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R-如何使用metafor包绘制森林图?

metafor包是一个用于进行元分析的R语言包,它提供了一系列函数和工具来进行效应量的计算和可视化。绘制森林图是元分析中常用的一种可视化方式,用于展示各个研究的效应量及其置信区间。

要使用metafor包绘制森林图,可以按照以下步骤进行:

  1. 安装和加载metafor包:
代码语言:txt
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install.packages("metafor")
library(metafor)
  1. 准备数据: 准备一个包含研究效应量、标准误差和研究名称的数据框。假设数据框名为data,其中包含列effect表示效应量,se表示标准误差,study表示研究名称。
  2. 计算权重: 根据效应量和标准误差,可以计算每个研究的权重。使用escalc()函数来计算权重,其中measure参数根据具体情况选择合适的效应量测量方法,如"SMR"、"SMD"、"OR"等。
代码语言:txt
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data$weight <- 1 / data$se^2
  1. 进行元分析: 使用rma()函数进行元分析,其中yi参数为效应量,sei参数为标准误差,weights参数为权重。
代码语言:txt
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meta <- rma(yi = data$effect, sei = data$se, weights = data$weight)
  1. 绘制森林图: 使用forest()函数绘制森林图,其中meta参数为元分析结果对象。
代码语言:txt
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forest(meta)

绘制完成后,将会生成一个包含各个研究效应量及其置信区间的森林图。

需要注意的是,以上步骤仅为绘制森林图的基本流程,具体的数据准备和分析方法可能因研究问题而异。在实际应用中,还可以通过调整参数和添加额外的绘图选项来定制森林图的样式和布局。

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