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    批量运行多个R脚本

    里面就有很多R代码 : 代码文件很多 如果把这些R代码文件一个个打开,然后一个个运行,工作量也不小,所以我们推荐一个技巧: fs=list.files('....其实理论上应该是在运行每个脚本的时候加上try catch,不过咱们的目标是批量运行每个代码并且保证成功,所以跳过那些运行失败的解决不了问题,反而应该是勇往直前解决问题。...,然后批量运行成功为止。...需要基本生信背景知识 当然需要读者具备计算机基础知识,我把它粗略的分成基于R语言的统计可视化,以及基于Linux的NGS数据处理: 《生信分析人员如何系统入门R(2019更新版)》 《生信分析人员如何系统入门...Linux(2019更新版)》 其中,R语言可能更重要一点,我把R的知识点路线图搞定,如下: 了解常量和变量概念 加减乘除等运算(计算器) 多种数据类型(数值,字符,逻辑,因子) 多种数据结构(向量,矩阵

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    R语言批量拼接遥感影像

    本文介绍基于R语言中的raster包,遍历文件夹,读取文件夹下的大量栅格遥感影像,并逐一对每一景栅格图像加以拼接、融合,使得全部栅格遥感影像拼接为完整的一景图像的方法。   ...其中,本文是用R语言来进行操作的;如果希望基于Python语言实现类似的批量拼接、镶嵌操作,大家可以参考Python中arcpy栅格创建与多景遥感影像批量拼接与ArcPy依据成像时间分别批量拼接不同时相的遥感影像这两篇文章...tif_mosaic) # tif_merge <- do.call(merge, tif_file_list) rf r"...raster包;关于这一包的配置,大家可以参考R语言raster包读取栅格遥感影像。...最后,这里末尾的一句代码,就是将结果图像通过writeRaster()函数加以保存;这句代码的解释大家同样参考R语言计算大量栅格图像平均值、标准差这篇文章即可。

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    批量运行多个R脚本代码

    今天,我们利用健明老师推荐的批量运行多个R脚本代码,见证一下该代码的优势。...然后,我们一个一个打开脚本检查了一下其所用到的R包,下载好所要用到的所有R包。但是在下载R包过程中我们发现RGtk2和rsgcc这两个包一直报错,没有解决掉这个问题。...所以,我们把包含这两个包的5个脚本剔除,把剩下的14个R脚本进行批量运行。 #这两个R包下载失败了,如果你们下载成功了,也欢迎分享以下方法!...具体运行过程 #对以下14个包进行批量运行: setwd("C:\\Users\\Lenovo\\Desktop\\KOR_HCC-main\\KOR_HCC-main\\code") fs=list.files...[1] "Figure_3.R" [1] "Figure_3_new.R" [1] "Figure_4A.R" i SHA-1 hash of file is "015fc0457e61e3e93a903e69a24d96d2dac7b9fb

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    89_批量推理:异步API调用

    异步API调用作为一种更高效的处理模式,通过非阻塞操作和并发处理能力,为批量推理场景提供了理想的解决方案。 本文将深入探讨批量推理中异步API调用的核心概念、实现技术、优化策略以及最佳实践。...我们将从异步编程的基础原理出发,详细介绍Python中asyncio和aiohttp的使用方法,分析批量请求的构建与管理策略,探讨重试机制的设计与实现,并通过实际案例展示异步API调用在各类应用场景中的优势...此外,我们还将讨论性能优化技术、错误处理策略以及未来发展趋势,为读者提供全面而实用的批量推理异步处理指南。 为什么选择异步API调用?...100张图片 # 统计结果 success_count = sum(1 for r in results if not isinstance(r, Exception...RUN pip install --no-cache-dir -r requirements.txt # 复制应用代码 COPY . .

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    R语言文件批量操作实战

    我们在多样本创建Seurat对象的时候,在读取数据之前,需要对多个样本的文件进行移动和改名操作,样本量少的时候可以手动操作,样本量比较多的情况下,手动操作会非常麻烦,为了提高效率,我们可以使用R语言来对文件和文件夹进行操作...需要用代码完成的的操作是: 根据文件名称中样本的GSM编号创建文件夹 将每个样本的数据复制到对应的文件夹下面并修改名称 图片 三、示例代码 示例代码: # 清空R环境中的变量列表 rm(list =...ls()) # 导入必要的包,stringr用于处理字符串 library(stringr) # 查看当前工作目录(显示当前R脚本的工作路径) getwd() # 设置工作目录,将工作路径切换到指定路径下

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    【Z投稿】通过API批量自动生成报表

    大家好,本期Z投稿为大家带来的文章是 《Zabbix通过API批量自动生成报表》 一起来看吧~ ? 文| 李运臣 签名:优秀的判断力来自经验,但经验来自于错误的判断。...Zabbix API为批量操作、第三方软件集成以及其他作用提供可编程接口。 Zabbix API是在1.8版本中开始引进并且已经被广泛应用。...所有的Zabbix移动客户端都是基于API,甚至原生的WEB前端部分也是建立在它之上。Zabbix API 中间件使得架构更加模块化也避免直接对数据库进行操作。...Zabbix API提供两项主要功能: 1. 远程管理Zabbix配置 2. 远程检索配置和历史数据 API 采用JSON-RPC实现。...api_jsonrpc.php是调用API的PHP脚本。可在安装可视化前端的目录下找到。 3. 获取JSON格式响应。

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