解容器镜像层(2)
容器非常神奇。它们允许简单的进程表现得像虚拟机。在这种优雅的底层是一组模式和实践,最终使一切运作起来。在设计的根本是层。层是存储和分发容器化文件系统内容的基本方式。这种设计既出人意料地简单,同时又非常强大。在今天的帖子[1]中,我将解释什么是层以及它们的概念性工作原理。
数据科学工厂
2024-06-18
570
深度学习长文|使用 JAX 进行 AI 模型训练
在人工智能模型的开发旅程中,选择正确的机器学习开发框架是一项至关重要的决策。历史上,众多库都曾竞相争夺“人工智能开发者首选框架”这一令人垂涎的称号。(你是否还记得 Caffe 和 Theano?)在过去的几年里,TensorFlow 以其对高效率、基于图的计算的重视,似乎已经成为了领头羊(这是根据作者对学术论文提及次数和社区支持力度的观察得出的结论)。而在近十年的转折点上,PyTorch 以其对用户友好的 Python 风格接口的强调,似乎已经稳坐了霸主之位。但是,近年来,一个新兴的竞争者迅速崛起,其受欢迎程度已经到了不容忽视的地步。JAX 以其对提升人工智能模型训练和推理性能的追求,同时不牺牲用户体验,正逐步向顶尖位置发起挑战。
数据科学工厂
2024-06-18
1220
Python:从头创建 Asyncio (2)
现在,asyncio 已成为 Python 社区中的热门话题,并且名副其实——它提供了一种非常出色的处理 I/O 密集型程序的方法!在我探索 asyncio 的过程中,我起初并不太明白它的工作原理。但随着深入学习,我意识到 asyncio 实际上是在 Python 生成器的基础上增加了一层非常便利的封装。
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2024-06-18
770
单细胞|RNA-seq & ATAC-seq 联合分析
本文[1]将介绍如何利用Signac和Seurat这两个工具,对一个同时记录了DNA可接触性和基因表达的单细胞数据集进行综合分析。我们将以一个公开的10x Genomics Multiome数据集为例,该数据集针对的是人体的外周血单核细胞。
数据科学工厂
2024-06-18
990
Python网络数据抓取(9):XPath
XPath 是一种用于从 XML 文档中选取特定节点的查询语言。如果你对 XML 文档不太熟悉,XPath 可以帮你完成网页抓取的所有工作。
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2024-06-18
970
Signac|成年小鼠大脑 单细胞ATAC分析(1)
在本教程中,我们将探讨由10x Genomics公司提供的成年小鼠大脑细胞的单细胞ATAC-seq数据集。本教程中使用的所有相关文件均可在10x Genomics官方网站上获取。
数据科学工厂
2024-06-07
830
Linux|如何安装 Java
Java是最受欢迎的编程语言之一,JVM(Java的虚拟机)是运行Java应用程序的运行时环境。这两个平台是许多流行软件所需的,包括Tomcat,Jetty,Cassandra,Glassfish和Jenkins。
数据科学工厂
2024-06-06
1280
Python网络数据抓取(8):正则表达式
正则表达式是查找文本模式的强大工具。它们就像在 Word 文档上使用 Ctrl-F 一样,但功能比它们强大得多。
数据科学工厂
2024-06-06
960
单细胞分析(Signac): PBMC scATAC-seq 基因组区域可视化
在本教学指南中,我们将探讨由10x Genomics公司提供的人类外周血单核细胞(PBMCs)的单细胞ATAC-seq数据集。
数据科学工厂
2024-06-06
620
单细胞分析(Signac): PBMC scATAC-seq 整合
在本教学指南中,我们将探讨由10x Genomics公司提供的人类外周血单核细胞(PBMCs)的单细胞ATAC-seq数据集。
数据科学工厂
2024-05-27
1600
单细胞分析(Signac): PBMC scATAC-seq 聚类
在本教学指南中,我们将探讨由10x Genomics公司提供的人类外周血单核细胞(PBMCs)的单细胞ATAC-seq数据集。
数据科学工厂
2024-05-27
970
单细胞分析(Signac): PBMC scATAC-seq 质控
在本教学指南中,我们将探讨由10x Genomics公司提供的人类外周血单核细胞(PBMCs)的单细胞ATAC-seq数据集。本节中所涉及的所有文件均可在10x Genomics的官方网站上找到:
数据科学工厂
2024-05-27
1950
Linux|如何在 awk 中使用流控制语句
当您从 Awk 系列一开始回顾我们迄今为止介绍的所有 Awk 示例时,您会注意到各个示例中的所有命令都是按顺序执行的,即一个接一个。但在某些情况下,我们可能希望根据某些条件运行一些文本过滤操作,这就是流程控制语句的方法。
数据科学工厂
2024-05-27
670
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