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如何检测遗传相关的显著性:LRT检验操作方法

软件实现遗传相关计算 3.1 数据格式 前三列是系谱,有3个性状: y1, y2, y3 , 想要计算y1和y3的遗传相关,并用LRT检验显著性 ? 3.2 计算加性方差逆矩阵 ?...3.3 构建模型 LRT检验中,需要构建两个模型,一个考虑加性协相关的模型(us矩阵),一个不考虑加性协相关的模型(diag矩阵),然后使用LRT检验做分析,查看显著性,即为相关的显著性分析。...软件实现遗传相关显著性LRT检验 定义: ? 代码实现: ? 结果可见,遗传相关不显著。 5....示例代码汇总 软件:asreml4-r 里面的vpredict函数可以替换pin函数,里面的lrt.asreml可以进行两模型的LRT检验。...trait_y3:y3 289.76086 399.43870 0.7254201 P 0.2 # 检测遗传相关的显著性 lrt.asreml(mod1,mod2) # Likelihood

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