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KEGG数据库的rest API(附带R语言小技巧)

发现感兴趣的KEGG ID居然不在KEGG.db包里面,比如: hsa05034 Alcoholism hsa05030 Cocaine addiction 导致下面的代码失效: library(KEGG.db...hsa04060']] KEGGPATHID2EXTID[['hsa05034']] KEGGPATHID2EXTID[['hsa05030']] 其实,即使不失效,也不能使用这种方法来找属于某个pathway的基因集合了...搜索了一下,发现KEGG数据库的rest API,比如 http://rest.kegg.jp/get/hsa05034 (点击阅读原文可以直达) 本来准备读入到R里面,然后自己解析,发现其实已经有了R...unlist(lapply(gs[[1]]$GENE,function(x) strsplit(x,';')[[1]][1])) genes[1:length(genes)%%2 ==0] 当然了,这个R包的功能不止如此...:https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/KEGGREST.html 我就不多演示了,感兴趣的朋友去探索一下。

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WordPress 显示数据库查询次数、查询时间及内存占用的代码

如果对进行过WordPress 性能优化,需要一个直观简单的查看方式的话,那么就可以使用下面所提及的代码,通过这段代码,可以在直观或者在html 源代码查看数据库查询次数、查询时间及内存占用。...代码本质上只有一段,但因不同添加方式可以变形为以下几种: 一、在页面前台显示数据库查询次数、查询时间 将下面的代码丢入主题的footer.php 的 seconds 二、在html 源代码下显示数据库查询次数、查询时间 如果只是给自己看的,最好是在html 源代码下显示,很简单。就是将它变为html 注释,上面的代码修改为: 在html 源代码下显示 需要在主题的functions.php 文件下加入以下代码定义函数并自动显示: function performance( $visible = false...其实只要是php 程序都可以使用这段代码,通用的。 最后给个略难看的“效果图”吧~ ? ?

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    使用 WordPress Transients API 缓存复杂的 SQL 查询和运算结果

    什么是 WordPress Transients API Transients 是瞬时的意思,WordPress Transients API 是 WordPress 用来缓存一些复杂的 SQL 查询和运算结果的最简单的方法...所以如果你在制作 WordPress 插件的时候,需要存储一些有一定生命周期的数据的时候,Transients API 是最好的选择。...WordPress Transients API 缓存的数据存储在哪里 这个取决你的服务器设置,如果你的服务器开启 Memcached,那么缓存的数据就存在 Memcached 的内存中,如果没有开启的话...,则存储到 WordPress 数据库的 Options 表中。...WordPress Transients API 例子 假设你要获取博客的流量最高的 10 篇文章,这个要设计复杂的 SQL 查询,而流量最高的 10 篇文章一般来说在一段时间(比如:12小时)之内是不会变化的

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    CVE-2024-25600:WordPress Bricks Builder RCE

    访问 http://localhost/WordPress-6.4.3/ 自动跳转到安装界面,设置数据库,在这注意要手动新建一个数据库。...query参数下,要有参数useQueryEditor 构造函数自动执行的前提是所在的类被实例化,继续搜素,看在哪里会实例化Query类 在ajax.php#render_element中存在Query...的实例化,需要的条件就是loop_element为false,而其初始值为false,这里设置了ajax与rest api这两种请求方式。...api.php中存在命名相同的方法调用了Ajax#render_element,这里的api.php实际上是一个处理注册的 REST API 端点之一的文件 继续搜索调用,找到在它的自定义初始化端点函数...,从中可以看到它定义了很多能够注册的REST路由,API_NAMESPACE的值就是/bricks/v1/,通过后面拼接某个字符串的方式触发对应的callback回调函数以及权限检查。

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    把 WordPress 变成 BaaS 服务:API 调用指南

    WordPress REST API 另外一种,则是 REST API[6],使用通用的 JSON 格式来与 WordPress 应用进行数据交互。...不过,庆幸的是,在 WordPress 最新发布的 6.5.0 版本变更记录中[10],依旧对 REST API 功能做了保留和支持[11]。...•在调用的过程中,做好身份鉴权,这里可以借助一些其他插件,比如 plugins/wp-rest-api-authentication/[17]等。...当然,如果你没有使用前两篇内容中提到的 SQLite,还是使用了传统的关系型数据库,在当前固态硬盘遍地走的时代,哪怕购入一台 2C4G*2 低配置的支持高并发架构的云数据库(不贴链接了,避免被和谐,关键词...除此之外,即便服务还有 CMS 属性,如果我们就是常规程序写入(包括采集)和调用(更新内容版本),做好批量写入队列,不去短时间(秒)内疯狂 JOIN 表查询或更新,想跑挂现在的数据库,还是挺困难的。

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    把 WordPress 变成 BaaS 服务:API 调用指南

    写在前面首先,我们需要进行清晰的名词定义,这里指的 “API 调用”是能够通过外部程序访问的 WordPress API 可编程接口,而非 WordPress 暴露给内部生态系统中的主题、插件工具开发者使用的...另外一种,则是 REST API,使用通用的 JSON 格式来与 WordPress 应用进行数据交互。...不过,庆幸的是,在 WordPress 最新发布的 6.5.0 版本变更记录中,依旧对 REST API 功能做了保留和支持。社区中也依旧有许多方便的可以调用的 SDK 方案和资料参考。...在调用的过程中,做好身份鉴权,这里可以借助一些其他插件,比如 plugins/wp-rest-api-authentication/等。...除此之外,即便服务还有 CMS 属性,如果我们就是常规程序写入(包括采集)和调用(更新内容版本),做好批量写入队列,不去短时间(秒)内疯狂 JOIN 表查询或更新,想跑挂现在的数据库,还是挺困难的。

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    微慕 rest api 缓存插件

    对于缓存优化,目前大部分都是针对WordPress 的web网站页面数据缓存,对于通过WordPress rest api获取的数据(json数据)缓存并没有效果。...微慕小程序后端采用的WordPress rest api。...如果把rest api 的数据缓存起来,不再每次都去访问数据库获取,做到 “0 sql ”,就可以加快了 rest api 的访问速度,间接加快了小程序的响应速度。...在这个思路下,微慕团队开发了微慕REST API 缓存插件,同时在微慕小程序的插件里做了适配,全面支持开源版、增强版、专业版的插件和小程序。...微慕rest api 缓存插件支持的缓存服务器有:Memcached 和Redis。如果没有安装这两个服务,插件也提供了缓存到数据库的方式。

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    史上最详细的WordPress的自定义文章类型指南(1)

    但是WordPress中一些比较重要的部分,比如WP_Query , REST API, 包括本文要介绍的Post Type部分都是面向对象,而且WordPress中的一些插件就是全部使用面向对象,比如...=> true, // bool (默认为 TRUE) // 是否暴露在 Rest API 中 'show_in_rest', // 布尔值...,默认为 false // 使用 Rest API 访问的基础 URI 别名 'rest_base', // 字符串,默认为文章类型别名...// 使用自定义 Rest API 控制器而不是默认的 WP_REST_Posts_Controller,自定义控制器必须继承 WP_REST_Controller 'rest_controller_class...如果你对自己的WordPress数据库有权限,那么你可以直接修改数据库中的wp_options来进行rewrite rules的刷新,本质上这些规则都是存在option_value这个字段中,只要把这个字段的值清空即可

    4.4K20

    如何修复WordPress更新失败发布失败错误,您可能已掉线

    推荐阅读[已解决]wordpress错误:此用户名包含无效字符,请输入有效的用户名 1、REST API是否被阻止   导致此错误的最常见原因之一是REST API。...如果REST API被阻止,那么您将无法添加,删除或更新您的帖子。   ...要检查REST API是否被阻止或正常工作,您可以按照以下步骤操作: 登录到您的WordPress仪表板 转到工具>>站点健康   如果您在网站看到上述错误,则表明REST API无法正常工作。...现在,您可以尝试在WordPress中发布,修改或重新创建文章。 5、使用经典WordPress编辑器   经典编辑器是此错误的临时解决方案。...相关文章 如何修复WordPress中的“建立数据库连接时出错”?

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    Wordpess REST API 错误排查记录

    健康检查也发现了REST API报错。各种分析后,终于解决了这个问题。 报错信息 虽然有各种报错信息,但站点整体功能都是正常的。...通过网上的一些提示,查询REST API发现API也是正常的。 WordPress 健康检查发现的问题 健康检查中也有和WP Statistics类似的报错。URL无效。...图片 REST API遇到了错误 REST API是WordPress及其他应用与服务器通信的一种途径。例如区块编辑器页面,它依赖REST来显示及保存您的页面和文章。...REST API请求因遇到了错误而失败。 错误:URL无效。...图片 解决 由此,突然想起wp-config.php这个文件里有个使用相对路径的配置,在升级PHP后,把里面的中文引号改成了英文引号,导致一直没生效的配置生效了。

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    GBase 数据库在分布式查询中的优化与实现

    一、引言随着大数据技术的快速发展,传统的单机数据库已难以满足海量数据存储与查询的需求。...本文将详细探讨 GBase 数据库在分布式查询场景中的优化技术与实现方式,并结合示例代码说明其应用。二、GBase 数据库在分布式查询中的架构优势1....分布式架构简介GBase 数据库支持分布式存储与计算,通过将数据分片存储在不同节点,提升查询效率和存储能力。• GBase8a:以分析型查询为核心,支持大规模并行处理(MPP)。...• 通过调整索引或查询语句优化代价最高的步骤。四、GBase 分布式查询的技术实现以下示例展示了 GBase 分布式查询在 Python 中的实现方式。1....通过合理的分区设计、索引优化和执行计划分析,用户可以显著提升查询性能。在实际应用中,结合代码实现和配置调优,可以充分发挥 GBase 数据库的潜能,为业务需求提供强有力的支持。

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    WordPress JSON REST API简单介绍及使用

    WordPress JSON REST API (WP API) 简介 这个插件(WordPress JSON REST API (WP API))提供了一个易于使用的REST API,让我们可以通过...WP API为WP查询创建了一个简单而方便的接口,文章API,文章元数据API,用户API,版本API等等。WordPress能做的事情,WP API同样可以让你做到,并且更加方便。...WordPress JSON REST API (WP API)的使用 WP REST API插件的使用还是非常简单的,在Wordpress后台下载安装好WP REST API插件后,启用插件,注意...注意:只有 “公开” 查询参数可以通过API使用,因为不是所有的查询参数可以安全的暴露出来。只有具有edit_posts权限的授权用户才能使用 “私有” 查询参数。...更多可用查询参数请参考WordPress官方文档,下面是可以在API中使用的查询参数: m p posts w cat

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    WordPress 网站基于REST API 开发“微信小程序”实战

    原理篇 WordPress 与 REST API WordPress 在4.4 版本后推出了 REST API, REST API 简单来说就是一种通过 HTTP 请求来获取、更新、删除数据的一种连接客户端与服务端的交互方式...我们访问平常的普通 WordPress 网页,在没有开启静态缓存的情况下,大概是走“从数据库拉取数据—> 服务端 PHP 进程拼成 HTML 直接输出 —> 用户浏览器界面”的过程, REST API...有了REST API,一个网站制作各种网站版本(安卓版、iOS 版、以及接下来说的小程序版)而共享一个数据库成为了可能。 ? ?...WordPress + 小程序 微信小程序通过 REST API 获取到 WordPress 网站上的数据,然后通过一定的方式在小程序端进行数据处理后通过前端代码渲染,然后就是你在微信客户端上看到的界面...另外在开始开发之前,我在服务端对WordPress REST API 进行了一些定制化的输出。

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    WordPress常用插件

    WordPress常用插件 WordPress提供了完善的插件机制,通过使用插件,我们可以优化Wordpress的性能、丰富Wordpress的功能,这里记录一些常用的Wordpress插件。...Action Scheduler A robust scheduling library for use in WordPress plugins. 二、REST API优化插件 1....JWT Authentication for WP-API Extends the WP REST API using JSON Web Tokens Authentication as an authentication...BuddyPress BuddyPress 可以帮助您及开发者在 WordPress 上创建任何类型的社交网络,同时 BuddyPress 已内置有会员资料,活动流,用户群组,消息等等。...MySQL多层级树形结构表的搜索查询优化 使用WordPress作为小程序后端——APPID有效性前置检查 使用WordPress作为小程序后端——小程序请求前置检查 Windows rclone挂载sftp

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    WordPress 4.6正式版“Pepper”上线发布

    WordPress是一种使用PHP语言开发的博客平台,用户可以在支持PHP和MySQL数据库的服务器上架设属于自己的网站,也可以把 WordPress当作一个内容管理系统(CMS)来使用。...WordPress 4.6中的v2版本,有一个比较大的改进,就是搜索功能。在已装插件屏幕和添加新插件屏幕中,搜索框都采用了ajax搜索。...—— 编辑器改进 在输入文章内容的时候,WordPress可以自动保存文档。...允许浏览器预读取特定页面,在后台进行渲染,执行DNS查询,或者在后台进行连接握手(DNS,TCP,TLS)。 —— HTTP API 内部改动 HTTP API经历了较大的内部改进。...—— REST API ——增强了 register_meta() —— 自定义面板 —— WP_Site_Query,WP_Network_Query,WP_Term_Query,WP_Post_Type

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    开发 | 无需后端编码,手把手教你把 WordPress 做成小程序

    关注「知晓程序」公众号,在微信后台回复「开发」,获取小程序开发技巧精选文章。 小程序如何读取 WordPress 博客内容? WordPress 在 4.6 版本推出了 REST API。...我们访问平常的普通 WordPress 网站,在没有开启静态缓存的情况下,大致需要「从数据库拉取数据 → 服务端 PHP 进程拼成 HTML → 用户浏览器界面」的过程。...有了 REST API,一个网站制作不同客户端(Android 或 iOS 的 app,以及微信小程序),而共享一个数据库成为了可能。 ?.../wp-json/wp/v2/ 是WordPress 定义的 REST API 路由(router)与版本号等的组合。 posts 在 WordPress 中,称为「终点」(endpoint)。...对数据进行处理后,通过前端代码渲染,就是你在微信客户端上看到的界面。 WordPress 的 REST API 已经很完善了,什么文章数据、页面数据、用户数据等都不在话下。

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    wordpress网站设置LiteSpeed Cache缓存插件优化加速教程

    适用于WordPress的LiteSpeed缓存(LSCWP)是一个多站点的网站优化加速插件,具有专用的服务器级缓存和优化功能的集合。...LiteSpeed插件与您的LiteSpeed Web服务器及其内置的页面缓存(LSCache)通信,以为WordPress站点提供卓越的性能。...或者使用QUIC.cloud的CDN,因为其CDN节点在国内访问不友好,因此这里忽略。 LiteSpeed Cache插件的页面缓存允许服务器完全绕过PHP和数据库查询。...PageSpeed分数优化 OPcode缓存支持+ HTTP / 2 Push for CSS / JS(在支持它的Web服务器上) DNS预取 Cloudflare API 单站点和多站点(网络)支持...缓存WordPress REST API调用 桌面和移动视图的单独缓存 能够计划清除指定的URL WooCommerce和bbPress支持 WordPress CLI命令 API系统可轻松实现缓存集成

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    在Laravel5.6中使用Swoole的协程数据库查询

    ,数据库连接池,AsyncTask,消息队列,毫秒定时器,异步文件读写,异步DNS查询。...Swoole提供了多线程、长连接等很多牛逼的功能,把php上升到了一个新的台阶,具体的你可以看看入门教程,本文只限于讨论Laravel和Swoole的结合。...如果你Swoole业务代码是写在一个叫server.php的文件中,那么在命令行下输入php server.php开启。...这是比较头疼的事情,因为Laravel框架可不是这样的运转的,那如何能与Laravel结合呢?没错,自定义一条Artisan Command,就这么简单。...529cb96ca9abeed7a35076725b3b5cd8a1e04ff7/git.patch git am < git.patch 启动laravel-s php artisan laravels start 现在你就可以测试你的数据库查询了

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