Introduction The W3C OWL 2 Web Ontology Language (OWL) is a Semantic Web language designed to represent...The term ontology has a complex history both in and out of computer science, but we use it to mean a...to as the domain of interest or the subject matter of the ontology)....Still, technically, databases provide a viable backbone in many ontology-oriented systems. 3....Statements that are made in an ontology are called axioms in OWL 2, and the ontology asserts that its
这就像基因的命名和功能一样,于是我们开发出了一套本体论(Ontology):GO(Gene Ontology )。...显然是可以的,也是必要的,今天运来小哥哥就拉着你来看看细胞本体论:Cell Ontology。...我们使用本体论(Ontology)来表示概念领域中使用的术语的系统组织。细胞本体(Cell Ontology)是一种图形化的数据结构,将精心注释的术语作为节点,并按照惯例定义术语之间的语义关系作为边。...想象Cell Ontology的应用场景,最直接的类比就是GO了。所以,是时候应用一套规范的语义来描绘细胞类型了。.../cl.html [11] Gene Ontology overview: http://geneontology.org/docs/ontology-documentation/ [12] Cell
Gene Ontology (GO)项目正是为了能够使对各种数据库中基因产物功能描述相一致的努力结果。...引用GO 当使用GO资源时,请引用以下文献: Gene Ontology: tool for the unification of biology....The Gene Ontology Consortium (2000) Nature Genet. 25: 25-29. 当引用亚数据库资源时,请参考GO的 publication list 。
Gene Ontology, 简称GO, 是最常用的基因功能注释数据库之一。...Acids Research 链接如下 https://academic.oup.com/nar/article/40/D1/D940/2903651 官网如下 http://www.disease-ontology.org...和Gene Ontolgy类似,Disease ontology简称DO, 所有的疾病信息也是采用了一个有向无环图的拓扑结构,所有数据库中的信息存储了一个obo文件中供下载,链接如下 http://www.disease-ontology.org...同时该网站也体用了API, 方便应用程序获取信息,API URL的格式如下 http://www.disease-ontology.org/api/metadata/DOID:4 直接用DOID进行查询
GOA全称Gene Ontology Annotation, 是EMBL-EBI构建的一个GO注释信息的数据库。...该数据库提供了以下3种生物分子的GO注释信息 来自UniProtKB数据库的蛋白 来自RNACentral数据库的RNA 来自Complex数据库的蛋白复合物 GOA数据库的注释信息不仅包括由Gene Ontology
值此新春佳节,Ontology 2020年新版路线图重磅发布!未来的一年,我们将着眼于更远大的目标,昂首引领区块链技术新浪潮。...Ontology 新版路线图 Ontology 2020年新版路线图发布 关键技术点 异构跨链:继续探索异构跨链的解决方案,打破区块链数据孤岛,实现价值互联互通; Layer 2:继续探索链下扩容技术的解决方案...,以应对需要大量交易上链的业务应用场景; Oracle:继续探索区块链预言机的解决方案,为 Ontology 生态应用提供更为丰富、真实和可信的外部数据; VM:混合虚拟机运行机制将支持不同类型的智能合约无缝交互...;Wasm 虚拟机将支持 JIT 执行模式,可极大提升合约解析验证和执行的速度; ONTFS:Ontology 分布式存储服务将以低成本支持去中介化的数据存储及其证明,以及分布式储存节点的治理,为 Ontology...商务应用提供完整的、链上链下的数据桥接功能; 治理合约:以智能合约的形式实现投票人决议,以确保网络治理过程的安全性和可追溯性; 新版 ONT ID / DDXF 协议:Ontology 去中心化身份标识协议
正值本体 Ontology 四周年之际,来写一写这条在 Web3、DID、声誉等方面都早早开始布局的低调公链。...在这之前,我们先谈谈 Web3 的发展历程,并从中找到 Ontology 的发展契机与目标。 *图源:网络 Web1 是互联网的内容时代。...对于如何解决上面的这个问题,Ontology 搭建了一个去中心化的信任体系产品矩阵,最近还推出了 OWN(Ontology Web3 Network) Infrastructure,为 Web3 应用提供通用性基础协议和应用...Ontology 搭建了一条高效、兼容与安全的公有链,通过自有的 VBFT 共识机制和 Optimistic Rollup 的 Layer2 解决方案,平台每秒可处理超过5,000笔链上交易。...并且,Ontology 已经实现兼容大部分常用虚拟机,支持比较广泛的智能合约语言,因此可以实现与大部分平台的无缝、低成本迁移。
所以今天就来了解一下鼎鼎大名的GO ONTOLOGY数据库:Gene Ontology Resource: http://geneontology.org/ 背景数据集介绍 GO ONTOLOGY是一个基于已经发表的的研究结果...GO ONTOLOGY将物种中基因的功能分成了三个部分:分子功能 (Molecular Function, MF);细胞组分 (Cellular Component, CC);生物过程 (Biological...比如「细胞周期调控」这个条目就属于「细胞周期」的大条目当中 ---- 数据库使用 在GO ONTOLOGY中,可以直接输入想要检索的内容 (某一个关键词或者基因名)。...同样可以进行筛选 ---- 总的来说 以上就是关于GO ONTOLOGY数据库的主要介绍。通过对GO ONTOLOGY的介绍,首先可以了解关于BP,CC以及MF的具体信息。
Gene Ontology, 中文名叫做基因本体论,采用GO terms描述基因产物的功能, 并且提供了不同GO terms 之间的关系。...所有GO Terms的信息可以通过以下链接进行下载 http://www.geneontology.org/page/download-ontology ?
对于一个数据表而言,首先我们需要知道表头信息,就可以通过columns和keytypes函数来访问得到,示例如下 > keytypes(GO.db) [1] "DEFINITION" "GOID" "ONTOLOGY..." "TERM" > columns(GO.db) [1] "DEFINITION" "GOID" "ONTOLOGY" "TERM" 从以上代码的结果可以看出,GO.db...函数来实现,示例如下 > k <- keys(GO.db, keytype = "GOID")[1:3] > select(GO.db, keys = k, columns = c("TERM","ONTOLOGY...select()' returned 1:1 mapping between keys and columns GOID TERM ONTOLOGY...mitochondrial inheritance> get("GO:0000001", GOTERM) GOID: GO:0000001 Term: mitochondrion inheritance Ontology
创建虚拟机 登录 Azure Portal,点击 Create a resource,搜索 ont,选择 ont_dev_platform 这就是一个由 Ontology 发布的事先配置好的虚拟机镜像...其中 Region 我选择距自己位置最近的 East Asia (中国香港)数据中心,Size 保留默认,这是 Ontology 在 ARM 模板里预先推荐的配置。.../ontology account list -v 前面的 1 是该钱包的 ID,后面是钱包地址 给自己转 10000 块钱 ....结语 Azure 可以帮助我们在数分钟内完成 Ontology 区块链环境搭建,我们只需要关心最终的区块链开发,直接使用该平台,而无需了解操作系统和服务器软件安装细节,节约了大量的时间和精力。...参考资料:https://github.com/ontio/ontology/blob/master/docs/specifications/ont_dev_platform_azure.md
前言 上一期我们详细介绍了 Ontology Layer 2的工作流程。...主要包括3个主体部分,Ontology Deposit 到 Layer 2、Layer 2 Withdraw 到 Ontology 以及 Layer 2交易和安全性保证。...作为最新发布的 Aristotle 2020路线图中 Ontology 2.0技术体系的重要组成部分,连同此前发布的跨链、Wasm-JIT、Multi-VM 等多项前沿核心技术,Ontology Layer...0 1 协议 & 白皮书 0 2 测试网 0 3 协议基本概述 0 4 待解决问题 0 5 综合对比 经过协议、上线测试网及主网情况和待解决问题等几个方面的比较,我们不难发现,Ontology Layer
新一代分布式链网体系“本体网络”的许可链开源项目Ontology Zero入选国家工信部区块链开源项目计划,将助力国家区块链技术与产业发展。...本体网络的开源许可链项目Ontology Zero,于近日正式纳入工信部“分布式应用账本”(DAppLedger)进行孵化。...Ontology Zero是本体网络面向企业级,开源、自主、可控、可配置的分布式账本技术框架,以开放心态链接各类区块链底层技术解决方案,标准化行业解决方案提供Dapp As a Service (DAAS...Ontology Zero经由万达网络、分布科技、复星金服等4家成员单位发起入驻孵化,项目代码与国外开源项目重合度低于5%,自主可控程度名列前茅,已有超过 50名社区成员向本体项目开展了700多次的代码贡献...重要通知 本体网络(Ontology Network)开启“邮件订阅”! 您将第一时间获得本体网络的重要公告和新闻!
在读懂基因本体论(Gene Ontology)前,我们先看看什么是本体论: 本体论(Ontology )是探究世界的本原或基质的哲学理论 。...基因本体论(Gene Ontology)包含生物学领域知识体系本质的表示形式,本体通常由一组类(或术语或概念)组成,它们之间具有关系。...GO本体间相关http://geneontology.org/docs/ontology-relations/。 某些基于图的软件可能需要一个根节点。
https://ethereum.org/zh/developers/docs/evm/ Ontology EVM 简介 Ontology EVM 是一个兼容以太坊生态的虚拟机,采用原生的数字资产(ONG...而合约账户的键值对数据和现有的 Ontology 版本保持一致,既兼顾了 Ethereum 功能,也保证了 Ontology 本身的兼容性。...2)虚拟机层 在现有的多虚拟机体系之上,Ontology 可以方便地添加 EVM 支持。...我们提供了现有 NeoVM、Wasm 虚拟机对 Ontology EVM 调用的支持,方便已有的合约应用和 EVM 应用的交互,同时为了避免对 EVM 进行扩展分叉,Ontology EVM 暂时没有提供...3)交易结构 Ontology 的交易结构本身是一个可扩展的设计,可以按需添加交易类型的支持。
而就在本体 Ontology 2.0 发布前夕,Ontology v1.8.0于10月29日重磅发布。经过数月在测试网上的稳定运行,Wasm 功能也正式登陆了主网。...在往期的技术视点中,我们已推出多部 Ontology Wasm 相关教程,社区伙伴们纷纷表示受益匪浅。本期我们将介绍如何基于 Wasm合约使用 Runtime API,相信你会有所收获。...图 | 网络 Runtime API 简述 Ontology Wasm 合约开发工具库 ontology-wasm-cdt-rust 里面 Runtime 模块封装了合约与 Ontology 链交互的...Ontology 率先支持 Wasm 合约将会大大提高混合虚拟机的性能,也将吸引众多不同语言的技术开发者加入本体社区,共同推进区块链技术的研发,丰富本体强大的技术生态。
近日,新一代公有基础链 & 分布式信任协作平台——本体(Ontology)在其最新底层版本 Ontology 2.0 中推出了全球执行速度最快的区块链 Wasm 虚拟机 Ontology Wasm-JIT...与同样采用高速 Wasm 的 EOS 公链相比,Ontology Wasm-JIT 在性能上展现出领先优势。 下表展示的是基于 Ontology 和 EOS 开源代码虚拟机上的同环境测试。...由于 EOS 无 gas 收费模式,本次测试基于 Ontology 无需计费的版本进行。...开发者在使用 Ontology 各项技术时能够在更短时间内获得更高性能,大大提升开发效率。 Ontology Wasm-JIT 和解析执行版本完全兼容,对开发者是透明且友好,无需投入任何新的学习成本。...目前,Ontology Wasm-JIT 已经上线本体测试网,开发者可以便捷进行体验。
in.triple的文件格式 "... "land i Nord-Europa... "pagilian idiay... "civitas Europae... "מדינה"@he .
基本介绍 作为最新发布的 Aristotle 2020路线图中 Ontology 2.0技术体系的重要组成部分,连同此前发布的跨链、Wasm-JIT、Multi-VM 等多项前沿核心技术,Ontology...[b0i2naw3de.png] 工作流程 Ontology Layer 2主要包括3个主体部分,Ontology Deposit 到 Layer 2、Layer 2 Withdraw 到 Ontology...这个交易可以和 Ontology 主链交易格式一致,也可以有所不同。...Deposit 到 Layer 2 [qv3cvb9wdj.png] 用户首先在 Ontology 主链进行 Deposit 操作,主链合约锁定用户 deposit 的资金,记录这笔资金在 Layer...[7pdhngtcf1.png] 如何体验 目前,Ontology Layer 2已上线测试网,开发者可抢先进行体验。
Ontology Wasm 一直以来都受到了社区开发人员的广泛关注,而目前 Ontology Wasm 也即将上线本体主网。...本期我们将开始初步尝试从零开始开发 Ontology Wasm 合约。...1 引入Ontology Wasm合约开发工具库 在生成的Cargo.toml文件中引入 Ontology Wasm 合约开发工具库ontio-std,使用[dependencies]配置项来完成引入该工具库的动作.../ontology account add 其次,启动我们搭建好的本地测试网节点,执行下面的命令: ..../ontology contract deploy --vmtype 3 --code .
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