Aspera用法如下: Usage: ascp [参数] 目标文件 保存路径 一、 Aspera下载一个SRA文件 Step 1:建立Seqs文件夹保存下载序列 mkdir ~/Seqs...Step 2:下载SRA文件到Seqs文件夹 ascp -T -i /home/xiaoming/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh...ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov:/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR620/SRR6208854/SRR6208854.sra ~/Seqs/ 二、 Aspera...SRR6232299.sra 按Ctrl+O,Ctrl+X保存退出 Step 2:批量下载sra_list.txt列表中的文件 ascp -T -i /home/xiaoming/.aspera
Aspera是一项突破性传输协议,充分利用现有的 WAN 基础设施和通用硬件,传输速度比 FTP 和 HTTP 快达数百倍。...Aspera在Ubuntu环境的安装过程如下: Step 1: 建立安装文件夹 mkdir ~/Biosofts cd ~/Biosofts Step 2: 下载Aspera软件....tar.gz Step 4: 安装Aspera 解压后是一个shell脚本,运行即可 sh aspera-connect-3.6.2.117442-linux-64.sh Step...5:测试Aspera是否安装成功 ascp命令默认安装地址在:~/.aspera/connect/bin ~/.aspera/connect/bin/ascp -h Step 6:将...aspera安装路径加入环境变量 echo 'export PATH=~/.aspera/connect/bin:$PATH' >> ~/.bashrc Step 7:使环境变量生效<
安装 Aspera 首先进入aspera 官方网站,找到「IBM Aspera Connect」,进入下载页面,找到对应的版本与平台,这里以 Linux 平台最新的 3.10.0 版本为例进行介绍。...# 下载 wget https://ak-delivery04-mul.dhe.ibm.com/sar/CMA/OSA/092u0/0/ibm-aspera-connect-3.10.0.180973-...,运行该脚本,即可完成自动安装 sh ibm-aspera-connect-3.10.0.180973-linux-g2.12-64.sh # 所有安装文件都在~/.aspera/connect目录下...官网:https://www.ibm.com/products/aspera/downloads?...list Aspera 使用说明 1:https://www.ibm.com/support/pages/downloading-data-ncbi-command-line#usage Aspera
软件AsperaHigh-performace transfer brower plugin,IBM旗下的高速下载插件。...# 下载wget wget https://download.asperasoft.com/download/sw/connect/3.9.9/ibm-aspera-connect-3.9.9.177872...-linux-g2.12-64.tar.gz # 解压tar -zxvf ibm-aspera-connect-3.9.9.177872-linux-g2.12-64.tar.gz# 安装 软件安装路径是用户根目录的.../ibm-aspera-connect-3.9.9.177872-linux-g2.12-64.sh enaBrowserToolsenaDataGet/enaGroupGet是enaBrowserTools...使用,参数为-a/--aspera,添加此参数则调用aspera。
Dr.羊 | Aspera是什么?...Aspera是IBM公司的一款高速传输软件,创造了新一代的传输技术(faspTM),不受文件大小、形态、传输距离、网络条件限制,以最高效的速度来协助用户迁移各地的数据。...> 安装指引:点击如下网址:https://www.ibm.com/products/aspera/downloads → 找到IBM Aspera Connect → 点击Download now →...02 获取Aspera账户 如果您第一次使用Aspera,请在CNSA实验/测序批量提交流程页面选择Aspera命令行上传并点击按钮“申请Aspera账户”获取Aspera账户及操作说明。...> [aspera_account]为系统分配的aspera账户名,您可以实验/测序数据的提交流程里获得。
虽然有aspera下载加速措施,但是每次下载至少失败一半!...fastq.gz fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/SRR150/057/SRR15037157/SRR15037157_2.fastq.gz 继续使用脚本 step1-aspera.sh...~/miniconda3/envs/download/etc/asperaweb_id_dsa.openssh \ era-fasp@$id . done # nohup bash step1-aspera.sh...1>step1-aspera.log 2>&1 & 然后前面失败的文件这次就成功下载了。
IBM Aspera Faspex 是一个被企业广泛采用的文件传输应用程序,以能够安全和快速传输大型文件而广受青睐。...安全公司Rapid7本周建议Aspera Faspex用户立即将他们的软件卸载,或者将其升级到有补丁的版本。...该漏洞是Ruby on Rails代码中的一个反序列化漏洞,存在于IBM Aspera Faspex 4.4.2版及以前的版本中。IBM通过删除API调用来修复该漏洞。...SentinelOne表示,在最新的活动中,该组织首次通过Aspera漏洞开始打击Linux系统。...也因此攻击者转向利用应用程序的漏洞,正如IceFire通过IBM Aspera漏洞部署有效载荷所证明的那样。当然,Buhti勒索软件组织也是如此。
Aspera下载和安装 Aspera下载: http://downloads.asperasoft.com/connect2/。...zxf aspera-connect-3.5.1.92523-linux-64.tar.gz sh aspera-connect-3.5.1.92523-linux-64.sh echo 'PATH=$...PATH:~/.aspera/connect/bin/' >> ~/.bashrc source ~/.bashrc ascp --help 软件一般安装在 ~/.aspera/connect/ 目录下...Aspera使用: 使用说明:https://www.internationalgenome.org/faq/how-download-files-using-aspera Aspera 高速下载 NCBI...-i 免密从SRA和ENA下载的私钥,为·安装 aspera 后有在目录 ~/.aspera/connect/etc/ 下的asperaweb_id_dsa.openssh 文件。
wget -c https://sra-download.ncbi.nlm.nih.gov/traces/sra35/SRR/015553/SRR15927225 Aspera Aspera[5]是IBM...wget https://download.asperasoft.com/download/sw/connect/3.9.1/ibm-aspera-connect-3.9.1.171801-linux-g2.12...-64.tar.gz tar -zxvf ibm-aspera-connect-3.9.1.171801-linux-g2.12-64.tar.gz bash ibm-aspera-connect-3.9.1.171801...使用conda安装的aspera私匙位置通常在anaconda3/etc/目录下(miniconda同),官网手动安装的私匙位置通常在~/.aspera/connect/etc/。...: https://www.ibm.com/products/aspera/downloads?
官网资源: https://ftp.gnu.org/pub/gnu/libiconv/libiconv-1.16.tar.gz CSDN资源:https://...
下面主要说说我的数据下载踩的坑,多亏了张老师的帮助让我从这两天的坑中跳了出来,我是用的aspera软件下载的。...在conda下安装aspera软件 conda install-y-chcc aspera-cli which ascp 找到要下载的数据的BioProject;一般知道它的GEO accession和
大文件传输专业软件领域,行业的标杆是Aspera,Aspera成立于2004年,2013年被IBM收购,主要服务客户分布在媒体、影视制作、生命基因工程、工程等需要大量数据文件交换的行业。...基于fasp传输协议,aspera针对不同的应用场景开发了一系列文件传输应用,比如Aspera Enterprise transfer server/Aspera connect/Aspera sync.../Aspera faspex等,这里不一一介绍。...国内很多行业比如影视制作、传媒、电视台都采购了Aspera软件用于大文件数据分发。...如果有一天,中美竞争进入白热化,美国政府禁止IBM向国内企业提供软件服务,我们的行业是否会向中兴一样瞬间进入休克状态,数月之内就要面临奔溃?在网络我们是否存在替代方案?答案是,有。
下面是100个lncRNA组装流程的软件的笔记教程 Aspera是IBM公司的一款高速传输软件,创造了新一代的传输技术(faspTM),并能不受文件大小、形态、传输距离、网络条件限制,以最高效的速度来协助用户迁移各地的数据...一、软件安装 使用conda安装 conda install -y -c hcc aspera-cli conda install -y -c bioconda sra-tools which ascp...ls -lh ~/miniconda3/etc/asperaweb_id_dsa.openssh # 一定要搞清楚你的软件被conda安装在哪 二、aspera的用法 安装完成以后,可以使用ascp...~/miniconda3/envs/download/etc/asperaweb_id_dsa.openssh \ era-fasp@$id . done # nohup bash step1-aspera.sh...1>step1-aspera.log 2>&1 &
安装 $ tar -zxvf aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.tar.gz $ ..../aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.sh $ sudo cp ~/.aspera/connect/etc/aspera-license /usr/local/bin...ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR507/SRR5077625/SRR5077625.sra EBI的aspera...命令 含义 ~/.aspera/connect/bin/ascp aspera的可执行文件 -k 1 断点续传 -QT 100M 提高下载速度 -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh...--user anonftp --file-list aspera_download.txt 4.
专家们观察到IceFire利用IBM Aspera Faspex文件共享软件(CVE-2022-47986,CVSS评分:9.8)的反序列化漏洞来部署勒索软件。...该勒索软件成功加密了一台运行IBM Aspera Faspex文件服务器软件的CentOS主机。该勒索软件对文件进行加密,并在文件名上附加".ifire "扩展名,然后通过删除二进制文件来自我删除。...为了克服这一点,攻击者转变方向,利用应用程序的漏洞,正如IceFire运营商通过IBM Aspera漏洞部署有效载荷所证明的那样。
/sw/connect/3.8.1/ibm-aspera-connect-3.8.1.161274-linux-g2.12-64.tar.gz # 解压 tar zxvf ibm-aspera-connect...-3.8.1.161274-linux-g2.12-64.tar.gz # 安装 bash ibm-aspera-connect-3.8.1.161274-linux-g2.12-64.sh 这个软件安装好了之后...,会在用户的家目录下的生成一个隐藏目录.aspera,需要用ls -a来查看 ?...PATH="~/.aspera/connect/bin/:$PATH" # 注意这里要用双引号,不能用单引号 运行上面这一行命令之后,就可以随时随地得调用了,如: ?...,方法如下: echo export PATH="~/.aspera/connect/bin/:$PATH" >>.bashrc 这样我们就把这一行代码写入到.bashrc里面了,我们说过,.bashrc
IBM Aspera传输对比FTP传输最大的优势是传输速度快,Aspera在官方网站上特别强调了对FTP传输的优势(100倍于FTP的速度),而且是所有的FTP系统,不管是开源的FTP还是商业FTP。...镭速RaySync FTP传输系统正式发布后,FTP系统被Aspera在远距离传输速度上碾压的状况一去不返,在最常见的两个传输场景中,镭速RaySync FTP传输速度指标已经与Aspera持平和超越。...100Mbps带宽,100毫秒时延和2%丢包: Aspera带宽利用率为94.6% 镭速RaySync FTP带宽利用率为94.7% 100Mbps带宽,100毫秒时延和5%丢包: Aspera带宽利用率为...90.3% 镭速RaySync FTP带宽利用率为90.4% 上面Aspera的数据来自于Aspera官方技术白皮书, 想想到老的时候,可以回忆这一段岁月,跟孩子们吹嘘当年曾凭借一己之力改变了一个行业领域格局
asper mkdir asper & cd asper; #下载asper: wget https://download.asperasoft.com/download/sw/connect/3.8.1/ibm-aspera-connect...-3.8.1.161274-linux-g2.12-64.tar.gz #解压asper tar xzvf ibm-aspera-connect-3.8.1.161274-linux-g2.12-64....tar.gz #激活Aspera sh aspera-connect-3.8.1.161274-linux-g2.12-64.sh ## 检查结果 cd ls -a ##查看是否有.aspera文件夹...禁用加密 ## -l 设置最大传输速度,一般200m到500m ## -k 断点续传,一般设置为值1 ## -P 提供SSH port,端口一般是33001 ## -i 提供私钥文件的地址,一般是找~/.aspera...;将链接中的ftp://ftp.sra.ebi.ac.uk/替换为fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk: LInux命令如下: ascp -QT -l 300m -P33001 -i ~/.aspera
下载文件夹 >mirror v4 > exit 4.4 高速下载 Asprea 是一款非常神奇的工具,它可以极大的提高数据传输的效率,Asprea 是一家专门做数据传输解决方案的公司,后来被 IBM...http://asperasoft.com/ 安装 aspera wget https://download.asperasoft.com/download/sw/connect/3.9.9/ibm-aspera-connect...-3.9.9.177872-linux-g2.12-64.tar.gz tar -zxvf ibm-aspera-connect-3.9.9.177872-linux-g2.12-64.tar.gz sh...ibm-aspera-connect-3.9.9.177872-linux-g2.12-64.sh 利用 aspera 下载数据 ascp -i .aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh...6、不是所有的网站都支持 Aspera 下载的,需要服务提供方购买 Aspera 服务,用户才可以使用。
wget -c https://d3gcli72yxqn2z.cloudfront.net/connect_latest/v4/bin/ibm-aspera-connect_4.1.0.46-linux_x86..._64.tar.gz tar -zxvf ibm-aspera-connect_4.1.0.46-linux_x86_64.tar.gz # 自动安装 sh ibm-aspera-connect_4.1.0.46...# 该密匙保存位置一般为:~/.aspera/connect/etc/ -l # Set the target transfer rate in Kbps....${i}.tar.gz ./" >> aspera.preformatted.nr.sh echo "ascp -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh...${i}.tar.gz.md5 ./" >> aspera.preformatted.nr.sh done ParaFly -c aspera.preformatted.nr.sh -CPU 1 &
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