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DNA突变频谱不应该是仅限于肿瘤somatic的SNV

肿瘤DNA测序(比如WES或者WGS),通常是需要取病人的正常组织或者血液,以及肿瘤组织,两个测序结果对比才能定位到真正的肿瘤somatic的SNV。...而且对成百上千的somatic的SNV通常是需要去看突变频谱,比如2020的文章 :《Multiomics profiling of primary lung cancers and distant metastases...signature占比 : 病人测序结果里面的不同signature占比 而且病人既然是有分组的, primary tumors and metastases ,这两个分组的就可以把突变分成3类:...写在文末 我在《生信技能树》,《生信菜鸟团》,《单细胞天地》的大量推文教程里面共享的代码都是复制粘贴即可使用的, 有任何疑问欢迎留言讨论,也可以发邮件给我,详细描述你遇到的困难的前因后果给我,我的邮箱地址是...jmzeng1314@163.com 如果你确实觉得我的教程对你的科研课题有帮助,让你茅塞顿开,或者说你的课题大量使用我的技能,烦请日后在发表自己的成果的时候,加上一个简短的致谢,如下所示: We thank

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    Java 的日期 API 真烂

    记得在我刚学 Java 的时候,真是搞不清楚 Date 和 Calendar 这两个类,后来我渐渐知道,原来不能全怪我啊,Java 日期 API 之烂是公认的(不妨参见这篇文章,Tiago Fernandez...做过一个投票,就是要选举最烂的 Java API,结果 Java 日期 API 排行第二,仅次于臭名远扬的 EJB2,嘿嘿)。...那么烂的日期 API 了,于是就有了 JSR-310(感兴趣的请移步),官方的描述叫做“This JSR will provide a new and improved date and time API...,目前的阶段还在“Early Draft Review 2”,有得等。 JSR-310 将解决许多现有 Java 日期 API 的设计问题。...除了新的日期 API,再比如 JCache(JSR-107),你知道它抄了多少 EhCache 的东西么…… 文章未经特殊标明皆为本人原创,未经许可不得用于任何商业用途,转载请保持完整性并注明来源链接

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    用laravel dingoapi创建简单的api

    请避免使用版本号作为你的前缀或子域,因为版本控制是通过 header 头 Accept 处理的。 子域名API_DOMAIN 比如可以用api.z5w.net来做api的调用地址。...如果已经设置了前缀prefix,则domain一般设为null 版本号version 这个版本号是你的 API 的默认版本号,并且会在一些未提供版本号的情况下作为回调的默认值使用。...在生成 API 文档时也会使用这个版本号作为默认值。 名称Name 你的 API 的名称只会在你使用 API Blueprint 命令生成文档的时候使用。...条件请求CONDITIONAL_REQUEST 『条件请求』默认为开启状态,这有利于客户端的缓存机制在可能的情况下缓存 API 请求。.../helloworld,看看是不是出现了api的json数据呢?

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    Laravel中优雅的验证日期需要大于今天

    我们有时会碰到一个场景,比如买车票,需要进行查询车票剩余,这时候需要一个日期范围,开始日期必须大于等于今天,结束日期必须大于等于开始日期。...正确的方法是这样的 Laravel 重写父类的prepareForValidation方法,之后再测试 Laravel 这时候得到想要的验证了 分析一下过程 能通过依赖注入实例化我们想要的对象...,这一切都得感谢Laravel的IoC容器 容器每次解析完新对象之后,总是会释放一些绑定的事件 Laravel 这些事件很多都是通过服务提供者来绑定的,我们直接查看config/app.php...里有关表单验证的服务提供者 Laravel Laravel Laravel 我们可以看到当实现ValidatesWhenResolved对象的类在解析之后会自动调用...curr_date,我们来看看新建验证实例便知道答案 Laravel Laravel 这里有一个地方导致我们的问题出现,就是先调用了$this->validationData

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    Java 8 的时间日期 API

    上一篇文章『Java 的时间日期 API』中,我们学习了由 Date、Calendar,DateFormat 等组成的「传统时间日期 API」,但是传统的处理接口设计并不是很友好,不易使用。...终于,Java 8 借鉴第三方优秀开源库 Joda-time,重新设计了一套 API。 那么本篇文章就来简单学习一下新式的时间日期处理接口。...处理日期的 LocalDate 不同于 Calendar 既能处理日期又能处理时间,java.time 的新式 API 分离开日期和时间,用单独的类进行处理。...有关 ZonedDateTime 的其他日期时间的处理方法和 LocalDateTime 是一样的,因为 ZonedDateTime 是直接封装了一个 LocalDateTime 实例对象,所以所有相关日期时间的操作都会间接的调用...格式化日期时间 Java 8 的新式日期时间 API 中,DateTimeFormatter 作为格式化日期时间的主要类,它与之前的 DateFormat 类最大的不同就在于它是线程安全的,其他的使用上的操作基本类似

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    Java 中的时间日期 API

    其实 Java 里的日期时间的相关 API 一直为世猿诟病,不仅在于它设计分上工不明确,往往一个类既能处理日期又能处理时间,很混乱,还在于某些年月日期的数值映射存储反人类,例如:0 对应月份一月,11...往往我们得到某个年月值还需要再做相应的运算才能得到准确的年月日信息,直到我们的 Java 8 ,借鉴了第三方开源库 Joda-Time 的优秀设计,重新设计了一个日期时间 API,相比之前,可以说好用百倍...,相关 API 接口全部位于包 java.time 下。...fastTime 属性存储的就是时刻所对应的毫秒数,两个构造器还是很简单,如果调用的是无参构造器,那么虚拟机将以系统当前的时刻值对 fastTime 进行赋值。...限于篇幅,我们下篇将对比 Java 8 的新式日期时间 API,你会发现它更加优雅的设计和简单的操作性。

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    java8-新的日期API

    背景 java的日期和时间API设计不理想,java8引入新的时间和日期API就是为了解决这个问题。...老的日期API的核心类 缺点 Date 月从0开始,年最小从1900年开始,没有时区的概念 Calendar 月从0开始 DateFormat 线程不安全 其它 同时存在Date和Calendar难以选择...,取的日期,然后调用ofEpochday(long epochDay)来初始化日期 from类1个 from(TemporalAccessor temporal) 通过一个Temporal对象来初始化日期...,Calendar有很多设计缺陷,自己设计的api中应该退出历史舞台。...新版的日期API中日期都是不可变的,并且是线程安全的;新版的日期API中区别人和机器的方式标识时间;你可以灵活的改变日期,或者通过更灵活的TemporalAdjuster来操作日期 你可以相对于某个时区和位置与格林尼治时间的偏差的方式来小时时区

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    JDBC日期和新的JDK8 日期API转换问题

    网上的Java博客,凡是有几年的,而且有关于日期的地方,基本上用的都是java.util.Date这个类。...如果有细心的同学看一下Eclipse或者IDEA的代码提示,就会发现java.util.Date这个类几乎所有方法都被标记为了过时的。实际上这个类也已经过时了。...在新的JDK8中引入了一组全新的日期时间类,在java.time包下,具体用法我就不说了。这些新类包含了很多新方法,功能比旧类更强大、更完善。所以现在我们的新程序,都应该使用这些新的API。...()); 直到今天我看到爆栈上有个问题正好是问这的,只有一个回答,但是完美的解决了我和这位题主的疑问:为什么Java8不补齐缺失的JDBC处理方法。...java.sql.Date这个类已经做出了一些改变,我们如果查看它的Java Doc话就会发现它在JDK1.8中增加了几个方法,来适应新API和自己的转换,这两个方法是 toLocalDate()和valueOf

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    优化Shopify API的调用性能

    Shopify API是开发者与Shopify平台交互的桥梁,合理利用API能大大提升应用的性能和效率。下面就来详细介绍一下如何优化Shopify API的调用性能。...异步处理: 将Webhooks触发的任务异步处理,避免阻塞主流程。4.错误处理与重试错误处理: 对API调用失败的情况进行捕获和处理,避免程序崩溃。...5.考虑Shopify的限制API调用频率限制: 了解Shopify API的调用频率限制,避免超过限制。请求大小限制: 注意单个请求的大小限制,避免数据过大导致请求失败。...总结来说,优化Shopify API调用性能的关键在于:规划好你的API请求:明确你需要获取哪些数据,并一次性获取尽可能多的数据。合理利用缓存:将经常访问的数据缓存起来,减少对API的请求。...错误处理:对API调用错误进行处理,保证应用的稳定性。通过这些优化,你可以构建出更快速、更稳定的Shopify应用。

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    基于curl 的zabbix API调用

    看抓取的数据结构完全可以给他导到xml中; zabbix API Object specifications without the 'draft' mark are stable and can be...used for production purposes curl模拟调用zabbix JSON-RPC格式 curl -i -X POST -H 'Content-Type: application.../json' -d ‘api json语句’ zabbix-server--即我的测试机http://192.168.1.222/zabbix/api_jsonrpc.php; 来个模板吧,你copy...; '  你的zabbix服务器api 的url Examples,都是Ruiy根据官网及相关文档改写亲测成功的,你仅需的就是修改下你的zabbix服务器API的URL即可; 1,获取监控主机信息...关于json的相关格式语法本人没接触也不懂,需要的同仁自己查阅; 相关的测试我也就不一一列举了,下面我把zabbix-API所以的method reference给各位同仁罗列下,参考自zabbix Official

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