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使用FUSION进行TWAS分析

FUSION是一款进行TWAS分析的软件,对应的文章发表在nature genetic上,链接如下 https://www.nature.com/articles/ng.3506 软件的官网如下 http...://gusevlab.org/projects/fusion/ 该软件同时支持对单个样本和多个样本的gwas cohort中的样本进行基因型填充,对应的流程图如下 ?...利用reference panel建模 通过不同的模型,计算cis-SNPs和基因的关系,代码如下 Rscript FUSION.compute_weights.R \ --bfile $INP \ -...对gwas cohort进行TWAS分析 代码如下 Rscript FUSION.assoc_test.R \ --sumstats PGC2.SCZ.sumstats \ --weights ....FUSION使用的较为广泛,还有人用这个软件分析了很多gwas summary数据,做成了数据库twas-hub, 后续在详细介绍这个数据库。 ·end·

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    iPhone 11: What is Deep Fusion and how does it work?

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    VMware Fusion Pro 11是一款专业的虚拟机软件,可以在Mac电脑上运行Windows、Linux等操作系统。...VMware Fusion Pro 11是一款功能强大的虚拟机软件,具有以下特色: 高效稳定:VMware Fusion Pro 11使用了先进的虚拟化技术,如Intel VT-x技术和Hyper-V技术...多操作系统支持:VMware Fusion Pro 11支持多种操作系统,如Windows、Linux、FreeBSD等,用户可以根据需要选择不同的操作系统来满足其需求。...安全性能:VMware Fusion Pro 11可以将虚拟机隔离在一个安全的环境中,以保护主机计算机的安全,并且可以对虚拟机进行加密和密码保护。...强大的性能:VMware Fusion Pro 11可以利用Mac电脑的硬件资源,如CPU、内存、显卡等,来提高虚拟机的性能表现,从而实现更快的运行速度和更流畅的体验。

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