获取一个向量的多重求和，该向量包含由NA除以的多个因子级别 - 腾讯云开发者社区

pairs(data)——数据框各个变量的散布图 coplot(y~x|a+b)——多个变量时的散点图，在a，b（向量或是因子）的划分下的y与x的散点图 scatterplotMatr...（全选：减去均值，再除以标准差） cut(x，breaks=c(0,10,30)，labels，ordered_result=F)——连续数据的离散化，将向量依据breaks区间分割为因子向量...，再去提取列向量 na和NULL的区别 is.na()——判断na值存在，na是指该数值缺失但是存在。...——y~1拟合一个没有因子影响的模型（仅仅是截距） -1——y~x-1表示通过原点的线性回归（等价于y~x+0或者0+y~x） ^n——包含所有知道n阶的交互作用（a+b+c...简单分析 summary()——描述统计摘要，和 Hmisc()包的describe()类似，会显示NA值，四分位距是第1个（25%取值小于该值）和第3个四分位数（75%取值小于该值

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【数据分析 R语言实战】学习笔记第三章数据预处理（下）

第一个图由小条形的长度显示各变量缺失数据比例第二个图显示了综合的缺失模式，可以与md.pattern()生成的结果对照观察，其中浅色方框表示完整数据，深色框表示缺失值。...is.na(salary)]) (3)多重插补法多重插补(Multiple Imputation)是用于填补复杂数据缺失值的一种方法，该方法通过变量间关系来预测缺失数据，利用蒙特卡罗随机模拟方法生成多个完整数据集...在R语言中通过程序包mice中的函数mice()可以实现该方法，它随机模拟多个完整数据集并存入imp，再对imp进行线性回归，最后用pool函数对回归结果进行汇总。...一些结构相似的对象，如向量(数值型、字符型、逻辑型)、因子、数值矩阵、列表或其他数据框等，可以被合并为一个数据框。...unstack()是stack的逆过程，被转换的对象包含两列，它把数据列按照因子列的不同水平重新排列，分离为不同的列。

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R语言学习笔记

R中的向量概念与数学中向量是不同的，类似于数学上的集合的概念，由一个或多个元素所构成。向量其实是用于存储数值型、字符型或逻辑型数据的一维数组。用函数c来创建向量。...merge()——数据框的合并合并一个数据框（或者矩阵）与一个向量的方法： > x NA,NA,3,4,5), k2 = c(1,NA,NA,4,5), #...这些分类变量的可能值称为一个水平level，例如good，better，best，都称为一个level。由这些水平值构成的向量就称为因子。...> week 一个因子 > week # 查看该因子 [1] Mon Fri Thu...如果数据中包含了因子，日期和时间或者类的属性等信息。 > saveRDS(iris, ".

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R编程（六：向量类型详解1）

image.png 向量分类常见的有四种：特别的书写规范： image.png 处理NA 值的注意事项： image.png 除此之外，还有两种不常见的：参见：https://www.cnblogs.com...(b[2]) $names [1] NA 创建带名字的向量的三种方式：如果名称中有确实值的话：获取向量、矩阵、array 信息的函数异同： image.png S3 类向量一个对象，一旦有了...，也是S3 对象，此外还有：因子因子是基于整型向量改写的S3 对象，而许多的因子实际上由字符串转换而来的： > x3 [1] a b Levels: a b > mode(x3) [1] "numeric...我们在将向量转为因子时，可以使用默认顺序下的levels 或手动设定，此时向量本身顺序并不会改变；但如果对已创建的因子转换levels，则因子本身顺序也会按照levels 的顺序改变。...因子取子集，去除其他不包含levels的方法：其他日期 image.png 日期-时间 image.png 时间段反映的是两段时间的差值：列表从大类上，list 是区别于atomic

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【基础】R语言2：数据结构

，输出所有值y[c(F)] #循环使用FALSE逻辑，整个向量值均为FALSEy[c(T,F)] #循环使用TRUE,FALSE逻辑，按顺序进行判断#如果T,F数量多于向量值的数量，会输出NA缺失值...#整除运算#元素个数不相等，短的向量会被重复使用#判断相等：== 一个=是赋值3.逻辑计算%in% #包含运算符> #大于的区别因子factor——用于统计分析因子用factor()函数把字符型向量转换成因子x na.last = TRUE), labels, exclude = NA, ordered = FALSE) #levels：自行指定各水平值, 不指定时由...x的不同值来求得 #labels：指定各水平的标签, 不指定时用各水平值的对应字符串 #exclude：指定要转换为缺失值(NA)的元素值集合 #ordered：取真值时表示因子水平是有次序的(按编码次序

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【R的极客理想系列文章】RHadoop培训之 R基础课

实际上，它们就是向量，而且可以同时被两个或者更多个索引引用，并且以特有的方式显示出来。因子（factor）为处理分类数据提供的一种有效方法。...v <- 2*x + y + 1 逻辑向量逻辑向量元素可以被赋予的值,有TRUE，FALSE 和NA 逻辑向量可以由条件式（conditions）产生 temp 13 字符向量字符向量就是字符串...任何含有NA 数据的运算结果都将是NA。函数is.na(x)返回一个和x同等长度的向量。它的某个元素值为TRUE 当且仅当x中对应元素是NA。...incomes, statef, mean) > incmeans nsw nt qld sa tas 62.5 60.0 40.0 49.0 60.0 函数tapply() 可以用来处理一个由多个分类因子决定的向量下标组合...在线性模型拟合的时候，两种因子对应的对照矩阵的意义是完全不同的。 11). 数组数组可以看作是带有多个下标类型相同的元素集合。维度向量(dimension vector)是一个正整数向量。

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R语言基础教程——第3章：数据结构——因子

R把表示分类的数据称为因子，因子的行为有时像字符串，有时像整数。因子是一个向量，通常情况下，每个元素都是字符类型，也有其他数据类型的元素。...NA) 参数注释： x：是向量，通常是由少量唯一值的字符向量 levels：水平，字符类型，用于设置x可能包含的唯一值，默认值是x的所有唯一值。...如果x不是字符向量，那么使用as.character(x)把x转换为字符向量，然后获取x向量的水平。x向量的取值跟levels有关。...> sex [1] f m f f m Levels: f m 2 因子水平因子水平规定了因子取值的范围，每一个因子，都包含因子水平的信息，例如，打印gender列，可以看到因子的元素和水平： >...student$Gender [1] M M F Levels: F M 该因子中的每个值都是一个字符串，它们被限制为“f”、“m”和缺失值（NA）。

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R语言-因子和表

因子和表因子（factor）是R语言中许多强大运算的基础，因子的设计思想来着统计学中的名义变量（分类变量），因子可以简单的看做一个附加了更多信息的向量。...使用方法：factor（x=character(）,levels,labels=levels,exclude = NA,ordered = is.ordered(x),nmax=NA)因子的创建不像向量...tapply执行操作，将x分组，每组对应一个因子水平（多音字情况下，对应一组水平的组合，然后向量应用于函数g），注意：f中每个因子需要与x具有相同的长度，返回值是向量或者矩阵，x必须是向量> data1...，substr(x,start,stop)5.字符串替换使用chartr（）函数替换元素，chartr(old，new，x),把x的old换成new的6，多个组件合成一个字符串使用sprintf（）函数...（x，y）函数，返回一个和x的长度相同的向量，表示x中与y中元素相同的元素在y中的位置（没有则返回NA）choose（n,k），求组合数，从n个中选出Kunique（x），如果x是一个向量或数据框，则返回一个类似的对象但是去掉所有重复的元素

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RNA-seq 详细教程：Wald test（10）

给定设计公式中使用的因素，以及存在多少个因素水平，我们可以为许多不同的比较提取结果。在这里，我们将介绍如何从 dds 对象获取结果，并提供一些有关如何解释它们的解释。...对比可以用两种不同的方式指定（第一种方法更常用）：对比可以作为具有三个元素的字符向量提供：设计公式中（感兴趣的）因素的名称，要比较的两个因素水平的名称。最后给出的因子水平是比较的基准水平。...：折叠的名称随兴趣级别的变化而变化，折叠的名称随基本级别的变化而变化。...因此，我们将使用第一种方法来指定对比并创建一个字符向量：contrast_oe 包含库克距离高于阈值的基因被标记，但是标记至少需要 3 个重复，因为很难判断哪个样本可能是异常值，只有 2 个重复。

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RNA-seq 详细教程：Wald test（10）

给定设计公式中使用的因素，以及存在多少个因素水平，我们可以为许多不同的比较提取结果。在这里，我们将介绍如何从 dds 对象获取结果，并提供一些有关如何解释它们的解释。...对比可以用两种不同的方式指定（第一种方法更常用）：对比可以作为具有三个元素的字符向量提供：设计公式中（感兴趣的）因素的名称，要比较的两个因素水平的名称。最后给出的因子水平是比较的基准水平。...：折叠的名称随兴趣级别的变化而变化，折叠的名称随基本级别的变化而变化。...因此，我们将使用第一种方法来指定对比并创建一个字符向量： contrast_oe <- c("sampletype", "MOV10_overexpression", "control") 2....包含库克距离高于阈值的基因被标记，但是标记至少需要 3 个重复，因为很难判断哪个样本可能是异常值，只有 2 个重复。

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人工智能大模型的好处之任意数据结构的转换

每个数据结构有独特的用处比如一个班级有多个学生，他们的名字就组成了一个字符型的向量，然后他们都语数外各科的考试成绩，所以可以组成一个二维的矩阵或者数据框，里面的各个元素就是每个学生在每个课程的成绩。...考试成绩部分是一个数据框，其中包含数值型和因子型（用于存储等级）的数据。选修课程成绩是一个更短的列表，只包含那些选修了美术课程的学生的成绩，未选修的学生成绩用NA表示。...(mylist)用于获取列表元素的名称并设置为新数据框的列名。...选择哪种方法取决于你的具体需求和偏好。如果你已经在使用data.table包进行数据处理，那么使用rbindlist可能是一个更直接的选择。...对于长度不相等的向量，可以采取以下方法来处理：使用 data.table 包的 rbindlist 函数：通过设置 fill 参数为 TRUE，可以使得较短的向量用NA填充到与其他向量相同的长度。

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R语言之缺失值处理

table(is.na(height)) # FALSE TRUE # 3 1 需要注意的是，任何包含 NA 的计算结果都是 NA。...例如： mean(height) # NA> 想要得到所有可参与计算的元素的平均值，应该先将 NA 从向量中移除。...如果某一行有完整的数据，返回 TRUE；如果某一行至少包含一个缺失值，则返回 FALSE。...R 中有多个可以实现缺失值多重插补的包，如 Amelia 包、mice 包和 mi 包等。其中 mice 包使用链式方程的多变量补全法，被广泛运用于数据清洗过程中。...因此，这里用多重插补法比用均值替换缺失值的方法效果更好。数据框的最后一个变量 Species 是一个因子，包含 19 个缺失值。

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R语言基础教程——第8章：文件的输入与输出

（7）row.names 保存行名的向量。可以使用此参数以向量的形式给出每行的实际行名。或者要读取的表中包含行名称的列序号或列名字符串。...其取值可以是逻辑值向量（必要时可以循环赋值），数值型向量或字符型向量，以控制哪些列不被转换为因子。...注意：可以通过设置参数 colClasses = "character"来阻止所有列转换为因子，包括数值型的列。（10）na.strings 可选的用于表示缺失值的字符向量。...包含单个字符或空字符的向量。代表注释字符的开始字符。可以使用""关闭注释。（19）allowEscapes 逻辑值。类似“\n”这种C风格的转义符。...这允许用户在最后一个字段后面添加注释。（21）stringsAsFactors 逻辑值，标记处字符向量是否需要转化为因子，默认是TRUE。

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温故知新--R基础知识（上）

实际上，它们就是向量，而且可以同时被两个或者更多个索引引用，并且以特有的方式显示出来。 · 因子（factor）为处理分类数据提供的一种有效方法。...c()可以有任意多个参数，而它返回的值则是一个把这些参数首尾相连形成的向量。...出现在同一个表达式中的向量最好是长度一致。如果他们的长度不一样，该表达式的值将是一个和其中最长向量等长的向量。表达式中短的向量会被循环使用以达到最长向量的长度。对于一个常数就是简单的重复。...(incomes, statef, mean) > incmeans nsw nt qld sa tas 62.5 60.0 40.049.0 60.0 函数tapply() 可以用来处理一个由多个分类因子决定的向量下标组合...R语言的基本对象有矩阵、因子、列表、数据框和函数，assign()都可以赋值，c()可以有任意多个参数，而它返回的值则是一个把这些参数首尾相连形成的向量，paste()可以把单独的字符连成字符串，可以有任意多的参数

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R语言函数的含义与用法，实现过程解读

is.na(x)返回一个与x等长的逻辑向量，并且由相应位置的元素是否是NA来决定这个逻辑向量相应位置的元素是TRUE还是FALSE。 ...x==NA是一个与x具有相同长度而其所有元素都是NA的向量。 NaN(Not a Number): 由数值运算产生，如0/0, Inf-Inf. ...is.na(x)) & x>0] -> z 表示创建一个对象z，其中的元素由向量x+1中与x中的非缺失值和正数对应的向量组成。 2....四有序因子和无序因子因子是一种向量对象，它给自己的组件指定了一个离散的分类（分组），它的组件由其他等长的向量组成。R提供了有序因子和无序因子。...语句组由花括号‘{ }’确定，此时结果是该组中最后一个能返回值的语句的结果。

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R语言函数的含义与用法，实现过程解读

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R语言数据结构(一)向量

为方便大家理解记忆，对每种数据结构的基本操作概括为四大类：创建数据结构往里面添加数据从里面查询数据对里面的数据进行修改这篇文章我们将介绍向量的使用向量向量是R语言中最基本的数据结构，它是由一系列相同类型的元素组成的一维数组...向量的类型可以是数值、字符、逻辑或因子等，但是每个向量只能包含一种数据类型。向量的长度是指它包含的元素个数，可以用length()函数来获取。...创建向量创建向量的一种常用方法是使用c()函数，它可以将多个元素组合成一个向量。...1] "a" "b" "c" "f" "g"# 修改z向量中为FALSE的元素为NAz[z == FALSE] NA TRUE NA TRUE也可以使用向量运算来修改向量中的元素...# 对z向量中的每个元素取反z NA FALSE NA FALSE

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R+中文︱中文文本处理杂货柜——chinese.misc

大数据时代的数据复杂性更高，如数据的流模式获取、非结构化、语义的多重性等。'...二、chinese.misc-文本挖掘方向 1、外部文档、文件夹分词 seg_file( ..., #必须是字符向量，一个或多个文件/文件夹名 from = "dir", #你的输入同文件/文件夹名...os.listdir . 2、获取文件夹下所有文件 dir_or_file ( ..., #一个或多个代表文件夹/文件名 special = "" #代表模式的正则表达式或字符 ) 目录下所有内容...是最常用的判断是否是字符的函数，但是即使是对一个由字符组成的矩阵，它也仍然返回TRUE，因此并不能判断对象是否是一个向量。...这个函数用来判断对象是否是一个由有效正整数组成的符合一定长度的向量。

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. | 深度学习引导下的靶向鲍曼不动杆菌的抗生素发现

鲍曼不动杆菌（Acinetobacter baumannii）是一种医院内的革兰氏阴性病原体，通常由于其坚韧的外膜以及获取和保留经常编码抗生素耐药基因的细胞外DNA而表现出多重药物抗性。...在进行了一定次数的信息传递步骤之后，分子的各个局部化学区域的向量表示被求和为一个捕捉整个化合物复杂性的单一连续向量。然后，使用RDKit19计算得到的固定分子特征来补充这个学习到的最终向量。...这个包含了学习特征和计算特征的最终向量被用作前馈神经网络的输入向量，用于预测抗菌性能。作者使用十个分类器的集成方法对模型进行进一步优化，增强了其稳健性。...在模型训练之后，作者将模型的集合应用于从更新后的Drug Repurposing Hub中筛选出对阿克拉博芒不动杆菌具有活性的抗菌分子，该化合物库包含了6,680个分子。...实际上，目前已使用的抗生素在治疗过程中常常引发失调，导致一系列并发症，包括由机会性病原体引起的继发感染，其中C. difficile肠道感染是一个常见的例子。

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RNA-seq 差异分析的细节详解 (5)

如果关注的变量是连续变量，那么报告的对数变化倍数表示该变量每变化一个单位时的倍数变化。...resSig <- subset(resOrdered, padj < 0.1) resSig 多因素实验设计当实验受到多个因素的影响时，可以使用包含额外变量的设计公式来分析这些实验。...ddsMF <- dds 将 type 的水平调整为仅包含字母（设计因子水平中也可以包括数字、下划线和句点）。...resMF <- results(ddsMF) head(resMF) 还可以获取设计中最后一个变量以外的其他变量的 log2 倍数变化、p 值以及调整后的 p 值。...通常情况下，函数 results 的 contrast 参数要求一个包含三个元素的字符向量：变量名称、作为 log2 比率分子的因子水平名称，以及作为分母的因子水平名称。

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R语言笔记完整版

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【基础】R语言2：数据结构

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RNA-seq 详细教程：Wald test（10）

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R语言之缺失值处理

R语言基础教程——第8章：文件的输入与输出

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