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用Python实现科研自动化

为了对这11个专题的文献分布情况有一个粗略的印象，我觉得都得找相关的文献来看看，但是11个专题都要重新检索一遍，重复性工作让人头秃……于是，我写了个python脚本，自动生成各个主题的关键词和引文分布情况的报告...在python中，提取PDF内容的包有pdfminer、tabula、pdfplumber等（引自：Python：解析PDF文本及表格——pdfminer、tabula、pdfplumber 的用法及对比...searchNum = len(data_dict) 四、关键词与引文数据统计 关键词的词频计算使用的是类似Excel的数据透视表的方法写成的，这一点在《如何用python表白》一文中已经讲到，计算函数如下...我使用的模块是python-docx，没安装的话需要事先安装一下。 pip install python-docx 安装完成后，导入自己已经调好样式的空白word页面。...References [1] Python：解析PDF文本及表格——pdfminer、tabula、pdfplumber 的用法及对比: https://www.cnblogs.com/gl1573/p

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    这个科研制图Python库真的强大，必须推荐～

    Python大数据分析 分享Python编程、数据分析、爬虫、人工智能等 487篇原创内容 公众号 知乎上有人问：Origin、MATLAB、Python 用于科研作图，哪个最好？...我建议直接用Python吧，科研作图需要解决的不光是可视化的问题，还有数据采集、数据处理、数据存储、建模分析的乱七八糟的各种事，最后才是用干净的数据进行可视化绘图，要对付这些任务，Python几乎是综合性最好的工具...Python有非常专业的科研绘图库，比如基础绘图库matplotlib，统计绘图库seaborn，交互式绘图库plotly，地理空间绘图库cartopy等，这些绘图库可以制作出版级别的图表，尤其是matplotlib...之前我发现github上还有个专门为期刊科研图表提供预设风格的matplotlib样式库，名字叫SciencePlots，它基于matplotlib开发了科研绘图样式，比如science风格、nature...风格、ieee风格等，很多科研论文都采用了它提供的样式。

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    100+SCI科研绘图系列教程（R和python）

    Bar Chart） 科研绘图系列：R语言分组柱状图四（Grouped Bar Chart） 科研绘图系列：R语言多个精美图形组图-CSDN博客 科研绘图系列：python语言实验线图（line Chart...python语言分组条形图（grouped barplot plot） 科研绘图系列：python语言制标准差的直方图（STD histogram plot） 科研绘图系列：python语言tSNE...散点图（tSNE scatter plot） 科研绘图系列：python语言散点图和密度分布图（scatter & density plot） 科研绘图系列：python语言密度分布图（density...plot） 科研绘图系列：python语言散点相关系数图（scatter plot） 科研绘图系列：R语言PCoA图（PCoA plot） 科研绘图系列：R语言差异基因四分图（Quad plot...） 科研绘图系列：R语言多组极坐标图（grouped polar plot） 科研绘图系列：Python语言时间趋势图-CSDN博客 科研绘图系列：Python语言箱线图-CSDN博客 科研绘图系列

    1.2K11

    【科研猫·绘图】高级科研做图 – AI入门

    当然，有些工作做得特别出色的，杂志编辑会推荐科研做图润色。...所以，学好科研做图，可以为我们文章加一层buff，战斗力提升一个档次哦~ 那么，先让我们欣赏一下优秀的文章中的图吧~ 这是一篇发表在NATURE BIOTECHNOlOGY上的文章，排版紧凑，图片形式涉及点图...对其操作在我们科研绘图中是非常常用的，可能很多人都停留在手动对齐以及目测对齐的水平上，其实是很不规范的操作！ AI中的对齐工具非常简单，选择这两个对象，然后选择垂直对齐即可。...当然了，科研做图，绝非一朝一夕之事，各位一定要勤加练习，多阅读高质量的文献，才能做出一眼让人看到就觉得非常惊艳的图。科研是一条漫长的图，一篇优秀的文章，既是科学的积淀，也是艺术的结晶。

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    “奴才式科研”是中国科研圈的毒瘤

    ▲ 题图：第五届索维尔会议参加者合影（1927年） 本文原系某国家级科研机构负责人的自述，在作者看来，中国科研表面上看起来一片繁荣，实际深藏危机，如果继续跟班式搞科研，中国科研就没戏了。...我身边一些做科研的朋友，其实也都做得挺顺，但当大家在一起聊天、喝酒，到了最后比较酣畅的时候，就会发出同样的感慨、产生深深的忧虑：如果再这么玩下去，中国的科研就没戏了。...目前中国的科研看起来很繁荣、很热闹，但是你如果静下心来，把中国的科研放到世界竞争的大格局里，站在科技发展的大视野上回望，就会发现：不管是基础研究的理论、还是在重大技术的突破，你能看得见的中国人有谁？...我认为，制约我国科学研究的，是流行的科研方式——跟班式科研，说的恶心一点，是奴才式科研。...更可悲的是，由于这种研究方式发文章快、“效率高”，其从业者甚至很快成为科研价值的评判者，并将“从文献缝隙里找方向、以文章数量与引用为标准”等作为科研工作的正途。

    2.4K30

    现代科研指北，科研新人的避坑指南！

    点击 机器学习算法与Python学习 ，选择加星标 精彩内容不迷路 “为什么越来越多博士逃离科研”这个话题是知乎上的热门话题，答题的人很多，关注的人更多，浏览量非常大。...北京大学原子核物理女博士去竞聘城管岗位引得社会各界热议，大家纷纷说着博士为什么不做科研？现在都这么卷了吗，博士也要来抢普通人的工作了吗？...其实不管是主动逃离的，还是被动选择的，每年毕业的博士中都有很多不会留在学术圈，不会继续做科研。...如果你想了解更多的科研话题，《现代科研指北》这本书不容错过。...、硕士/博士研究生及高校青年教师作为科研入门读物或工具书阅读，也可作为非科研从业人员了解现代科研现状的参考书。

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    好物分享17-科研巡礼01-科研第零课：关于科研入坑的学习资源

    1-科研新手全面入坑指南 科研新手全面入坑指南 - 少数派 (sspai.com)[1]作者：天津师范大学管理学院副教授、硕士研究生导师 王树义（少数派 ID「玉树芝兰」）[2] 这本书算是我的科研启蒙...不过看完这本书，才算知道，原来科研可以这么做。 真的是”双脚离地了，聪明的智商又占领高地了。...2-现代科研指北 现代科研指北 (bookdown.org)[3]作者：于淼 如果说，上面那本书是科研者入门指南。那这本书就是科研者的入门圣经。其介绍的内容不仅仅限于如何做科研这件工具化的事情。...随着知识经济的发展，企业工业学业的界限在某些行业逐渐模糊了，特别是在科技服务行业，许多有博士头衔的大佬并不是直接从事科研本身，而是为科研服务（以某种产品的形式）。.../u/a5xddvxl/updates [3]现代科研指北 (bookdown.org): https://bookdown.org/yufree/sciguide/ [4]读《现代科研指北》|| 或谈谈硕博生活要则

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    科研智能体「漫游指南」—助你构建领域专属科研智能体

    与传统综述不同，本篇综述为大家呈现了科研智能体的「漫游指南」，旨在提供构建科研智能体的「说明指南」：从科学研究的全周期出发，概述了科研智能体的分级策略，并详细阐述了对应等级的构建策略与能力边界；同时该「...漫游指南」详细阐明了如何从头构建科研智能体，以及如何对科研智能体的定向能力进行增强。...通过结合科学研究全生命周期与科研智能体构建策略，本综述深入剖析了构建策略与科研流程之间相互促进与协同的过程，揭示了科研智能体设计与应用之间的独特联系。...图 1｜科研智能体对于科研过程全生命周期的介入 科研智能体分级策略 图 2｜科研智能体分级示意 根据构建策略与其能力边界的等级划分，科研智能体被我们分为三个等级： Agent as Assistant：...图 3｜不同等级科研智能体汇总 从头构建科研智能体 本综述凝练了科研智能体的构建过程，从头构建科研智能体的工作流主要为知识组织、知识注入以及工具集成三个部分构成。

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    医院科研科AI智能科研支撑平台系统设计架构方案探析

    一、系统设计概述1.1 系统定位本系统是基于MCP（Model Context Protocol，模型上下文协议）协议构建的智能科研支撑平台，旨在为医院科研科室提供全流程AI辅助能力，覆盖课题立项、数据采集...、分析建模到成果转化的完整科研生命周期。...通过这种架构，系统能够整合医院内外的各类数据资源，为科研提供全面的数据支持。1.2 核心价值1.2.1 效率提升系统通过自动化数据采集、清洗和初步分析流程，可显著缩短科研数据准备周期。...，促进协作研究产出最大化通过以上核心价值，本系统不仅能够提升医院科研的效率和质量，还能在保障数据安全和合规的前提下，促进医疗科研的创新发展，为医院打造智能化、高效化的科研生态系统。...，从立项到成果转化的一站式服务这种效率提升不仅体现在时间节约上，更重要的是使科研人员能够将更多精力投入到创新性思考中，从而产生更高价值的科研成果。

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