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    基于全基因组的基因家族分析(1):数据准备

    Sol Genomics Net:茄科基因组网络,里面包括了很多物种的基因组测序结果:番茄,土豆,茄子等。而且基因组更新最快,搜索了一下发现NCBI番茄基因组和Phytozome番茄基因组为ITAG2.4,而SGN已经是最新版本的ITAG3.2,当然以前的版本也都存在,特别方便。 此外,NCBI ProteinID是refseq accession(GENBANK文件格式有关于NCBI中ID的说明),在最后转换到番茄protein ID时会有问题,小编最后终于放弃,没有找到转换的方法(谁要是知道方法,麻烦告诉我一下,一直很苦恼)。而Phytozome要下载这些数据居然还要注册,真的有点烦,偷偷告诉你,SGN貌似也要注册(这个大家应该都没有什么问题,就直接跳过)。

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    简明机器学习教程(一)——实践:从感知机入手

    有那么一段时间不出干货了,首页都要被每周歌词霸占了,再不写一点东西都要变成咸鱼了。进入正题。本篇教程的目标很明显,就是实践。进一步的来说,就是,当你学到了一些关于机器学习的知识后,怎样通过实践以加深对内容的理解。这里,我们从李航博士的《统计学习方法》的第2章感知机来做例子,由此引出大致的学习方法。需要注意的是,这篇教程并不是来介绍感知机模型的,而是用来说明如何学习并实践一个模型的,所以对感知机的解释不会很详细。本篇教程的内容较基础,内容主要面向对机器学习有兴趣且有初步了解的人。由于本文目标人群特殊,加之作者水平实在有限,有表述不严谨或错误之处,还请各路大神多多指出。本篇需要读者的准备:matlab(测试模型用)、热爱机器学习的大脑(啊喂我的严肃气氛!)。

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