啥是Renyi index
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Shannon熵在微生物领域应用的已经十分普遍了。Shannon index作为alpha多样性的表征手段广泛应用于微生物领域的分析中。...Renyi index在R中的实现
renyi函数计算参数α取不同值时的Renyi diversity或者相应的Hill number。...Usage
#renyi(x, scales = c(0, 0.25, 0.5, 1, 2, 4, 8, 16, 32, 64, Inf),hill = FALSE)
#scales: Renyi 公式中的...>persp(mod)
Hill和Renyi的关系为:Hill=exp(Renyi)当Renyi中的alpha=0,Hill中的阶数q=0,计算物种数量;alpha=q=1,计算shannon;alpha