— 以下是一个MySQL执行拼接字符串语句实例:– 为需要拼接的变量赋值SET @VARNAME= — 以下是一个MySQL执行拼接字符串语句实例: — 为需要拼接的变量赋值 SET @VARNAME...=’李’; — 拼接字符串,其中?...是执行拼接字符串语句的参数,@TestName是结果值 SET @SQLStr0=CONCAT(‘SELECT TestName INTO @TestName FROM test.t_TestTable...AND TestName LIKE “%’,@VARNAME,’%” LIMIT 1;’); — 预处理拼接好的字符串 PREPARE SQLStr1 FROM @SQLStr0; — 为参数赋值 SET...@Test_ID=1; — 使用参数执行拼接好的字符串语句 EXECUTE SQLStr1 USING @Test_ID; — 释放拼接的字符串语句 DEALLOCATE PREPARE SQLStr1
SAM ( Sequence Alignment Map ) 文件是reads比对到基因组后得到的结果文件，记录了reads mapping到基因组的各项信息。...BAM文件是SAM文件的二进制格式，保留SAM文件全部信息的同时极大压缩了SAM文件的体积，我们比对完成后获得的一般都是BAM文件。...@PG：比对时使用的工具指令。 @RG：样本信息。 @CO：其他注释信息。 比对结果主要包括11列信息： ? ? 1. QNAME：reads名称。 2. FLAG：reads比对情况。...RNAME：比对至参考序列的名称。 4. POS：比对到的位置。 5. MAPQ：比对质量。 6. CIGAR：比对情况信息。 7. RNEXT：与之配对的另一条reads所在的参考序列名称。"...除了这11列信息外，还有一些其他信息： NH:i:n 表示reads比对到参考序列位置的个数。 AS:i:n 表示比对得分。
就是全部比对上的，*就是存在gap的位点 当然，如果比对的序列很多，还可以增加logo # 示例代码 msaPrettyPrint(myFirstAlignment, output="asis", y=...接下来才是重点 上面函数使用很简单，关键是我们得到了比对的结果，怎么提取我想要的位点呢 其实之前biostar上也有人提出了这个问题：https://www.biostars.org/p/467870/...也就是说，他之前感兴趣的位点是82位的AA，想要看看比对后这个AA对应着哪个AA。...但是他发现，比对后原来的AA位置变成了95。所以不知道应该怎么去统计 ? 这里给出我自己的理解 首先明确，比对前后的差异在什么地方？...=》原来可以比对的当然能对应，但是不能比对的分了两种情况：一个是硬比对（比如D比对到了N）；一个是软比对，即增加了gap（比如D 比对到. ）。 麻烦就出在gap身上，原来序列没有，比对过程加上去。
本文介绍如何求解两个字符串的最长公共子字符串。 其实这个问题可以放在序列比对专题的最开始，只是笔者是个新手，所以当初只是照《生物序列分析》教材的进度写的，教材是直接从全局比对开始讲的。...点击此处，等你留言 动态规划解法的代码 具体代码如下： （代码是在《序列比对(一)——全局比对Needleman-Wunsch算法》一文代码的基础上修改，没有优化，但足以说明本文问题了。）...i <= m; i++) aUnit[i][0] = 0; for (j = 1; j <= n; j++) aUnit[0][j] = 0; // 将字符串都变成大写...aUnit[i][j] > max) max = aUnit[i][j]; printf("max score: %d\n", max); // 打印最优比对结果
null and tagType == 0 "> LEFT JOIN ccc AS b ON b.tag_body_id = a.id 方案二：将数字转成字符串
, ) mysql_cursor = mydb.cursor() # 获取当前最小 最大的id，用于后续的循环比对 get_min_max_sql = 'SELECT min(id),max(id)...记录差异行数量 diff_count = 0 while stop_id < max_id + configs.step: # 加一个步长进去，防止因为step过大，导致有遗漏的id # 拼接出比对的...stop_id = stop_id + configs.step stop_time = time.time() time_dur = stop_time - start_time print(f"比对...' mysql_port = '3306' mysql_user = 'dts' mysql_pass = 'dts' mysql_db = 'sbtest' mysql_tb = 'sbtest1'...运行效果 走公网流量情况下，9k记录，在不同step下的耗时比对： step = 100 18.5s step = 500 5s step = 1000 3.7s step = 2000
本文介绍了基序发现问题和中间字符串问题。 引言：DNA调控元件 我们知道，DNA调控元件往往是一段相似的DNA序列。理想情况下这些序列完全一致，比如下面这样： ?...由此可以引出两个问题，即基序发现问题和中间字符串问题。 一、基序发现问题 要说明基序是什么，首先介绍一下序列剖面（Profile）。 ? ?...二、中间字符串问题 同样地，要讲清楚中间字符串问题，我们首先给出一些符号： ? 三、两个问题是等价的 我们可以证明计算式子（1.2）和计算（2.2）是一回事。
---+ | Leshami | http://blog.csdn.net/leshami | +---------+------------------------------+ 二、基于无索引情形比对...表上统计信息，mysql统计信息不是很准确，如下图，基于bigint数据类型占用的磁盘你空间与char类型占用磁盘空间等同。...image.png 二、基于索引情形比对 下面为过滤条件列mobile添加索引列，观察性能表现 CREATE INDEX uk_mobile ON tb_char(mobile); CREATE...uk_mobile ON tb_bigint(mobile); 如下图所示，索引占用磁盘开销是bigint数据类型最小，基于索引查询的时间，三者相当 image.png 三、基于索引列分组聚合情形比对...为了更好比对性能，下面基于索引列进行分组以及聚合运算，可以看出依旧是bigint数据类型性能最佳 image.png 四、最终比对结果及结论 最终完整结果图： image.png
使用Python写了个最基本的表结构比对告警脚本， 目前这个版本只能做到发现表结构存在差异的表。后续考虑再迭代下，看如何把差异的表和列的明细也报出来。...configs.py 内容如下： # MySQL数据源的信息 mysql_source_host = "localhost" mysql_source_port = "3306" mysql_source_user...dest_tb_set): # s1.add(i[0]) # 如果要全部都报出来，用下面这种写法 s1.add(i[0]) print('表结构（只比对了列和索引...，未包括字符集和排序集）检查完成，存在差异的表如下 ---> ', s1) else: print('表结构（只比对了列和索引，未包括字符集和排序集）检查完成，没有发现存在差异的表') stop_time...= time.time() time_dur = stop_time - start_time print(f"耗时 {time_dur} 秒") readme 内容如下： 上面程序里面，我们没有比对表中的字符集和排序集
---+ | Leshami | http://blog.csdn.net/leshami | +---------+------------------------------+ 二、基于无索引情形比对...表上统计信息，MySQL统计信息不是很准确，如下图，基于bigint数据类型占用的磁盘你空间与char类型占用磁盘空间等同。...-- 下面执行以下三条SQL语句比对性能 SELECT * FROM tb_char WHERE mobile = '17998335908'; SELECT * FROM tb_varchar WHERE...二、基于索引情形比对 下面为过滤条件列mobile添加索引列，观察性能表现 CREATE INDEX uk_mobile ON tb_char(mobile); CREATE INDEX uk_mobile...为了更好比对性能，下面基于索引列进行分组以及聚合运算，可以看出依旧是bigint数据类型性能最佳 四、最终比对结果及结论 最终完整结果图： 结论： 1）满足需求的前提使用更小长度的数据类型(更少磁盘占用
前文介绍了中间字符串的算法和代码，但是使用分支定界策略时所使用的界限是很宽松的。本文给出了一个更紧的界限。...对分支定界法的简单回顾 前文《序列比对（21）中间字符串问题的算法及实现代码》介绍了中间字符串的算法和代码，但是使用分支定界策略时所使用的界限是很宽松的。分支定界法的伪代码如下： ?...TotalDistance(v, DNA)的下界 */ void findMedianStr(Seq* mulSeq, const int t, const int l); /* 寻找中间字符串...printf("time spent: %s\n", tstr); free(tstr); return 0; } char* sec2time(time_t t) { /* 将秒数转化为时间字符串...} } return minDist; } void findMedianStr(Seq* mulSeq, const int t, const int l) { /* 寻找中间字符串
前文介绍了基序发现问题和中间字符串问题。本文给出了中间字符串的算法和实现代码。 中间字符串问题的简单算法及伪代码 《序列比对（20）基序发现问题的算法及实现代码》给出了基序问题的算法和实现代码。...本文将介绍中间字符串问题的算法，并给出实现代码。 ? 由于要遍历所有可能的起始位点，如前文《序列比对（20）基序发现问题的算法及实现代码》一样，我们采用树结构以及DFS（深度优先搜索）。...为identity.txt文件中的7条序列计算中间字符串 ? 为mutated.txt文件中的7条序列计算中间字符串 分支定界法的结果如下： ?...为identity.txt文件中的7条序列计算中间字符串 ? 为mutated.txt文件中的7条序列计算中间字符串 具体代码 上文及前文都假定多条序列的长度是一样的，但是实际情况并不总是如此。...代码实现过程中考虑到这一点，做了改进，使得多条序列长度不一致的情况下也可以用此代码来计算中间字符串。
同时，MySQL 是支持前缀索引的，也就是说，你可以定义字符串的一部分作为索引。默认地，如果你创建索引的语句不指定前缀长度，那么索引就会包含整个字符串。...接下来，我们再看看下面这个语句，在这两个索引定义下分别是怎么执行的。...但是，遇到前缀的区分度不够好的情况时，我们要怎么办呢？ 比如，我们国家的身份证号，一共 18 位，其中前 6 位是地址码，所以同一个县的人的身份证号前 6 位一般会是相同的。...就只考虑登录验证这个行为的话，你会怎么设计这个登录名的索引呢？ 问题解答：由于这个学号的规则，无论是正向还是反向的前缀索引，重复度都比较高。...其实这个就是一种 hash，只是它用了最简单的转换规则：字符串转数字的规则，而刚好我们设定的这个背景，可以保证这个转换后结果的唯一性。
日常工作有时候需要比对不同MySQL或者其他数据源的差异情况，如果是主从环境可是用percona-toolkit工具包，如果是非主从环境的数据比对，就需要我们自行写脚本实现。...data_diff用于比对mysql和mysql/pg/es之间的数据差异，mysql2mysql和mysql2pg需要确保二者的列的顺序是一致的，mysql2es二者的列顺序无所谓。...说明mysql2mysql 用于源端和目标端都是MySQL的数据比对场景。mysql2pg 用于源端是MySQL，目标端是PG的数据比对场景。...mysql2es 用于源端是MySQL，目标端是ES的数据比对场景。它会将差异的es id输出到redis queue中。...redis==3.5.3性能step为1000时，每秒大约可以比对2.5k条记录不足mysql2pg的脚本，不能处理bit类型，会出现误判的情况mysql2pg的脚本，暂时不具备where条件的功能，
问题：要求比较’100%’和’95%’的大小 实践：mysql> SELECT ‘100%’ > ‘95%’; +—————-+ | ‘100%’ > ‘95%’ | +—————-+ | 0 | +—...————-+ 1 row in set (0.00 sec) 发现’100%’竟然小于’95%’ 原因：因为是字符串，字符串比较是递归字符串里面的每个字符进行比较，先去第一个,1和9比较大小，则1比9小...，输出结果；如果相等，则继续进行下一个字符比较 如果想要对这种类型的字符串进行大小比较，该怎么做呢？...DATETIME 浮点数 : DECIMAL 整数 : SIGNED 无符号整数 : UNSIGNED 因为要转换为数字类型,如果是’100.12%’这种格式，最好是用decimal 新的比较方法如下：mysql...DECIMAL(10,2)) >CAST(‘99.6%’ AS DECIMAL(10,2)) bj; +—-+ | bj | +—-+ | 1 | +—-+ 1 row in set (0.00 sec) mysql
MySQL 字符串截取相关函数： 1、从左开始截取字符串 left(str, length) 说明：left(被截取字段，截取长度) 例： select left(content,200) as abstract...from my_content_t 2、从右开始截取字符串 right(str, length) 说明：right(被截取字段，截取长度) 例： select right(content,200) as...str返回一个子字符串，起始于位置 pos。...带有len参数的格式从字符串str返回一个长度同len字符相同的子字符串，起始于位置 pos。 使用 FROM的格式为标准 SQL 语法。也可能对pos使用一个负值。...假若这样，则子字符串的位置起始于字符串结尾的pos 字符，而不是字符串的开头位置。在以下格式的函数中可以对pos 使用一个负值。 版权声明：本文内容由互联网用户自发贡献，该文观点仅代表作者本人。
0x01 在MySQL数据库中，+在多数情况下是加运算符。两个字符串拼接不能直接使用+拼接，否则会把字符串转成数字进行运算。 0x02 在MySQL中字符串的拼接有两种方式。...使用 CONCAT 函数 CONCAT 函数可以接受多个字符串参数，并将它们连接为一个字符串。...., stringN) 示例： SELECT CONCAT('Hello', 'World') AS Result; 这个查询将返回 'HelloWorld'，因为它将字符串 'Hello' 和 'World...使用双竖线||运算符 MySQL 中也支持双竖线||运算符来连接字符串，和其他一些 DBMS 类似。...示例： SELECT 'Hello' || 'World' AS Result; 不过需要注意的是，双竖线 || 在 MySQL 中并不是默认启用的运算符，需要进行如下配置： SET sql_mode=
前言 友友们大家好，我是你们的小王同学 今天给大家带来的是Mysql——字符串函数 希望能给大家带来有用的知识 小王的主页：小王同学 小王的gitee：小王同学 小王的github：小王同学...LTRIM (' 小王教育')from DUAL; -- 以首字母小写的方式显示所有员工emp表的姓名 -- 方法1 -- 思路先取出 ename的第一个字符，转成小写的 -- 把他和后面的字符串进行拼接输出即可...new_name from emp; select concat(LCASE(LEFT(ename,1)),SUBSTRING(ename,2))AS new_name from emp; 以上就是小王带给大家字符串函数得
，则结果为NULL 3.替换字符串的函数insert(s1,x,len,s2) 返回字符串s1,其子字符串起始于x位置和被字符串s2取代的len字符，如果x超过字符串长度，那么返回值为原始字符串,如果len...(s1 from s) 删除字符串s中两端所有的子字符串s1 7.重复生成字符串的函数repeat(s,n) 返回一个由重复的字符串s组成的字符串,字符串s的数目等于n,若n小于等于0，则返回一个空字符串...select repeat('mysql',3) = mysqlmysqlmysql 8.空格函数space(x) 和替换函数replace(s,s1,s2) space(x) 返回一个由n个空格组成的字符串...replace(s,s1,s2)使用字符串s2替代字符串s中所有的字符串s1 9.比较字符串大小的函数strcmp(s1,s2) 若所有的字符串均相同，则返回0, 10.获取子串的函数substring...12.字符串逆序的函数reverse(s) 将字符串s反转，返回的字符串的顺序和s字符串顺序相反 13.返回指定位置的字符串的函数 在elt(n,s1,s2,s3,..)若N=1,则返回值为字符1，若
Mysql字符串截取函数：left()、right()、substring()、substring_index()。...从左开始截取字符串： 用法：left(str, length)，即：left(被截取字符串， 截取长度) SELECT LEFT('www.yuanrengu.com',8); -- www.yuan...从右开始截取字符串 用法：right(str, length)，即：right(被截取字符串， 截取长度) SELECT RIGHT('www.yuanrengu.com',6); -- gu.com...截取特定长度的字符串 用法： substring(str, pos)，即：substring(被截取字符串， 从第几位开始截取) substring(str, pos, length)，即：substring...(被截取字符串，从第几位开始截取，截取长度) 从字符串的第9个字符开始读取直至结束 SELECT SUBSTRING('www.yuanrengu.com', 9); -- rengu.com 从字符串的第
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