DOCK是经典的分子对接软件,很多对接软件的思路都是它的基础上发展起来的,但是无奈操作太复杂,上手的或者用来做科研的论文上少见。...http://ringo.ams.sunysb.edu/index.php/DOCK_Tutorials
---- DOCK教程 ---- 简介: DOCK是基于Unix的科学计算软件。 遵循通用的安装方法:下载,解压缩,配置,构建和测试。DOCK的简单配置方案基于纯文本文件。...DOCK的安装是如此简单和透明,以使用户有机会自己解决问题。 DOCK是经典的分子对接程序,用于识别潜在的结合构象以及分子与靶标的相互作用。...DOCK能做的 预测小分子-蛋白质复合物的结合模式 搜索配体的数据库,以模拟经过实验验证的抑制剂的抑制性结合相互作用的化合物 在配体数据库中搜索与特定蛋白质的特定位点结合的化合物 搜索与核酸靶标结合的化合物的配体数据库...---- 对接步骤: (1)下载蛋白结构文件: 1ABE.pdb (2)准备受体文件 删除配体分子文件 使用chimera的dock prep功能对受体文件进行准备(删除) 删除水分子,加氢,加电荷 保存为...或者说对接口袋) 需要程序/指令:showsphere sphere_selector (5)生成Grid 围绕着活性位点建立一个box 生成Grid (6)Docking 进行对接(半柔性): 需要程序/指令:dock6
Dock从初级到高级全套教程 dock是iMac中很常见的一个功能,而且非常实用,那么dock到底是什么意思呢?...1.经常使用苹果电脑的小伙伴,和大家讨论时总会听到有人在说dock栏,不过还是有很多小伙伴不知道dock到底是什么意思,接下来小编就给大家普及一下。...2.dock一般指的就是苹果操作系统中的停靠栏,也就是苹果电脑桌面中最下方,类似于Windows系统下方的任务栏,不过要比Windows任务栏更加有趣味性。...3.dock的主要作用就是启动、切换运行中的应用程序,是一种很实用的功能界面,适用于Mac OS X操作系统。不过如今不同的操作系统中,都有很多不同的dock程序。...4.如今dock已经不仅仅是用在苹果电脑中了,苹果的所有产品都有这个功能了,比如说iPad中最下方,类似于毛玻璃的那一栏,就是dock系统。同理iPhone下方那一栏也是。
要安装最新的 Docker 版本,首先需要安装 apt-transport-https 支持,之后通过添加源来安装。要安装最新的 Docker 版本,首先需要安...
对接 直接进行半柔性对接,刚性对接不感兴趣 使用指令: dock6 -i dock.in 创建文件dock.in 参数详解: http://dock.compbio.ucsf.edu/DOCK_6/tutorials.../ligand_sampling_dock/ligand_sampling_dock.html 格式为: conformer_search_type...../3_grid/grid multigrid_score_secondary no dock3.5...20 rank_ligands yes 输入指令,进行运算: dock6...-i dock.in -o dock.out 输出文件: dock.out为总结的参数文件 anchor_and_grow_ranked.mol2为输出文件,里面有20个排名较高的mol 使用chimera
FF/ UUUUUUU/ CC/ CC\ SSSSSS/ FFFFFFFFF/ University of California at San Francisco, DOCK...-1 working_directory /Users/sujiaqi/Desktop/PyDrug.0.4/PyDrug_going/PyDrug_DOCK...0.75 ____________________File_Input____________________ receptor_file rec-1htp-dock-prep.mol2...box_file rec_box.pdb vdw_definition_file /Users/sujiaqi/Program/dock6
此外,HyperDock还支持对Dock中的文件夹、文档和网站进行快速预览和访问。它还允许用户自定义所需的快捷键和手势,以进一步提高工作效率。
生成Spheres 官方教程链接: http://dock.compbio.ucsf.edu/DOCK_6/tutorials/sphere_generation/generating_spheres.htm...步骤 接上文,已经完成了蛋白受体以及配体的准备,加氢加电荷 现在开始准备生成Spheres 生成Sphgen是DOCK的必须 Sphgen生成多组重叠的球体,以描述分子或分子表面的形状。...生成Sphgen (1)使用chimera的工具生成dms File -> Open -> rec-1htp-dock-prep.mol2.
DockView for Mac(Dock窗口预览工具)以下是DockView的一些特点:预览窗口:DockView允许用户在Dock中预览不同应用程序的打开窗口,无需切换到该应用程序即可通过鼠标悬停在...Dock图标上进行查看。
如果用户启用 Space 模式,只需把鼠标移到 Dock 正在运行的程序上,即可显示该应用程序属于第几个 Space。...HyperDock for Mac(Dock优化工具)
如何在没有 Ubuntu Dock 的情况下访问活动概览 如果没有 Ubuntu Dock,你可能无法访问活动的或已安装的应用程序列表(可以通过单击 Dock 底部的“显示应用程序”按钮从 Ubuntu...Dock 访问)。...方法 1: 移除 Gnome Shell Ubuntu Dock 包 摆脱 Ubuntu Dock 的最简单方法就是删除包。...Ubuntu Dock 只对你的桌面隐藏,当你进入叠加模式(活动)时,你仍然可以看到并从那里使用 Ubuntu Dock。...to Dock 的一个很好的替代品(Ubuntu Dock 是从 Dash to Dock 分叉而来的)。
HyperDock for Mac(Dock优化工具) 图片
DockView for Mac(Dock窗口预览工具)
readonly double ORIGNSIZE = 60; //宿主容器,即容纳SilverDock元素的父控件 internal SilverDock Dock..., Dock.MaxDistance, distance); item.Width = zoom * Dock.Size; item.Height...= zoom * Dock.Size; } } /// /// Handles the MouseLeave...) { totalWidth += item.Width; } Dock.ContentPanel.Width...SilverDockItem子元素 public void AddItem(SilverDockItem item) { item.Dock
当在C#项目开发中,在窗体界面的设置经常用到Dock属性值。这里一panel面板的Dock属性值为例描述其作用。...当容器中的控件的Dock属性设置为Fill时,可能会覆盖其他Dock属性为Top,Bottom,Right,Left的控件。...应用Dock时,越是底层的控件,其优先级越高。 版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。
今天说一说dock是什么意思?「建议收藏」,希望能够帮助大家进步!!! Dock从初级到高级全套教程 dock是iMac中很常见的一个功能,而且非常实用,那么dock到底是什么意思呢?...1.经常使用苹果电脑的小伙伴,和大家讨论时总会听到有人在说dock栏,不过还是有很多小伙伴不知道dock到底是什么意思,接下来小编就给大家普及一下。...image.png 3.dock的主要作用就是启动、切换运行中的应用程序,是一种很实用的功能界面,适用于Mac OS X操作系统。不过如今不同的操作系统中,都有很多不同的dock程序。...3.dock的主要作用就是启动、切换运行中的应用程序,是一种很实用的功能界面,适用于Mac OS X操作系统。不过如今不同的操作系统中,都有很多不同的dock程序。...image.png 4.如今dock已经不仅仅是用在苹果电脑中了,苹果的所有产品都有这个功能了,比如说iPad中最下方,类似于毛玻璃的那一栏,就是dock系统。同理iPhone下方那一栏也是。
0 前言 前面有一篇文章是介绍用 TranslucentTB 让任务栏变透明,要是有个类似 Mac 的 Dock(程序坞)就更好了。...安装好之后就能在屏幕顶部看到 Dock 栏了。 ? 3 配置/使用 点击程序设置进入 RocketDock 的设置页,把语言改成中文,勾选启动时自动运行。 ? 位置可以修改成在屏幕的别的地方。
Mac电脑Dock是什么意思,Dock怎么用?个人总感觉,不能原谅我们自己的惰性!遇到问题自己想办法独立解决,解决不了,可以想办法求助搜索引擎。如果连这也做不到,那实在是无可救药了!...一、Mac电脑Dock是什么意思 Dock的汉语意思是码头港口。在苹果Mac OS X操作系统(还有它的前辈们)中,是操作系统图形界面中,对应用程序进行相关操作的一种功能界面。...二、Dock怎么用 我们这里提供两种常见操作:设置显示位置和删除添加应用程序图标 1、设置Dock显示位置 第一步、点击桌面Dock上面的“系统偏好设置”图标,也可以点击左上角苹果图标,菜单中点击选择“...系统偏好设置” 第二步、在出现的“系统偏好设置”界面,点击个人项目下的Dock 第三步、在Dock界面,,您就可以设置Dock大小、放大比例、Dock在屏幕上的位置[屏幕左边、屏幕底部(默认)以及屏幕右边...2、删除添加应用程序图标 Mac电脑Dock是什么意思,Dock怎么用的内容,完全在于一个使用经验! 版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。
,注销进入的时候选择dock就OK了 ubuntu安装 apple的Glx-Dock / Cairo-Dock界面 点击打开链接 苹果的MAC OS里的dock任务栏让人印象深刻。...Dock是苹果公司Mac OS X操作系统,及其始祖NeXTSTEP和OPENSTEP操作系统中重要组成部分。在 Newton OS中也有dock概念的一些早期例子。...现在在不同操作系统中有很多不同的dock程序。 在ubuntu等linux系统中,现在已经可以非常方便的安装使用dock任务栏了,因为很多仿dock的程序都已经进入到ubuntu官方源中。...现在就推荐两款dock程序。 推荐一: Docky,一个号称花钱也买不到的最棒的docky。这个dock工具占资源小,比较稳定,也是我现在一直在使用的。...以后,Cario-Dock默认开机启动。这个时候,ubuntu自带的底部任务栏也可以删除了。 2,在Cario-Dock上右键点击设置,可以进行相关设置,这个dock可以进行更多的设置。
Dock栏就是Mac电脑屏幕下方的那一排快捷键,我们可以把自己常用的程序放到Dock上面,这样可以帮助我们快速的打开自己想要打开的文件和程序,默认情况下,OS X 的 Dock 置于屏幕的底部。...其实,我们不仅可以自定义 Dock 中显示的内容,而且你还可以调整 Dock 的大小、位置等等,下面给大家介绍几个关于Dock栏使用技巧,让大家使用Mac电脑更加得心应手。...3.点击按住该应用程序图标并将其拖到 Dock 中(当移动图标到 Dock 时,Dock 中的已有应用程序图标将向两侧移动来腾出空间)。 4.松手即可将应用程序将留在 Dock。...二、从 Dock 移除应用程序,文件夹和文件 在你尝试从 Dock 中移除应用程序之前,请先退出该应用程序,因为打开的应用程序图标将始终显示在 Dock 上。...三、 改变 Dock 的大小和位置 你可以调整 Dock 大小,调整图标的缩放效果(当你鼠标指针移到 Dock 的时候),调整 Dock 的位置(左边,屏幕下方或右边),调整最小化窗口的动画效果等。
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