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Linux:转录组分析1-建立工作目录

转录组测序分析本笔记主要是针对转录组测序分析专题上游分析,需要有Linux基础知识,目标是养成一个良好的分析习惯,熟悉转录组分析上游流程,重点是针对分析的结果能有自己的思考和解读能力。...cd ~## 1.建立数据库目录:在数据库下建立参考基因组数据库,注意命名习惯:参考基因组版本信息mkdir -p database/GRCh38.105## 2.建立项目分析目录mkdir projectcd...projectmkdir Human-16-Asthma-Trans # 注意项目命名习惯:物种-样本数-疾病-分析流程cd Human-16-Asthma-Trans# 建立数据存放目录mkdir...-p data/rawdata data/cleandata/trim_galore data/cleandata/fastp# 建立比对目录mkdir -p Mapping/Hisat2 Mapping.../Subjunc# 建立定量目录mkdir -p Expression/featureCounts Expression/Salmon# 查看整个分析目录准备结构tree├── data│   ├──

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    给Excel工作表建立目录

    有时候我们会在一个工作簿中建立很多工作表,怎样才能简单明了的管理工作表呢,当然能建一个目录最好了,这里我们就学习一种给工作表创建目录的方法。 1、在工作簿中新建一个工作表,命名为“目录”。...(A1))&T(NOW()) 3、在B1单元格中输入公式,并向下复制: =IFERROR(HYPERLINK(目录&"!...A1",MID(目录,FIND("]",目录)+1,99)),"") 现在可以看到效果了,单击目录中的工作表名称,就会自动跳转到相应工作表。...FIND("]",目录)部分,用于查找符号"]"在自定义名称“目录”计算结果中的位置。...MID(目录,FIND("]",目录)+1,99)部分,从“目录”中的"]"符号后一个字符处取值,取值长度为99个字符,这里的99可以写成任意一个较大的数值。

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    Linux 内核】Linux 内核源码目录说明 ② ( drivers 目录 | fs 目录 | include 目录 | init 目录 | ipc 目录 | kernel 目录 )

    文章目录 一、drivers 目录 二、fs 目录 三、include 目录 四、init 目录 五、ipc 目录 六、kernel 目录 一、drivers 目录 ---- drivers 目录中存储了...驱动程序 相关代码 , 如 USB 总线驱动程序 , PCI 总线驱动程序 , 显卡驱动程序 , 网卡驱动程序 等 ; 二、fs 目录 ---- fs 目录中存储了 虚拟文件系统 ( Virtual...目录 ---- include 目录中存储了 内核源码 依赖 的 大部分头文件 代码 ; include 目录中存储了 虚拟文件系统 ( Virtual File System ) 相关代码 ; 四、...init 目录 ---- init 目录中存储了 Linux 内核的初始化 相关代码 ; 该 初始化代码 关联到了 内存的各个组件 的入口 ; 五、ipc 目录 ---- ipc 目录中存储了 进程间通信...相关代码 ; 如 : 信号量 , 共享内存 等 ; 六、kernel 目录 ---- kernel 目录中存储了 内核核心代码 ; 其中包含了 进程管理 , IRQ 中断 等模块 ;

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    Linux 内核】Linux 内核源码目录说明 ① ( arch 目录 | block 目录 | certs 目录 | crypto 目录 | Documentation 目录 )

    文章目录 一、arch 目录 二、block 目录 三、certs 目录 四、crypto 目录 五、Documentation 目录 在上一篇博客 【Linux 内核】Linux 内核源码结构 ( 下载...Linux 内核源码 | 使用 VSCode 阅读 Linux 内核源码 ) 中 , 使用了 Visual Studio Code 查看 Linux 内核源码 , 本篇博客开始分析 Linux 内核源码结构...; 一、arch 目录 ---- arch 目录是 针对 不同 CPU 体系架构平台 的代码 , 将 与 平台 相关的代码 放在该目录中 , 如某些代码只针对 x86 架构的平台 , 那么放在 arch.../x86 目录下 ; 每种体系结构 , 都有 相应的子目录 , 如 arm , arm64 分别是 arm 32 位和 64 位平台 ; 二、block 目录 ---- block 目录 , 是子系统目录..., 其中存储了 块设备驱动 相关代码 ; 三、certs 目录 ---- certs 目录中存储了 认证 和 签名 相关代码 ; 四、crypto 目录 ---- crypto 目录中存储了 内核中常用的

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    Linux 内核】Linux 内核源码目录说明 ③ ( lib 目录 | LICENSES 目录 | mm 目录 | net 目录 | samples 目录 | scripts 目录 )

    文章目录 一、lib 目录 二、LICENSES 目录 三、mm 目录 四、net 目录 五、samples 目录 六、scripts 目录 一、lib 目录 ---- lib 目录中存储了 C 语言标准库的子集...相关代码 ; 二、LICENSES 目录 ---- LICENSES 目录中存储了 开源许可协议 相关协议文本 ; 该目录拿下都是文本文件 ; 三、mm 目录 ---- mm 目录中存储了 内存管理...( Memory Management ) 相关代码 ; 四、net 目录 ---- net 目录中存储了 网络协议 相关代码 ; 如 : TCP , WIFI , IPV4 , IPV6 等 ;...五、samples 目录 ---- samples 目录中存储了 Linux 内核参考示例代码 ; 六、scripts 目录 ---- scripts 目录中存储了 内核 编译 配置 相关脚本 ;

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    Linux目录结构

    Linux 目录结构 装完Linux,首先需要弄清Linux 标准目录结构 / root —?启动Linux时使用的一些核心文件。如操作系统内核、引导程序Grub等。 home —?...设备文件目录 etc — 配置文件 skel — home目录建立,该目录初始化 sysconfig — 网络,时间,键盘等配置目录 var file lib — 该目录下的文件在系统运行时,会改变...一般情况下这个目录是空的,而在我们将要挂载分区时在这个目录建立目录,再将我们将要访问的设备挂载在这个目录上,这样我们就可访问文件了。.../boot:放置linux系统启动时用到的一些文件。/boot/vmlinuz为linux的内核文件,以及/boot/gurb。...Linux Directory Structure 2.?Linux’s directory structure 3.?Linux目录结构

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    Linux目录结构

    简介 由于 Linux 系统是开源的,存在众多不同的发行版,为了防止不同的 Linux 发行版的系统目录结构大相径庭,以至于用户从一个发行版迁移到别的发行版后不会使用,FHS(Filesystem Hierarchy...目前主流的 Linux 发行版基本都遵循 FHS 标准,因此它们的系统目录结构也大致相同。 了解 Linux 文件目录结构的标准和每个目录的详细功能,对于用户用好 Linux 系统至关重要。 2....2.2.1 / 目录目录是整个系统最重要的一个目录,因为不但所有的目录都是由根目录衍生出来的,同时根目录也与开机/还原/系统修复等动作有关。...早期 Linux 在设计的时候,若发生问题时,救援模式通常仅挂载根目录而已,因此有五个重要的目录被要求一定要与根目录放置在一起,那就是 /etc、/bin、/dev、/lib、/sbin 这五个重要目录...现在许多的 Linux 发行版由于已经将许多非必要的文件移出 /usr 之外了,所以 /usr 也是越来越精简。

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    linux-目录

    先看图 根文件系统: linux识别的第一个与根直接关联的文件系统。 FHS:LSB组织定义的LINUX发行版基础目录命名法则及功用规定。...filesystem hierarchy standard,文件系统层级标准 linux目录 目录 描述 / 只有一个跟 \ ;不是一一对应的;第一层次结构的根、整个文件系统层次结构的根目录。...在单用户模式下,你需要使用的常见Linux命令都位于此目录下。系统的所有用户使用的命令都设在这里。...但是,在这个目录下的linux命令通常由系统管理员使用,对系统进行维护。例如:ifconfig命令 /boot 引导加载程序相关的文件。...这个目录通常会在分割槽的最顶层存在,例如你加装一个硬盘于/disk中,那在这个系统下就会自动产生一个这样的目录/disk/lost+found /mnt 挂载目录;临时安装目录,系统管理员可以挂载文件系统

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    Linux 目录详解

    和 Windows 一样,Linux 也有目录的概念。系统中众多的文件需要借助到目录进行存储与管理。我们下面对 Linux 系统中的目录结构以及经常使用到的概念进行一个完整介绍。...Linux 系统目录结构 在 Windows下,系统把硬盘划分为不同的磁盘分区,每个磁盘分配一个不同的盘符,比如 C:\、D:\ 等等。...而 Linux 则是将整个硬盘统一管理,整个系统只有一个根目录 "/",所有的文件和目录都是在这个根目录下,它表示 Linux 文件系统的起点。...为了规范,绝大多数的 Linux 发行版本中 (参见 《这么多Linux版本,你究竟该怎么选择?》)系统目录的机构都保持了一致。以 CentOS 7 为例,下面介绍一下常用的系统目录和它们的作用。...最后 本文介绍了 Linux 系统目录的结构和它们的用途,目录相关的概念,以及最常用到的相关命令。

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    Hadoop主从节点之间建立SSH密码登录

    在Hadoop启动以后,namenode是通过SSH(Secure Shell)来启动和停止各个节点上的各种守护进程的,这就需要在节点之间执行指令的时候是不需要输入密码的方式,故我们需要配置SSH使用密码公钥认证的方式...namenode生成密钥: $ ssh-keygen -t dsa -P '' -f ~/.ssh/id_dsa 执行上述命令后会出现如下图: image.png 这时候会在~/.ssh/目录下生成 id_dsa.pub...的机器中登陆进去看下,这个文件是否复制过去了,命令如下: cd  ~/ssh ls image.png 也可以先将master结点的~/.ssh/id_dsa.pub文件复制到slave结点的~/.ssh/目录下...ssh         然后在slave结点上执行下面的命令: $ cat ~/.ssh/id_dsa.pub >> ~/.ssh/authorized_keys         最后,我们验证是否可以密码登陆

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