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2021-08-16

用到了kmeans和pca。 之前都是网上找的实现代码,用起来比较麻烦,代码也多。 后来发现用sklearn就有现成的pca和kmeans。 pca的代码和主要参数解释。...[原文链接:https://blog.csdn.net/qq_20135597/article/details/95247381] sklearn.decomposition.PCA(n_components...如果 n_components设为 ‘mle’ ,svd_solver 设为 ‘full’, 则使用Minka’s MLE方法来估计降维后特征的维度。...如果n_components设为大于0小于1的小数且svd_solver设为’full’,则自动根据样本特征方差来决定降维到的维度数,这里n_components表示主成分的方差和所占的最小比例阈值。...当输入数据大于500*500且提取的主成分小于80%,则使用更有效率的’randomized’方法,否则将使用精确的SVD方法,即’full’。

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    用scikit-learn学习主成分分析(PCA)

    最常用的PCA类就是sklearn.decomposition.PCA,我们下面主要也会讲解基于这个类的使用的方法。     ...,代价就是PCA降维的精确度可能会降低。...randomized一般适用于数据量大,数据维度多同时主成分数目比例又较低的PCA降维,它使用了一些加快SVD的随机算法。 full则是传统意义上的SVD,使用了scipy库对应的实现。...默认是auto,即PCA类会自己去在前面讲到的三种算法里面去权衡,选择一个合适的SVD算法来降维。一般来说,使用默认值就够了。     除了这些输入参数外,有两个PCA类的成员值得关注。...最后我们看看让MLE算法自己选择降维维度的效果,代码如下: pca = PCA(n_components='mle') pca.fit(X) print pca.explained_variance_ratio

    1.2K20

    机器学习(28)【降维】之sklearn中PCA库讲解与实战

    ,代价就是PCA降维的精确度可能会降低。...sklearn中PCA参数介绍 下面主要基于sklearn.decomposition.PCA来讲解如何使用scikit-learn进行PCA降维。...randomized一般适用于数据量大,数据维度多同时主成分数目比例又较低的PCA降维,它使用了一些加快SVD的随机算法。 full则是传统意义上的SVD,使用了scipy库对应的实现。...默认是auto,即PCA类会自己去在前面讲到的三种算法里面去权衡,选择一个合适的SVD算法来降维。一般来说,使用默认值就够了。 除了这些输入参数外,有两个PCA类的参数值得关注。...最后我们看看让MLE算法自己选择降维维度的效果,代码如下: pca = PCA(n_components='mle') pca.fit(X)print pca.explained_variance_ratio_print

    2.2K60

    原创 | 一文读懂主成分分析

    在线性回归模型中,一般使用特征选择。 2.3 PCA算法数学步骤 基于上述的总体理论讲述,接下来具体阐述“数学推导”中的算法步骤和过程。...数学大神Minka, T.P.找出了让PCA用最大似然估计自选超参数的方法,输入n_components=‘mle’作为n_components的参数输入,就可以调用这种方法。...输入[0,1]之间的浮点数,并且让参数svd_solver =‘full’,表示希望降维后的总解释性方差占比大于n_components指定的百分比,即是说,希望保留百分之多少的信息量。...比如说,如果我们希望保留97%的信息量,就可以输入n_components=0.98,PCA会自动选出能够让保留的信息量超过97%的特征数量。...在sklearn中,矩阵U和Σ虽然会被计算出来(同样也是一种比起PCA来说简化非常多的数学过程,不产生协方差矩阵),但完全不会被用到,也无法调取查看或者使用,因此我们可以认为,U和Σ在fit()之后就被遗弃了

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    PCA详解

    \lambda_1比较大,所以使用c_1作为基 sklearn中PCA的使用 重要的参数是n_components,降维之后需要保留的特征数量,取值在[0, min(X.shape)]。...结果表明选择2个或者3个特征是比较好的 基于极大似然估计MLE的PCA n_components中不仅可以填写数字,还可以通过极大似然估计MLE来自选超参数 ?...按照指定的信息占比选择参数 输入0-1之间的浮点数,并且配合参数svd_solver="full",表示希望降维后的可解释方差占原始数据的信息比例。...pca_f = PCA(n_components=0.97, svd_solver="full") pca_f = pca_f.fit(X) X_f = pca_f.transform(X) # 返回降维后的特征矩阵...# 不同的占比 pca_f = PCA(n_components=0.99, svd_solver="full") pca_f = pca_f.fit(X) X_f = pca_f.transform

    1.6K10

    快速入门Python机器学习(30)

    > F2的方差> … >Fp的方差 称为第一主成分F1,为第二主成分F2,…第p主成分Fp 12.2.2类参数、属性和方法 类 class sklearn.decomposition.PCA(n_components...当n_components设置为'mle'或介于0和1之间的数字(使用svd_solver=='full')时,该数字根据输入数据进行估计。...否则它等于参数n_components,如果n_components为None,则等于n_features和n_samples的较小值。 n_features_ int 训练数据中的特征数。...n_samples_ int 训练数据中的样本数。 noise_variance_ float 根据Tipping和Bishop 1999的概率PCA模型估计噪声协方差。...("主成分提取后的数据形态:",X_pca.shape) myutil.draw_Heat_chart(pca,mydata,title,'主成分提取(PCA)') #使用主成分绘制热度图

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    图解机器学习 | 降维算法详解

    来给大家演示PCA算法应用(相关知识速查可以查看ShowMeAI文章AI建模工具速查|Scikit-learn使用指南),sklearn工具库中与PCA相关的类都在sklearn.decomposition...1)参数介绍 sklearn中的PCA类使用简单,基本无需调参,一般只需要指定需要降维到的维度,或者降维后的主成分的方差和占原始维度所有特征方差和的比例阈值就可以了。...下面是sklearn.decomposition.PCA的主要参数介绍: n_components:PCA降维后的特征维度数目。 whiten:是否进行白化。...svd_solver:奇异值分解SVD的方法,有4个可以选择的值:{‘auto’,‘full’,‘arpack’,‘randomized’}。...最后我们看看让MLE算法自己选择降维维度的效果,代码如下: pca = PCA(n_components= 'mle',svd_solver='full') pca.fit(X) print(pca.explained_variance_ratio

    1.2K62

    (数据科学学习手札22)主成分分析法在Python与R中的基本功能实现

    ,可以说它们几乎正交,说明主成分的结果非常有效: Python 我们使用sklearn.decomposition中的PCA来实现主成分降维,其主要参数如下: n_components:这个参数可以帮我们指定希望...当然,我们还可以将参数设置为"mle", 此时PCA类会用MLE算法根据特征的方差分布情况自己去选择一定数量的主成分特征来降维。...randomized一般适用于数据量大,数据维度多同时主成分数目比例又较低的PCA降维,它使用了一些加快SVD的随机算法。 full则是传统意义上的SVD,使用了scipy库对应的实现。...arpack和randomized的适用场景类似,区别是randomized使用的是scikit-learn自己的SVD实现,而arpack直接使用了scipy库的sparse SVD实现。...默认是auto,即PCA类会自己去在前面讲到的三种算法里面去权衡,选择一个合适的SVD算法来降维。一般来说,使用默认值就够了。   除了这些输入参数外,有两个PCA类的输出值得关注。

    1.7K100

    使用Python进行数据降维|线性降维

    直观地好处是维度降低了,便于计算和可视化,其深层次的意义在于有效信息的提取综合及无用信息的摈弃,并且数据降维保留了原始数据的信息,我们就可以用降维的数据进行机器学习模型的训练和预测,但将有效提高训练和预测的时间与效率...降维方法分为线性和非线性降维,非线性降维又分为基于核函数和基于特征值的方法(流形学习),代表算法有 线性降维方法:PCA ICA LDA LFA 基于核的非线性降维方法KPCA KFDA 流形学习...但读者应具有一定的统计学、代数学、机器学习的基础。 主成分分析PCA 主成分分析(Principal Component Analysis),是一种常用的数据降维方法。...#降维 >>> pca = PCA(n_components=1, svd_solver='arpack') >>> pca.fit(X) PCA(n_components=1, svd_solver=...与PCA比较 ICA寻找的是最能使数据的相互独立的方向,而PCA仅要求方向是不相关的 PCA认为主元之间彼此正交,样本呈高斯分布;ICA则不要求样本呈高斯分布 相关Python代码 sklearn.decomposition.FastICA

    1.7K10

    高维数据图表(2)——PCA的深入探究

    PCA,也就是主成分分析方法,是一种使用最为广泛的数据降维算法。鉴于它的广泛适用性,值得写一篇文章来探讨PCA的应用。...主要内容有: (1)使用PCA对数据的要求 (2)Sklearn中PCA的关键参数设置 (3)Sklearn中PCA的几个重要属性 (4)如何利用PCA数据绘制CCA图 本次实例使用的数据为云南省各市16...2 sklearn的PCA关键参数设置 上一篇文章我们最后初步使用了PCA,在这里讨论一下它的语法: from sklearn.decomposition import PCA pca = PCA(n_components...=None, copy=True, whiten=False, svd_solver="randomized") pca_data = pca.fit_transform(要PCA的数据) 一般而言,我们只需要调整...whiten:白化,使得每个特征具有相同的方差。 svd_solver:代表使用随机方法找到第一个主成分(这种方法通常较快) 再强调一下:一般我们只需要调节第一个参数即可,只调节第一个参数!!

    1.1K40

    利用Python sklearn的SVM对AT&T人脸数据进行人脸识别

    使用Python完成,主要参考文献【4】,其中遇到不懂的功能函数一个一个的查官方文档和相关资料。其中包含了使用Python画图,遍历文件,读取图片,PCA降维,SVM,交叉验证等知识。...降维 获得原始数据后,对数据使用PCA降维处理,其中设定降维后的特征数目时遇到了问题,参考资料中n_components设定为150,但是该数据集采用大的该值后识别率会非常低,即虽然可以百分百识别出训练集人脸...注意,若维数较高,SVM训练会非常慢并且占用很高内存,维数小反而取得了很好的结果和效率。 另外,例子中是分别对测试集与训练集使用PCA降维,即PCA fit时只用了训练集。...2 pca = PCA(n_components = n_components, svd_solver='auto', 3 whiten=True).fit(all_data_set...45 pca = PCA(n_components = n_components, svd_solver='auto', 46 whiten=True).fit(all_data_set

    1.7K80

    轻松玩转 Scikit-Learn 系列 —— 你居然不知道 PCA ?

    而这个学习的过程,当然学习的就是各个训练样本的差异,而我们所希望的就是所有训练样本的差异性组合起来能够准确地表示整个模型,这样模型会具有更好的泛化能力。...PCA 在降维时,就是着重保留这种差异性,使得数据在降维后,数据的差异性损失最小化。PCA 常使用的差异性指标是方差。...在上面的代码中,我们创建了一个符合线性趋势带有噪音的数据集,然后使用 PCA 将这个数据集降维,为了便于在坐标系中可视化,使用 scikit-learn 中 PCA 模型的 inverse_transform...但是,如果数据本来就是线性的,只是因为测量设备精度问题,测量方法原理问题,或者测量人员的马虎大意导致了数据的波动,那么使用PCA处理数据可以使建模更精准,因此 PCA 也广泛用于数据降噪。...fit() 方法的数据会被复写; svd_solver:用于选择奇异值分解的方法,默认 svd_solver=’auto’; tol:表示由 svd_solver == ‘arpack’ 计算奇异值的容差

    1K30

    有关如何使用特征提取技术减少数据集维度的端到端指南

    在PCA中,原始数据被投影到一组正交轴中,并且每个轴都按重要性顺序排序。 PCA是一种无监督的学习算法,因此它并不关心数据标签,而只关心变化。在某些情况下,这可能导致数据分类错误。...from sklearn.decomposition import PCA pca = PCA(n_components=2)X_pca = pca.fit_transform(X)PCA_df = pd.DataFrame...pca = PCA(n_components=3,svd_solver='full')X_pca = pca.fit_transform(X)print(pca.explained_variance_)...这是一个不错的选择,因为在较低维度的空间中投影数据时,最大化每个类别的均值之间的距离会导致更好的分类结果(由于减少了不同类别之间的重叠)。...使用LDA时,假设输入数据遵循高斯分布(在这种情况下),因此将LDA应用于非高斯数据可能会导致较差的分类结果。 在此示例中,将运行LDA将数据集简化为一个特征,测试其准确性并绘制结果。

    1.4K20

    特征工程-主成分分析PCA

    样品2新特征: \frac{4}{\sqrt{17}}×5+\frac{1}{\sqrt{17}}×3≈5.78 python代码 ---- 使用sklearn库中的PCA()函数进行主成分分析。...可以使用参数n_components定义需要保留的特征维数,降到多少维,默认1,可以置为‘mle’自适应取值。 可以使用fit_transform方法训练数据,同时返回降维后结果。...(data) print("协方差矩阵:\n", data.cov()) pca = PCA(n_components='mle') result = pca.fit_transform(data)...print("各样本主成分的贡献率为:\n", pca.explained_variance_ratio_) print("降维后:\n", result) 此处调用函数结果降维为-2.06和2.06...,与我们手算的1.46和5.78不同,原因是函数还对数据进行了标准化处理,使得降维数据的期望为0,可以看出2.06与-2.06的差,与5.78和1.46的差近似。

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    机器学习-主成分分析PCA降维

    样品2新特征: \frac{4}{\sqrt{17}}×5+\frac{1}{\sqrt{17}}×3≈5.78 python代码 ---- 使用sklearn库中的PCA()函数进行主成分分析。...可以使用参数n_components定义需要保留的特征维数,降到多少维,默认1,可以置为‘mle’自适应取值。 可以使用fit_transform方法训练数据,同时返回降维后结果。...(data) print("协方差矩阵:\n", data.cov()) pca = PCA(n_components='mle') result = pca.fit_transform(data)...print("各样本主成分的贡献率为:\n", pca.explained_variance_ratio_) print("降维后:\n", result) 此处调用函数结果降维为-2.06和2.06...,与我们手算的1.46和5.78不同,原因是函数还对数据进行了标准化处理,使得降维数据的期望为0,可以看出2.06与-2.06的差,与5.78和1.46的差近似。

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