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工具 | 如何在Python中调用R语言包?

加载rpy2与rpy2包的内容 rpy2,可以实现使用python读取R的对象、调用R的方法以及Python与R数据结构转换等。 (1)加载rpy2 ? rpy2包里面包含下面的内容: ?...如何使用ry2 (1)在Python中加载R软件包 需要用到robjects中的packages里面的importr函数,我们以R中的stats包和ggplot2包为例,ggplot2是R中超级强大的绘图包...当然,需要先在R软件中加载这两个包。 ? (2)访问R实例 需要用到robjects.r,它是在Python中的嵌入式R进程,把r当作从python走向R的通道来看就可以了。...总结 本文主要介绍了利用rpy2包在Python中访问R语言包和函数,其中最重要的子包是robjects,可以生成R中的数据结构;最重要的实例是rojects.r(' '),可以通过三种方式访问R中的数据和函数...,甚至可以利用其在Python中进行R编程;最重要的函数是importr(' '),它可以加载所有R语言中安装的包。

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在Python中调用Java扩展包HanLP测试记录

最近在研究中文分词及自然语言相关的内容,关注到JAVA环境下的HanLP,HanLP是一个致力于向生产环境普及NLP技术的开源Java工具包,支持中文分词(N-最短路分词、CRF分词、索引分词、用户自定义词典...封面.jpg 由于自己才疏学浅,对JAVA方面了解不多,所以打算在Python环%2, line 5, in startJVM(getDefaultJVMPath()) File “...31 很有可能是没有配置JDK的环境变量或安装的JDK的位数与Python的位数不一致。...(2)也可以使用自定义的HanLP——HanLP由3部分组成:类库hanlp.jar包、模型data包、配置文件hanlp.properties,请前往项目主页下载最新版:github.com/hankcs...Python调用 以下是我的测试:(使用的是Python,与Python3 相比多了 .toString() 这一操作) 配图.JPG

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    在VSCode中调用Jupyterlab和R

    如果你对下面的教程比较迷茫,那么你可以先行学习Linux教程:十小时学会Linux生信Linux及服务器使用技巧可咨询客服微信[Biomamba_kefu]咨询有root权限的服务器02在VScode中使用...install.packages("BiocManager")BiocManager::install(version = "3.18")install.packages("tidyverse")然而不知道为何,Linux下R包安装经常出现问题...然后是代码补全:当我们把鼠标放到函数上时,还能看到帮助文档:如果需要直接在jupyter中安装R的内核,可以直接在终端打开的R中进行操作:install.packages('IRkernel')IRkernel...总结总的来说,R语言的IDE中,Rstudio是最为常用和流行的。而JupyterLab则更多地被应用在Python数据分析领域。...在本文中,我们介绍了如何通过安装插件,在VS Code中远程连接服务器,并愉快地开始编写Python和R代码。

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    在C++中调用Python

    但是C++的一个缺点是比较难找到很好的轮子,这也是很多人专用Python的一个重要原因。这篇文章我们要介绍的是一个比较特殊的场景——用C++的代码去调用Python函数中实现的一些功能。...而另一种工作方式:通过Python来调用一些C++或者Fortran中实现的高性能函数,可以参考这一篇博客。...VS Code配置 这里我们使用的IDE是VS Code,但是上述提到的几个路径,在VS Code中默认是不被包含的,因此在代码编辑的过程中在include Python.h>这一步就会报错了。...调用Python函数string.split() 在C++中如果我们想分割一个字符串,虽然说也是可以实现的,但是应该没有比Python中执行一个string.split()更加方便快捷的方案了,因此我们测试一个用...但是我们同时借助于PyRun_SimpleString调用了Python中的os库,执行了一个查看路径和当前路径下文件的功能,我们发现这个C++文件和需要引入的pysplit.py其实是在同一个路径下的

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    在 R 中估计 GARCH 参数存在问题(基于 rugarch 包)

    一年前我写了一篇文章,关于在 R 中估计 GARCH(1, 1) 模型参数时遇到的问题。我记录了参数估计的行为(重点是 β ),以及使用 fGarch 计算这些估计值时发现的病态行为。...RMetrics 套件包(包括 fGarch)由 ETH Zürich 的 Diethelm Würtz 教授维护。他在 2016 年的车祸中丧生。 Dr....with R Examples中),所以我非常感谢这个建议。...我将探讨包支持的不同优化程序。我不会像我在第一篇文章中那样画图,这些图只是为了表明存在的问题及其严重性。相反,我将考察由不同优化程序生成的估计器的特性。...它可以创建一些图,当在命令行中对 uGARCHpath 对象调用 plot() 时,系统会提示用户输入与所需图形对应的数字。

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    小众做法,通过python调用R语言的第三方包

    为此无意间发现python可以调用R,于是饶有兴致的挖了个坑。 网上的教程基本都很老,下载的费官方whl包都已经没地方下啦。 所以自己开始作死,甚至把anaconda都重装了一遍。。。...网上的教程开始无非是: 1、python调用R使用的是rpy2包 首先安装R或者Rstudio 其次anaconda中conda install rpy2或者。。。。...无奈卸载rpy2,卸载过程中手动中断了(手贱),结果conda无法安装所有包,只能卸载。。。懵逼。 于是只能卸载重新安装anaconda,还好我在卸载之前备份了lib底下的包文件夹。...紧接着我把备份的包还原回去(解压缩) 在系统环境中配置了R的安装地址(这是问题关键),地址是参照网上的做法(作死) 然后网上找了一条代码是运行R的第三方库,结果报错,说没有这个库,我运行了randonForest...\x64\R.dll 错误的地址会让python的字符串增加很多,因为源码已经考虑了这些问题,会多此一举。

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    在ctypes的C共享库中调用Python函数

    概述 ctypes 是Python标准库中提供的外部函数库,可以用来在Python中调用动态链接库或者共享库中的函数,比如将使用大量循环的代码写在C语言中来进行提速,因为Python代码循环实在是太慢了...大致流程是通过 ctypes 来调用C函数,先将Python类型的对象转换为C的类型,在C函数中做完计算,返回结果到Python中。这个过程相对是比较容易的。...现在有个更复杂的情况,我想要在C代码中调用Python中的某些函数来完成C代码的计算,比如在C代码的sort函数中,采用Python中定义的函数来进行大小判断。...这个在Python中定义的函数在 ctypes 中称为回调函数 (callback function)。也就是说需要把Python函数当作变量传给C语言,想想还是有些难度。...然后在Python文件中定义这个回调函数的具体实现,以及调用共享库my_lib.so中定义的foo函数: # file name: ctype_callback_demo.py import ctypes

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    在 Python 中创建列表时,应该写 `[]` 还是 `list()`?

    在 Python 中,创建列表有两种写法:python 代码解读复制代码# 写法一:使用一对方括号list_1 = []# 写法二:调用 list()list_2 = list()那么哪种写法更好呢?...timeit 是 Python 标准库中的一个模块,常用于测量小段代码的执行时间,非常适合性能测试和比较不同实现的效率。...dis.dis() 函数可以反汇编一段 Python 代码,显示它的字节码指令,以帮助开发者了解 Python 代码在底层是如何执行的。...除了 dis 模块,也可通过 godbolt.org/z/T39KesbPf 这个网站来对比这两种写法的差别:二者在功能上的差异[] 和 list() 都能创建空的列表,但在创建含有元素的列表时,二者的用法有所不同...综上所述,当需要创建一个空列表时,[] 是更简洁和高效的选择。而当需要将可迭代对象转换为列表时,就需要使用 list() 了。

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    【R语言在最优化中的应用】用goalprog包求解 线性目标规划

    它在处理实际决策问题时,承认各项决策要求 (即使是冲突的)的存在有合理性;在做最终决策时,不强调其绝对意义上的最优性。...用goalprog包求解目标规划 R中,goalprog包 (Novomestky, 2008) 可以求解形式为模型(3) 的目标规划问题,核心函数为llgp(),用法如下: llgp(coefficients...例 某工厂生产两种产品,受到原材料供应和设备工时的限制,在单位利润等有关数据已知的条件下,要求制定一个获利最大的生产计划,具体数据见表在决策时,按重要程度的先后顺序,要考虑如下意见: 1.原材料严重短缺...该模型符合模型 (3) 的形式,可以直接调用 llgp() 函数来求解该问题,注意:R中根据achievements数据框中的 priority 来判断绝对优先级别,不用再设置 P1,P2,P3。...解:这是一个多目标规划问题,可以直接调用 llgp() 函数求解。

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