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Sentieon | 应用教程:Sentieon分布模式

本文档描述了如何利用Sentieon®基因组学工具的分片能力将DNAseq®流程分布到多台服务器上;将其他流程(如TNseq®)进行分布遵循相同原则,因为所有Sentieon®基因组学工具都具有相同的内置分布式处理能力。这种分布的目标是为了减少流程的总运行时间,以更快地生成结果;然而,这种分布也会带来一些额外的开销,使计算成本增加。 利用分布能力,流程的每个阶段被分成小任务;每个任务处理基因组的一部分,并可以在不同的服务器上并行运行。每个任务生成一个部分结果,需要按顺序合并为最终的单一输出;这种合并需要仔细进行,以确保考虑到边界并生成与没有分片运行的流程相同的结果。 分布的执行框架不在本文档的范围内,用户需要在保持正确的数据依赖关系的同时,分发数据/文件并启动正确的进程。

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