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  • 来自专栏Mac软件分享

    CrystalMaker for Mac(晶体结构软件)v10.8.1激活版

    晶体结构软件CrystalMaker for mac创建、显示和操作各种晶体和分子结构 ,CrystalMaker Mac版便捷、灵活,能够容易的载入结构数据并产生壮观的,相片型的图形,戴上红/蓝眼镜, 图片CrystalMaker for Mac(晶体结构软件)crystalmaker Mac版功能特色1、集成结构库 - 现在添加自己的CrystalMaker X包含一个具有1000多种结构的集成结构库

    85420编辑于 2022-11-09
  • 来自专栏用户10436734的专栏

    晶体结构分析 MDI Jade软件安装包下载,MDI Jade安装激活

    MDI JadeX射线衍射软件是一款专业的晶体结构分析软件,以其强大的数据处理和分析能力、多样的样品类型和实验条件等特色功能深受广大研究者的喜爱。 该软件可以进行精确、快速的晶体结构测定和分析,帮助研究者更好地了解晶体结构的性质和特点。本文将从MDI JadeX软件的特色功能、使用方法和实例演示三个方面,详细介绍该软件的功能和优势。 精确的结构测定和分析:MDI JadeX软件具有高精度的晶体结构测定和分析能力,可以准确计算晶格常数、空间群、原子位置和晶体对称性等结构参数。 以上特点使得MDI JadeX软件成为了广大研究者进行晶体结构测定和分析的重要工具之一。使用方法MDI JadeX软件的使用方法如下:打开MDI JadeX软件,进入主界面。 实例演示以下是一个具体的实例演示,介绍如何使用MDI JadeX软件进行晶体结构测定和分析:打开MDI JadeX软件,导入需要处理的数据文件。对原始数据进行预处理,如背景去除、峰位校正等操作。

    87930编辑于 2023-04-21
  • 来自专栏行走的机械人

    【工程材料B】二:金属的晶体结构与缺陷

    尤其需要注意C点,C点坐标应为(1/2,1,0),但因为第三个条件,所以它的晶向为【120】。

    2.6K20发布于 2020-06-04
  • 来自专栏DrugOne

    Bioinformatics | XRRpred:根据蛋白质序列精确预测晶体结构质量

    通过预测溶剂可及性来识别表面残基,因为暴露在蛋白质表面的残基更可能影响产生的晶体结构质量。 第二步: 提取蛋白质水平的特征。

    70511发布于 2021-09-17
  • 来自专栏智能生信

    |生成对抗网络预测晶体结构

    作者在文章中提出使用生成对抗网络可以预测新的晶体结构。 文中提出的生成HTVS框架预测了23个新的晶体结构,具有合理的计算稳定性和禁带宽度。生成模型是探索采用传统方法难以到达的化学空间隐藏部分的有效方法。 ? 这种方法的缺点是不能超越数据库中现有晶体结构的模板。 一些有希望探索未知晶体结构的方法包括使用全局优化的晶体结构预测方法和机器学习中的生成模型。本文采用第二种方法。 在本次工作中,将晶体结构表示为一组原子坐标和细胞参数。构建一个GAN模型来生成带有需求化学成分的新晶体结构,并将其应用于Mg-Mn-O三元体系。 这些生成的晶体结构会用于性能评估的密度泛函理论计算。实验结果如下图4。 ? 图4.

    99520发布于 2021-02-04
  • 来自专栏智能生信

    Bioinformatics | XRRpred:根据蛋白质序列精确预测晶体结构质量

    通过预测溶剂可及性来识别表面残基,因为暴露在蛋白质表面的残基更可能影响产生的晶体结构质量。 第二步: 提取蛋白质水平的特征。

    1.1K30发布于 2021-09-10
  • 来自专栏测试GO材料测试

    前沿实验室丨形貌与晶体结构表征技术全解析

    前沿实验室形貌与晶体结构表征技术全解析在新能源材料研发的赛道上,每一次突破都始于对材料微观世界的精准洞察。 从锌负极的枝晶抑制到高镍正极的相变调控,从水系电池的界面优化到固态电池的电解质设计,材料的形貌特征与晶体结构始终是决定性能的核心要素。

    47110编辑于 2025-08-14
  • 来自专栏智能生信

    CrystEngComm | 基于接触图的全局优化的晶体结构预测

    一、研究背景 在标准晶体结构预测(CSP)问题中,必须在给定压力-温度条件、给定化学成分的情况下找到自由能最低的晶体结构。 二、材料与方法 2.1 基于knowledge-rich的接触图的CSP 周期性晶体结构可以用晶格常数a、b、c以及空间群的角α、β和γ来表示,且其具有唯一的Wyckoff位置坐标,作者使用vesta软件使用的阈值来定义接触图中原子的阈值 2.2 使用全局优化进行接触图的CSP 作者采用全局优化算法通过最大化预测的晶体结构接触图与实际的晶体结构接触图之间的匹配来搜索坐标。 目标晶体结构的设计 四、结果分析 4.1 基于接触图的晶体结构的成功预测 ? CMA-ES算法的晶体结构重建。

    1.3K20发布于 2021-05-17
  • 来自专栏用户10436734的专栏

    材料科学研究 MDI Jade 软件安装包下载,MDI Jade软件安装激活

    MDI Jade是一款功能强大的射线衍射软件,由美国Materials Data, Inc.公司开发,主要用于晶体结构解析和晶体结构分析。 晶体结构解析 MDI Jade软件支持晶体结构解析工具,用户可以在软件中对射线衍射数据进行晶体结构解析,以确定样品中的晶格信息和结构组成。 晶体结构可视化 MDI Jade软件支持晶体结构可视化工具,用户可以在软件中对晶体结构图像进行可视化操作,实现三维立体展示和多角度观察。 我们可以使用MDI Jade软件进行晶体结构可视化,具体流程如下:首先,在MDI Jade软件中打开完成晶体结构解析的数据。 四、 总结与展望MDI Jade软件作为一款专业的射线衍射软件,具有数据分析、峰拟合、晶体结构解析和晶体结构可视化等特色功能,广泛应用于材料科学研究和工业制造领域。

    89411编辑于 2023-04-20
  • 来自专栏智能生信

    AAAI Spring Symposium 2019|CrystalGan:使用生成对抗网络发现晶体结构

    作者在文章中提出使用生成对抗网络(generative adversarial networks,GAN)可以高效地生成新的数据,因此可以应用于生成新的晶体结构数据。 本文提出的CrystalGan可以生成更高复杂度的新的稳定的晶体结构。本文提出的这一种高效的方法在新型氢化物发现等实际问题中可能会有比较深入的应用。 ? 因此,本文采用GAN的模型来生成新的晶体结构。 本文的目标是寻找一种可以得到三元稳定化合物的方法。目前并没有合适的方法可以直接应用于本问题。 晶体结构由一个局部分布来描述。这种分布由给出的晶体结构中的每个原子的最近邻的距离决定。这一步满足几何约束,约束细节见图1 b。 ? 图2. 各模型实验结果 下图5为一种新生成的结构:左边为晶体结构中的最近邻距离,右边为POSCAR文件。 ? 图5.

    1.1K10发布于 2021-02-04
  • 来自专栏用户10436734的专栏

    MDI Jade是什么软件?MDI Jade 6.5软件安装包下载及安装教程

    MDI Jade是一款非常实用的晶体学软件,掌握MDI Jade的基本操作和高级功能,可以让你更好地使用这款软件,并且让你的晶体学研究和学习变得更加容易和高效。 它可以让你轻松地进行晶体结构分析、晶体结构可视化和晶体结构比较等操作。此外,MDI Jade还支持各种文件格式的导入和输出,包括CIF、PDB、SHELX等。 工具栏中包括了各种各样的工具,比如晶体结构绘制、晶体结构可视化和晶体结构比较等。数据区中包括了当前文档中的所有数据,你可以通过它来管理和处理数据。 MDI Jade安装包souttp.work/20230331MDI Jade2023安装包.htmlMDI Jade如何绘制晶体结构MDI Jade是一款用于晶体结构分析的软件,可以通过以下步骤绘制晶体结构 :打开MDI Jade软件,点击菜单栏中的“File”选项,选择“New”创建一个新的文档。

    1.5K21编辑于 2023-04-01
  • 来自专栏软件安装技巧

    MDI Jade软件下载,x射线衍射分析软件MDI Jade下载安装教程

    1)晶体结构分析:该软件可以对含有无定形结构的分子进行晶体结构分析,并得出准确的晶体结构参数。 应用效果MDI Jade XRD分析软件在药物研究中应用广泛,以下是该软件的主要优势:(1)高效:该软件可以迅速处理大量复杂的XRD数据,并自动搜索最适合的晶体结构模型,更高效地完成物质结构表征。 MDI Jade XRD分析软件的操作流程数据导入:首先,需要将需要分析的XRD数据导入软件中。参数设置:根据需要分析的物质及其特性,设置分析参数,如晶体结构模型、原子类型及约束条件等。 数据处理:使用MDI Jade自带的算法对XRD谱图数据进行处理,精确计算出晶体结构参数和晶格参数等。 举例说明以一种新型药物分子为例,通过MDI Jade XRD分析软件进行晶体结构分析和晶格参数计算。首先,将XRD数据导入MDI Jade软件中,设置好第一步所述参数后,进行数据处理。

    1.5K21编辑于 2023-04-13
  • 来自专栏软件安装技巧

    MDI Jeda中文版下载安装-MDI Jeda强大的xrd分析软件特色功能使用

    MDI Jade x射线衍射软件是一款应用广泛的材料科学软件,具有多项独特功能。在本文中,我将结合实际案例,通过举例讲解的方式来介绍这些独特功能,帮助大家更好地了解和利用这个软件。 MDI Jade晶体结构分析MDI Jade中文版获取:soruan.top/edaKxpE.MDI Jade里面有详细安装教程MDI Jade x射线衍射软件具有强大的晶体结构分析功能,可以从x射线或中子衍射数据中提取出晶体结构信息 举个例子,在材料研究领域中,我们经常需要确定材料的晶格常数、晶体结构等信息。通过在MDI Jade中导入x射线或中子衍射数据,利用其内置的晶体结构分析工具,就可以快速、准确地获得所需的晶体结构信息。 总结:以上是我对MDI Jade x射线衍射软件的独特功能的五个实际案例介绍。 如果你需要进行材料分析和研究,并希望获得更加准确、直观的结果展示,那么MDI Jade x射线衍射软件绝对是你不容错过的软件

    60320编辑于 2023-05-12
  • 来自专栏软件安装技巧

    MDI Jade软件下载安装,材料学分析软件MDI Jade激活版,功能介绍

    使用MDI Jade的自动相对强度定标功能,我可以轻松地将衍射数据转化为相对强度值,并且可以直接在软件中进行图形分析。晶体拟合MDI Jade的晶体拟合功能可以帮助用户进行数字化的晶体结构分析。 例如,在一次地质学研究中,我需要分析一个岩石样本中的矿物组成和晶体结构。通过使用MDI Jade的晶体拟合功能,我可以轻松地进行数字化的晶体结构分析,并确定岩石样本中的矿物组成。 本征结构分析MDI Jade的本征结构分析功能可以帮助用户进一步了解晶体结构。例如,在一次生物学研究中,我需要分析一种蛋白质的晶体结构软件界面自定义MDI Jade的软件界面自定义功能可以帮助用户根据自己的需求进行界面设计。例如,在一次岩石样本分析工作中,我需要同时查看多个数据图表。 使用MDI Jade的软件界面自定义功能,我可以自由地调整软件界面中各元素的位置和大小,以便更好地适应我的工作环境。

    70910编辑于 2023-05-07
  • 来自专栏DrugOne

    人工智能(AI)遇上仿制药

    分离生物仿制药的自然语言处理 从理论上讲,药物科学家可以在AI软件中搜索原创药物化合物,然后该软件将返回生物仿制药。然后,可以使用这些生物仿制药生产仿制药。 然后,该公司只需测试软件发现与该公司正在为其制造仿制药的原创药最接近的那些化合物。 供应商态势:BioSymetrics BioSymetrics为生物医学和医疗保健公司提供数据组织,标记和清理服务。 研究药物的晶体结构 一些制药公司使用AI软件研究固体化合物的晶体结构。需要将药物分子名称连接到其固体形式的晶体形状的数据进行预测分析算法的训练。药物化合物的晶体结构可能会影响药物的生产方式。 这是因为晶体结构可能无法与药丸或液体药物中的其他成分发生良好反应。 仿制药公司可以通过使用这种应用来确定其生物仿制药的晶体结构来利用这种应用。 目前找不到任何显示仿制药公司通过供应商软件获得成功的结果。此外,找不到任何将这些类型的软件出售给仿制药公司的AI供应商的案例研究。

    1.2K40发布于 2021-02-01
  • 来自专栏生信小驿站

    备忘:Pymol补全蛋白质氨基酸

    1ywt.pdb在该晶体结构中缺失的氨基酸残基情况为A链缺失了71-78部分。 为了通过Pymol来补全,需要有一个相同蛋白的晶体结构没有缺失该部分,如这里就要找到一个相同蛋白的晶体结构,其中的71-78部分并没有缺失。 这里发现3LW1晶体结构只缺失了138这一个氨基酸残基,所以可以选择它为补全模版。 使用Pymol软件打开需要补全的pdb文件,如这里的1ywt.pdb,然后使用文件—打开,打开模版结构3LW1。 为了能够调整两个结构到同一个坐标体系,这个时候就需要使用Pymol软件中的align命令了,也可以使用鼠标来实现。

    5.8K30发布于 2020-09-08
  • 来自专栏我的软件

    MDIJade X射线衍射处理软件下载,MDIJade电脑版下载安装

    MDIJade软件是一款基于衍射数据分析的软件,它可以快速准确地处理X-射线衍射实验数据,并将其转化为晶体学信息。MDIJade软件在材料科学、化学、地质学等领域中得到了广泛的应用。 化学领域:在无机化学和有机化学领域中,MEDIJade软件可以对化合物和分子的晶体结构进行研究和表征,这对于新药研发和催化剂设计等具有关键作用。 MEDIJade软件的应用案例应用案例一:MDIJade软件在钢铁中奥氏体相分析方面的应用。 通过对分子晶体结构的分析,可以确定新药分子的立体构型和相互作用方式,这对于新药的设计和研发非常重要。MDIJade软件的应用可以大大提高分子晶体结构分析的效率和准确性。 结论MDIJade软件是一个功能强大、使用方便的衍射数据分析软件,它在材料科学、化学、地质学等领域中具有广泛的应用。本文介绍了MDIJade软件的工作原理和应用案例,并展望了它未来的发展前景。

    55430编辑于 2023-04-10
  • 来自专栏新智元

    DeepMind重磅研究登Nature,预测220万晶体结构赢人类800年

    新智元报道 编辑:编辑部 【新智元导读】继AlphaFold系列改变了生物学领域之后,谷歌DeepMind今日再发Nature,全新AI工具GNoME,成功预测220万种晶体结构,颠覆了材料学领域 今天,220万种晶体结构完全被AI预测出来了。 这是什么概念?相当于近800年的知识价值。 利用 AI 加速材料发现 过去,科学家们通过调整已知晶体或试验新的元素组合来寻找新的晶体结构。 这是一个昂贵且耗时的试错过程。通常需要几个月的时间才能得到有限的结果。 GNoME会对新型的、稳定的晶体结构进行预测,然后使用DFT进行测试,并将生成的高质量训练数据反馈到模型训练中。 评估是通过在维也纳Ab initio仿真软件包(VASP)中进行的DFT计算来完成的,与Materials Project(MP)相比,研究人员同时测量了发现的稳定材料的数量和预测的稳定材料的精确度(命中率

    79710编辑于 2023-12-01
  • 来自专栏DrugScience

    . | 基于半监督学习的晶体结构的合成预测

    然而,对于晶体结构,没有这样的模型来评估其合成能力。在本文中,使用部分监督分类模型来预测晶体结构的合成概率。 这个平均值被定义为在0到1之间的晶体相似性分数(CLscore) ,使用这个CLscore来量化给定晶体结构的合成能力。 除了卷积层和池化层外,还添加了两个深度为L1和L2的全连接隐藏层,以捕捉晶体结构和属性之间的复杂映射。最后,使用输出层连接L2隐藏层来预测目标属性ˆy。 其中,排名前5位的晶体如下图所示(仅列出一种),其MP-id(无ICSD标签)、空间群、CLscore以及VESTA所示的晶体结构,这些虚拟结构的X射线粉末衍射图谱与文献报道的实验结构相吻合。 ?

    1.5K20发布于 2021-03-24
  • 来自专栏量子化学

    【双清论坛】国内计算化学方法与软件开发(Ⅲ)

    本文是国内计算方法与软件开发系列推文的第三部分:药物与材料等相关应用软件。 药物设计与分子对接软件 ● 北京大学来鲁华等开发了基于靶点三维结构的药物设计软件LigBuilder,可以实现基于片段生长和连接的配体分子设计,以及已知分子的优化,并可进行分子的可合成性分析及类药性分析 MOMAP软件支持并行计算、效率高,计算所需的分子基态、激发态信息可利用GAUSSIAN、TURBOMOLE等成熟的量化软件得到。 材料晶体结构预测软件 ● 吉林大学马琰铭等将全局最优化的粒子群算法应用到晶体结构预测领域,发展了拥有自主知识产权的晶体结构预测程序CALYPSO,为40国家近1000研究者使用。 国内很多课题组的方法和软件在自己的领域常常可以处在世界领先地位,但是大部分软件都需要借助国外的软件平台来实现。

    1.7K30发布于 2020-07-27
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