首页
学习
活动
专区
圈层
工具
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

不同数据来源的生存分析比较

对比2015.11.1的TCGA数据,最新的TCGA数据,GOBO数据三种数据来源的CCR1,CCL23两种基因在乳腺癌病人中的生存分析。...不过在曾老师的指引之下我顺便探索了一下不同数据来源的生存分析结果会有什么不同。...2015.11.1 TCGA 1.数据获取(RTCGA) RTCGA是一个可以调用TCGA数据并为画生存分析曲线做方便的数据准备的包,不同于常见的生存分析曲线的地方在于,这个包可以把两个基因的表达信息整合到一起...参考来自原作者的教程:https://github.com/RTCGA/RTCGA/issues/97 2.包的安装 首先需要两个数据包:RTCGA.clinical和RTCGA.rnaseq. 3.数据预处理...两个数据来源都是和老版本TCGA数据库的结果有些许的差别,但大致的趋势是一致的。 GOBO 最后再用文献的数据来源试试。

1.7K11

TRICONEX 3636R 服务器中聚合来自多个来源的数据

TRICONEX 3636R 服务器中聚合来自多个来源的数据图片在异构计算平台上节省资源和可普遍部署的应用程序在工业数据方面为工业4.0提供了新的世界。...容器应用程序是提供严格定义的功能的小软件模块,是自动化世界中聪明的数据管理的一个例子。Softing推出了一个新的产品系列,将容器技术用于西门子和Modbus控制器。...背后的想法如前所述,容器应用程序是具有精确定义的功能的软件模块,允许新的部署选项,为自动化技术带来许多好处。好处是运行在不同计算机平台上的低资源、通用的应用程序或软件的实际隔离、封装和可移植性。...这种方法的特别之处在于,容器像一种包含所有必需组件的虚拟机一样运行。这意味着它们可以独立于任何外部组件和现有环境运行。...下载后,容器应用程序可以在几秒钟内使用单个命令行进行部署,并且在生产级别提供了实现简单集中管理的优势。

1.1K30
  • 您找到你想要的搜索结果了吗?
    是的
    没有找到

    使用TreeSoft实现不同数据库间的定时数据同步

    TreeSoft数据库管理系统,支持以下数据同步方案: 1、MySQL同步数据到Oracle 2、MySQL同步数据到PostgreSQL 3、MySQL同步数据到SQL Server 4、MySQL...同步数据到MongoDB 5、Oracle同步数据到MySQL 6、Oracle同步数据到PostgreSQL 7、Oracle同步数据到SQL Server 8、Oracle同步数据到MongoDB...9、PostgreSQL同步数据到MySQL 10、PostgreSQL同步数据到Oracle 11、PostgreSQL同步数据到SQL Server 12、PostgreSQL同步数据到MongoDB...13、MongoDB同步数据到MySQL 14、MongoDB同步数据到Oracle 15、MongoDB同步数据到PostgreSQL 16、MongoDB同步数据到SQL Server 17、SQL...如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 举报,一经查实,本站将立刻删除。

    88420

    常见的世界地图数据来源

    师姐这周没有鸽,鼓掌,呱唧呱唧呱唧 咳咳,进入正题,之前我写过“矢量数据来源”和常见的栅格数据来源的推文(点击图片可直接跳转) 分享的是国内的常见的数据获取,包括“行政边界”、“DEM”、“土地利用...”......最近清理电脑内存有点多,看着总是不爽,毕竟我是“龙” (上下文仅有三毛钱关系) 这次呢,分享一些常见世界地图的数据来源 - 01 - DIVA-GIS http://swww.diva-gis.org...(上述翻译来自小师姐,理解有偏差的话,嗯,十分积极接受反驳) 这样的网站真良心,软件到底咋样,我还没深入了解,有兴趣的小伙伴可以去研究研究,但是数据是真香 按照国家可以下载行政边界、河流、铁路、人口密度...你可以根据比例尺不同选择数据,点红色框框内的带有文字的色块就可以跳转 不光是比例尺度上的特色,数据类型也比较有特色,他以主题的形式分为三种类型:Cultural Vector Data(文化矢量数据...上述网站也不要tizi,就是浏览器下载的时候有点慢,我发现我的读者下载数据比我有套路,毕竟我只会傻瓜式下载 字数好像还有点不够,再来一个,上面介绍的三个主要是世界的极大范围的常规数据,下面这个主要是区域性的不咋地常规数据

    1.1K10

    来自海拉鲁的社区常见问题汇总(不定时更新)

    https://router.vuejs.org/zh/guide/essentials/historymode.html 使用前先看说明,官方提供了一些配置例子,大家可以参考参考 2、wx:for循环打印的数据添加进去了却不循环...,不可能提供,我在此:噗哈哈哈 5、我把自己的本地数据复制到另一小程序中就出错?...该问题反馈给华哥了 7、picker多项选择器 循环渲染修改另外一个第一行 另外一个第二项数据会变化 问题链接:https://developers.weixin.qq.com/community/develop...requests库 (pip install requests) 云调用示例: 11、导入数据,这样的json格子哪里不对吗?...json数据,其实是{"name": "binnie", "age": 18}{"name": "binnie", "age": 18} 这种格式, 外层没有[],并且{}之间没有逗号,也算是新手容易犯的错误吧

    49020

    【数据集】开源 | 变点检测数据集,来自不同领域的37个时间序列,可以做作为变点检测的基准

    获取完整原文和代码,公众号回复:09020498822 论文地址: http://arxiv.org/pdf/2003.06222v2.pdf 代码: 公众号回复:09020498822 来源: 艾伦·...J. van den Burg 内容提要 变化点检测是时间序列分析的重要组成部分,变化点的存在表明数据生成过程中发生了突然而显著的变化。...虽然存在许多改变点检测的算法,但是很少有研究者注意评估他们在现实世界时间序列的性能。算法通常是根据模拟数据和少量不可靠的常用序列的ground truth进行评估的。...为了实现这一点,我们提出了第一个专门设计用于评估变化点检测算法的数据集,包括来自不同领域的37个时间序列。...我们的目标是,该数据集将作为开发新的变化点检测算法的试验场。 主要框架及实验结果 ? ? 声明:文章来自于网络,仅用于学习分享,版权归原作者所有,侵权请加上文微信联系删除。

    1.7K00

    对“不同数据来源的生存分析比较”的补充说明

    前面我的学徒的一个推文:不同数据来源的生存分析比较 , 代码细节和原理展现做的非常棒,但是因为学徒的TCGA数据库知识不熟悉,所以被捉到了一个bug,先更正一下: 有留言说:“TCGA里病人01-09是肿瘤...如果想更详细地了解,请参考:https://gdc.cancer.gov/resources-tcga-users/tcga-code-tables 下面以从 UCSC Xena 上下载的数据为例重新做一次生存分析...(其他来源的数据也是一样的做法) 回到我的数据 和上次一样,先读取数据并预处理 rm(list = ls()) options(stringsAsFactors = F) # 下面的两个数据文件均是手动下载的...,select_exp.txt是取了想要的两种基因的数据,因为原数据包含所有基因的表达信息,读进R里非常慢 exp=read.table("select_exp.txt",sep = '\t',header...for_surv$CCR1=as.numeric(for_surv$CCR1) for_surv$CCL23=as.numeric(for_surv$CCL23) head(for_surv) 生存分析中用到的数据长下面这个样子

    93220

    定时器的时钟来源(内置触发,外部捕获,其它外设驱动)

    MCU定时器-从度量到设计 这篇文章里面写的是CW32的,但是今天文章里面出现的是TI的MSPM0,里面有很多有趣的设计。...TI-MSPM0L1306-潮到风湿的开发板 TI-MSPM0C模块化设计案例 以前小小的写过,太水了,看新篇吧~ 不像别的MCU,对定时器有一些名字上面的划分,TI是按照一个统一的外设来描述的。...红外编码器测速:电机上的旋转编码器每转一圈输出多个脉冲,定时器可以统计脉冲数量,从而计算速度。 就是这样的了 计数按钮按下次数:每次按下按钮,定时器计数 +1。...计数器通过其他外设触发: 就像这样 在 STM32 中,定时器可以通过其他外设(如 DMA、ADC、UART)产生的事件触发计数: TRGO就在这里 都有触发 基本定时器就会简单点 触发 ADC 采样:...触发 DMA 传输:定时器产生中断,自动触发 DMA 传输数据。 触发另一个定时器:两个定时器级联,比如 TIM1 控制 TIM2。 需要对某个信号进行定时采样(也就是隔一段时间,比如说2ms)。

    17510

    uni-app: 多种组合天气,如何制作不同的场景

    更多Date对象方法,请点击: JavaScript中Date对象的那些事儿 这里,我们获取到当前时间是白天或者夜晚后,直接根据变量,添加class选择器,根据选择器设置不同背景图片即可。...这是高德天气api返回给我们的天气数据,我们可以取到weater(多云)字段,根据它,来分割成多种场景。...,晴、多云、阴、雨、雷、雪,简单的6个场景,如果觉得不够全面,可以根据高德提供的天气枚举,做的更详尽,这里只是简单举例。...weatherNum就是我们根据天气分配不同场景的依据。 vue 组件(组件传值等) ?...,这里只是运用了一下,所以,大家如果要学习的更通透,可以多看看以前的文章。

    2.6K20

    深度:数据科学,来自业界的诱惑

    课程参与者们组成团队来开发数据驱动的Web应用程序,并与来自技术公司的数据科学家会面。这些课程还是免费的:成本由科技公司负担,包括支付雇员工资。...经过一周半的课程学习,学生们分成小组与来自当地公司的导师一起针对公司提供的数据构建实用性工具。...这些大学的数据科学中心同时还获得了来自加利福尼亚帕洛阿尔托的戈登贝蒂摩尔基金会(Gordon and Betty Moore Foundation)【译者注:该基金会由“摩尔定律”提出者戈登·摩尔创立】...和来自纽约的斯隆基金会(Alfred P....来自UCB新设立的数据科学伯克利研究院的助理研究员卡西克·拉姆(Karthik Ram)是第一个受资助者。

    1.2K80

    Landsat8的不同波段组合说明

    原文地址:Landsat8的不同波段组合说明 作者: ENVI-IDL中国 Landsat TM (ETM+)7个波段可以组合很多RGB方案用于不同地物的解译,Landsat8的OLI陆地成像仪包括...9个波段,可以组合更多的RGB方案。...如表1是国外公布的OLI波段合成的简单说明。表2是前人在长期工作中总结的Landsat TM(ETM+)不同波段合成对地物增强的效果。对比表3,可以将表1和表2的组合方案结合使用。...,如下图为打开一个标准Landsat8数据,根据需求选择对应RGB合成显示即可。...图1:数据管理面板 图2:7、6、4,水体和植被得到了增强 图3:6、5、2,裸地得到增强,可以与有作物的耕地区分 图4:5、 6、 2,植被呈现不同颜色 图5:6、5、4,植被非常鲜艳

    2.1K20

    为什么不同来源单细胞亚群都可以细分到同样的亚群?

    ,是有 单细胞亚群的生物学命名的4个规则,如下所示 : 第一个规则:已知的生物学亚群 第二个规则:顺序编号加上特异性高表达量基因 第三个规则:生物学功能注释 第四个规则:转录因子等基因集特异性亚群(更多的生物学功能数据库...GSE217845,它里面是10个胰腺癌的10x技术单细胞转录组数据,在第一层次降维聚类分群里面提前髓系免疫细胞后,继续细分降维聚类拿到里面的巨噬细胞,然后继续细分巨噬细胞的时候发现了里面其实是有热激蛋白的亚群...,那么不同来源单细胞亚群都可以细分到同样的亚群就比较容易理解了。...但是如果做泛癌也分成了这样的亚群,是否有更好的解释呢,比如我刚刚看到了 复旦大小连发两个单细胞泛癌数据分析CNS正刊研究文章,其中里面的b细胞细分亚群就是如此: b细胞细分亚群 对初学者来说,确实是难以解释细分亚群出现的有热激蛋白的亚群...这就是生物信息学数据分析的魅力,很难有一以贯之的流程,分析过程的很多环节其实都需要数据分析人员认真的调参以及对结果的取舍!

    20710

    MySQL | 不同的数据类型

    数据定义语言:数据类型 数据类型:数字 类型 大小 说明 TINYINT 1字节 ^1 小整数 SMALLINT 2字节 普通整数 MEDIUMINT 3字节 普通整数 INT 4字节 较大整数 BIGINT...8字节 大整数 FLOAT 4字节 单精度浮点数 DOUBLE 8字节 双精度浮点数 DECIMAL ——– DECIMAL(10, 2) 1^ : (-2^7 --- +2^7-1) 不精确的浮点数...十进制的浮点数无法在计算机中用二进制精确表达 CREATE TABLE temp( id INT UNSIGNED PRIMARY KEY, num FLOAT(20,10) ) 0.2 ---...temp CREATE TABLE temp( id INT UNSIGNED PRIMARY KEY, num DECIMAL(20,10) ) 0.2 ----> 0.2000000000 数据类型...不固定长度字符串 TEXT 1 - 65535 字符 不确定长度字符串 MEDIUMTEXT 1 - 1 千 6 百万字符 不确定长度字符串 LONGTEXT 1 - 42 亿字符 不确定长度字符串 数据类型

    1.6K20

    Solr 如何自动导入来自 MySQL 的数据

    导入数据时的注意事项 在笔记 2 中,可能在执行导入时会报错,那是因为还需要将 mysql-connector-java-xxx.jar 放入 solr-xxx/server/lib 文件夹下; 自动增量更新.../listener-class> 在 solr-xxx/server/solr/ 下新建文件夹 conf,注意不是 solr-xxx/server/solr/weibo/ 中的...conf; 从 solr-data-importscheduler.jar 中提取出 dataimport.properties 放入上一步创建的 conf 文件夹中,并根据自己的需要进行修改;比如我的配置如下...自动增量更新时间间隔,单位为 min,默认为 30 min interval=5 # 重做索引时间间隔,单位 min,默认 7200,即 5 天 reBuildIndexInterval = 7200 # 重做索引的参数...command=full-import&clean=true&commit=true # 重做索引时间间隔的开始时间 reBuildIndexBeginTime=1:30:00 总结 到此,我们就可以实现数据库自动增量导入了

    2K30

    微信指数是怎么调取数据来源的

    微信正式上线“微信指数”,但微信指数数据从哪里来?目前官方是这么个说法:1、捕捉热词,看懂趋势;2、监测舆情动向,形成研究结果;3、洞察用户兴趣,助力精准营销。...之前张晓龙说过好几次,少就多,所以,微信指数能否作为一个搜索引擎的逻辑概念,从哪里调取数据来源?微信公众号的文章?还是微信嵌入进来的各种第三方网站的内容来源?或者是其他?...微信派给出了一个提示:基于微信的大数据分析,微信指数能够帮助大家看到关键词在微信内的热度情况,热度情况有且只限于微信搜索、公众号文章以及朋友圈公开转发文章形成的综合分析。   ...(总阅读数受评价周期长短影响大,平均、最大值受周期影响小),不利于不同周期的WCI计算和比较,现升级为12.0版本。...我们再来看看微信官方的说法 微信指数的应用场景 1、捕捉热词,看懂趋势 微信指数整合了微信上的搜索和浏览行为数据,基于对海量数据的分析,可以形成当日、7日、30日以及90日的“关键词”动态指数变化情况,

    5.8K50

    不同的GSE数据集有不同的临床信息,不同的分组技巧

    最近,我发现学徒在学习GEO数据挖掘的过程中,遇到了第一个也是至关重要的一个难题就是对下载后的数据集进行合适的分组,因为只有对样本进行合适的分组,才有可能得到我们想要的信息。...但是不同的GSE数据集有不同的临床信息,那么我们应该挑选合适的临床信息来进行分组呢?...这里面涉及到两个问题,首先是能否看懂数据集配套的文章,从而达到正确的生物学意义的分组,其次能否通过R代码实现这个分组。同样的我也是安排学徒完成了部分任务并且总结出来了!..., GSE31056 and GSE78060三个数据集 这里主要说一下GSE31056这一个数据集,需要一定的背景知识与细心才能正常分组,原文里 ?...,在不同的情况下选取最合适当下的方法,方便自己去做后续的数据分析。

    9.3K33
    领券