昆虫基因组与转录组数据库InsectBase

距离NCBI关门已经1天啦，打开网页，都有一条粉红的横幅迎接你。

据了解，NCBI的关门是由于美国国会参议院未能通过临时拨款法案。现在NCBI说了，数据暂时不更新了，提交数据也暂时不受理了。这是什么情况！最新的数据我们去哪里找啊？我们要发文章的数据提交不出去怎么办啊？好像整个生命科学方向的小伙伴都开始紧张了。

但是，为什么学昆虫的同学们这么淡定啊？原来，他们都用昆虫基因组与转录组数据库InsectBase！

昆虫基因组与转录组数据库InsectBase

InsectBase昆虫基因组与转录组数据库旨在有效的解决目前昆虫基因组数据库的纷乱杂陈的现状，构建一个综合的全能化的昆虫领域的生物信息数据库，为广大研究者提供方便快捷的后基因组时代基因组、转录组等数据服务和交流合作平台。

数据库(http://www.insect-genome.com/)可点击文末原文链接访问，总数据存储量达120 G。InsectBase共收集了155种昆虫基因组（隶属于16个目），其中61个基因组具有注释信息（Official Gene Set, OGS），116个转录组数据，237个物种的EST序列， 69个物种的7544条miRNA序列，2个物种的83262条piRNA序列，构建了78个物种的22536个信号通路，116个昆虫的UTR序列和CDS序列。针对61个有OGS注释的昆虫，开展了数据挖掘。对研究较多的36个基因家族开展了系统分析，运用OrthoMCL直系同源算法发现了7个物种中的直系同源基因，共找到1:1:1直系同源基因973个。InsectBase昆虫基因组数据库提供序列查询、序列比对、基因组可视化、信号通路和注释、进化分析和进化树构建，所有基因数据均可下载。从PubMed中下载了94,758昆虫研究相关文献，通过数据挖掘，建立了昆虫学领域的关系网络平台iFacebook，初步实现“基因-研究者-昆虫物种”等三者之间的关系网络，便于促进学术交流。InsectBase是综合型的生物信息学数据库，数据种类齐全、功能全面、用户使用方便，有利于昆虫学研究者对基因数据的获得、整理和分析，促进昆虫分子生物学研究。

在将来，InsectBase还将继续升级，在数据量增加的同时，使对应的功能更加多样化。

百万级的服务器连夜的运作，为您的数据分析保驾护航

大数据已经成为这个时代的主题，如何在海量的数据与广大用户之间搭建出优质、高效、人性化的桥梁（数据库），是我们每一个做数据库的人都应该仔细思考的问题。昆虫基因组与转录组数据库InsectBase团队也将以用户的需求为第一动力，紧跟昆虫组学发展步伐，努力为广大昆虫科研人提供一流数据、一流功能、一流服务，最后助力各位的一流论文！

蜂言龟语

图片 部分来自网络 （侵删）

头图 浙江大学紫金港校区 王磊 摄

主编 小蜂二号

责编 坤哥 徐十三

参考文献：

1.Yin C, Shen G, Guo D,et al. InsectBase: A resource for insectgenomes and transcriptomes. Nucleic Acids Res.,2016, 44(D1): 801-807.

2. 尹传林等.昆虫基因组及数据库研究进展. 环境昆虫学报, 2017, 39(1):1-18.