这个教程是asreml在基因组选择和分子育种中的应用, 下面是我的读书笔记....简介
这篇文档的主要目标是介绍ASReml在基因组分析中的实现方法, 它假定读者有一定的统计基础....在本文档中, 不对统计和模型做过多的介绍.
1, 单标记分析
示例数据:
ID,effect,SNP_1,SNP_100,SNP_1000,SNP_101,SNP_102,SNP_103,SNP_104...Bayes B的方法在asreml中实现:
?
marker文件格式:
文件命名为*.mkr
第一列为基因型ID
第一行为SNP ID
mkr中不能有缺失值
?...FBA k # 定义asreml是否使用GBLUP(省略, 为GBLUP, 标记方差一致, k=0), k在Fast BayesA中是标记的方差分布符合逆卡方(inverse Chi-square)分布的参数