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科研文献绘图
- y[nchar(y)>=2] #统计频数 table(y) #排序获得前50个关键字 top50 <- sort(table(y),decreasing = TRUE)[1:50] top50 #绘图 在 R 中，可以利用 qqman 包来绘制 Manhattan 图，Plink 软件的输出结果可以直接作为输入数据进行绘图。
1.3K10编辑于 2022-10-25 - 来自专栏二猫の家
科研绘图配色
03 配色实用工具推荐 【RGB颜色轮】 色轮用于帮助理解颜色之间的关系，并有助于指导调色板的选择。下图描述了一个简化的12色RGB色轮和每种颜色的RGB表示法。 04 参考顶刊论文配色 对于科研绘图，一个很好的学习途径是从top论文中观摩学习。多总结好的论文配图的共性，比如展示某类数据时，通常采用哪种图表，哪些色系。 基于操作简便和美观的两个原则，小编从中选取了最适合绘图的五个网址进行详细介绍，做科研收藏这五个网址足够啦。其余配色网站只进行了简单汇总，大家有时间也可以点开试试。 【ColorSpace】 官网：https://mycolor.space/ 优点：一键生成配色方案 简介：在线调色板生成工具，只需要我们输入主色调颜色号，一键就可以生成想要的配色方案。
5.6K10编辑于 2023-11-30 - 来自专栏数据 学术 商业 新闻
科研绘图篇 | 火山图超简单工具推荐~~
今天给大家介绍一个快速绘制火山图(volcano map) 拓展工具包-ggVolcano，绘图结果为ggplot2对象，也就可以灵活进行相关主题的设置。 详细介绍如下： 安装方法 由于ggVolcano包属于单独开发的只用于绘制火山图的拓展工具，这里使用devtools工具进行安装，安装代码如下： # install.packages("devtools #由于绘图结果为ggplot2对象，可以直接使用patchwork进行拼接 library(patchwork) p1|p2 ggVolcano包修改填充和颜色的火山图绘制样例 「案例三：使用gradual_volcano "row", label_number = 10, output = FALSE) ggVolcano包绘制修改颜色的go term 火山图样例 总结 今天给大加介绍了一个绘制火山图超简单的拓展工具包
2.5K21编辑于 2023-08-23 科研绘图系列：tidyplots取代ggplot2的科研绘图利器
介绍tidyplots----取代ggplot2的科研绘图利器。tidyplots的目标是简化为科学论文准备出版的情节的创建。它允许使用一致和直观的语法逐渐添加，删除和调整情节组件。
33810编辑于 2025-02-27- 来自专栏气象杂货铺
工具推荐｜一款优秀的MATLAB科研绘图工具箱
文末可获取工具手册和安装包链接。 t = [0:0.0001:3/f]; th = 2*pi*f*t; v = Vm*sin(th+phi); % plot it figure; plot(t*1E3, v); MATLAB默认绘图设置
2.1K20编辑于 2022-08-24 - 来自专栏聊点学术
科研绘图系列 ：① 小老鼠
科研绘图是一个非常有趣的内容。 在论文体量较大且逻辑复杂时，漂亮的示意图能够锦上添花。既直观呈现研究内容，也能增强论文的可读性。 学习方法：首先要从模仿开始，操作熟练后再自我创作。 （2）选中圆形后，再选择剪刀工具，将圆形剪成下面的形状，并删除多余部分。 ? （3）选中剩余圆形，调整好耳朵的方向，然后复制粘贴一个同样的圆形。 这一步很简单，采用椭圆工具画一个竖着的椭圆形，然后再复制一个椭圆形。通过左上方填色工具，填充黑色。移动眼睛到老鼠身上，使用对齐工具，使得两只眼睛在同一水平线上。 ? （2）画出鼻子。 还是用椭圆工具画一个小小的圆形，填充黑色，移动到嘴巴处。 ? 4.画出小老鼠的胡须和尾巴 （1）选择左侧弧形工具，画出3条像胡须的线条，磅数为5磅。 5.勾勒耳朵轮廓和美化 （1）用圆形工具画出一个标准圆形，线条粗细为2磅，填充色为蓝色。然后选择左侧的变形工具，将圆形挤压为半圆弧形，不用特别标准，这样看起来更舒服。 ?
2.6K10发布于 2020-08-04 - 来自专栏科研猫
【科研猫·绘图】高级科研做图 – AI入门
当然，有些工作做得特别出色的，杂志编辑会推荐科研做图润色。 打开后是一个空白文档界面，一般我们常用的就是工具箱，菜单和文档。 图形绘制 选择矩形工具，新建一个矩形，然后使用移动工具移动这个矩形。 我们把这个图形放大，可以看到这个矩形是由路径组成。 对齐工具 接下来，就是最最重要的时刻了，我们将使用一个工具，名为对齐。对其操作在我们科研绘图中是非常常用的，可能很多人都停留在手动对齐以及目测对齐的水平上，其实是很不规范的操作！ 小结 好了，一个简单的绘图操作就完成了，从“创建绘图文件-绘制图形-对齐操作-图形输出，一整套操作基本涵盖了AI绘图的主要操作。 当然了，科研做图，绝非一朝一夕之事，各位一定要勤加练习，多阅读高质量的文献，才能做出一眼让人看到就觉得非常惊艳的图。科研是一条漫长的图，一篇优秀的文章，既是科学的积淀，也是艺术的结晶。
2.7K51发布于 2019-10-08 - 来自专栏科研菌
绘图教程：科研插图复现(1)
- 网址：https://biorender.com/ - 又见面了~不知不觉就来到BioRender专辑的第3篇推送了，小编今天如期地来和大家一起用BioRender复现科研插图啦！ 今天要复现的这幅插图主要是关于染色体、RNA和siRNA的，原综述里面是一幅占了整个版面的大图，那小编在这里的话就只取其中的一个子图来进行复现，后面类似的绘图操作相信大家一定都能做下来。 总结：BioRender里面的模板图标很齐全，容易上手，操作简单，在绘图过程里面可以省下不少构建模型的时间，出来的图片还原度和清晰度都蛮不错的。
2K30发布于 2021-02-19 - 来自专栏科研猫
【科研猫·高级绘图】 tSNE 分析
我们建立一个data.frame，将绘图需要用到的数据都存入进来。 ? 然后，便是绘图的时刻了~ 3. 基础作图 ggpubr提供了非常多的作图函数，可以方便大家绘制更美观的科研做图。 另外，我们也可以修改图的样式和颜色，来对绘图结果进行提升。 ? ? 5. 高级美化 当然，我们还不能仅仅满足于现有的成果，作图是一个细致的过程，我们需要精雕细琢。
8K20发布于 2019-11-23 - 来自专栏数据 学术 商业 新闻
学术科研绘图宝藏工具，推荐收藏~~
推文的主要内如下： SciencePlots 库介绍 SciencePlots 实例演示 SciencePlots 库介绍 使用Python-matplotlib绘制科研图表，其默认的颜色和格式并不能满足一般的期刊要求 而SciencePlots就是为解决科研图表繁琐设置而定制的一系列科研绘图样式库，可以绘制很合适科研发表的图表。 science_dark_background.png', width=4,height=3,dpi=600) 结果如下： 更多的例子，大家可以直接去官网进行测试，接下来，我们将主题应用到我们之前绘制过的科学图表绘图代码上 bbox_inches='tight') plt.show() 结果如下： 当然我们也可以在相关性散点图绘制方法中采用此主题，可视化结果如下： 总结 本期推文我们介绍了matplotlib非常优秀的科学图表绘图库
1.4K30编辑于 2022-02-17 - 来自专栏AI算法与图像处理
学习&科研必备的几个实用工具推荐（排版、绘图、查错）
得到了很多伙伴的认可，为此专门写了一篇AI领域论文写作中使用的工具总结，这是我自己在写作过程中用的比较顺手的工具，分享给大家： Part 1 写作排版工具 大多数人在论文写作过程中都离不开word工具， 得益于很多期刊都有word模板，虽然word是一个不错的工具，但AI领域的论文写作过程中，根据个人体验，我更喜欢为大家推荐Latex这款工具(可能很多人都已经用过或者正在用)，原因是它对数学公式的支持简直太 Part 2 绘图工具 ? 前言：在期刊论文中，一般都是用矢量图，所以推荐使用以下工具。很多人说word，ppt，Visio画图就足够了，没错水平高了草木皆为兵器，但为啥还推荐CoreDraw呢？ http://www.xitongtiandi.net/soft_tx/4276.html Origin Origin是由OriginLab公司开发的一个科学绘图、数据分析软件，支持在Microsoft 如果简单的图还是推荐大家使用简单的工具。 同时如果大家发现更好使用的工具，欢迎在公众号里私发信息
3.8K31发布于 2019-11-07 - 来自专栏数据 学术 商业 新闻
放弃Origin，试试Veusz吧：免费强大的科研数据绘图工具吧~~
前段时间在谈论群里看到关于有哪些集成式科研绘图软件，看到有谈论origin、QtiPlot、SciDavis还有Graphpad prism等，小编其实最想说的比较方便灵活的集成式绘图软件-Excel, 虽然对一些复杂的科研图表绘制可能还存在一些不足。 今天小编就给大家介绍一个免费(上面介绍的软件有的是要付费的)的科研图表绘制软件-Veusz，主要内容如下： Veusz软件简单介绍 Veusz软件样例介绍 Veusz软件简单介绍 Veusz是一个具有用户界面的科研绘图集成软件 Veusz支持从文本、CSV、HDF5和FITS文件格式中导入数据，更多关于Veusz的介绍可参考：Veusz官网介绍[1]，以下为Veusz操作界面： 接下来小编就列举几个可视化样例，让大家感受下集成式科研绘图软件的魅力 -Veusz，希望小伙伴们可通过官网进行该软件的学习，喜欢Python绘图的同学就可以结合Matplotlib完善自己的绘图体系啦~。
2.5K31编辑于 2022-10-25 - 来自专栏生物信息学、python、R、linux
R科研绘图调色板—ggsci
里面包括了一些知名杂志期刊或者软件（甚至是知名科幻电影、动画等）的经典配色风格，对于科研绘图是相当有帮助的。
2K10发布于 2020-04-01 - 来自专栏数据 学术 商业 新闻
科研绘制还能3D展示？！这个绘图工具太赞了~~
今天小编继续给大家推出Python绘制炫酷3D可视化的工具，今天的这个不仅包括科研统计绘图还包括一些常用图标可视化，就让小编给大家介绍今天的主角-Python-vedo库，一款超强的科学计算和3D可视化展示工具包 具体内容如下： Python-vedo库介绍 Python-vedo库案例展示 Python-vedo库介绍 Python-vedo库是一个用于绘制出版级科研图表和对3D对象进行科学分析和可视化展示的一个 conda安装 conda install -c conda-forge vedo vedo库的主要特点如下： 使用多边形网格和点云(Point Clouds)； 处理体积数据和四面体网格; 2D和3D绘图 , interactive=True, resetcam=False).close() Modify a spline interactively 更多关于Vedo的基础3D绘图可参考：Vedo基础绘图样例 3D展示非常亮眼，计划3D绘图用直播或者视频形式展示，希望可以给到小伙伴们帮助，喜欢该库的同学也可自行探索哈~~ 参考资料 [1] Vedo基础绘图样例: https://vedo.embl.es/#gallery
2.2K30编辑于 2022-05-24 R语言生存分析和科研绘图
, "Female")sex_col <- c("#F28880", "#60C4D3")总结生存数据很常见，是时间到事件的数据；需要生存分析技术来解释删失的数据；survival R包提供了生存分析工具
42800编辑于 2024-06-12- 来自专栏科研猫
【科研猫·绘图】世界地图绘制
这些图频繁出现在Lancet或者NEJM、CNS等顶级杂志中，不过对于很多科研人员来说，地图的绘制由于没有现成软件可以直接操作，一直以来都是一大难题。 ? 前面一期的教程中，我们给大家讲解了中国地图的绘制方法【科研猫·绘图】中国地图绘制：R语言版，在我们发布这篇教程后，马上有同学反映想要学习世界地图的绘制，作为实力宠粉的科研猫团队，粉丝的要求岂能不去满足。 在这里需要大家在代码中手动做一件事情，由于不知道各位绘图的数据到底长啥样，所以，当你用自己的数据绘图时，请在代码中务必指定一下：最小值，最大值和间隔。 LEVEL 4 那有没有更加高级的方法，使得数值不要按照分层去进行绘图，而是直接作为一个连续性变量进行绘图呢？这样可能看上去颜色会更流畅一些。当然可以！ 不过，作为力臻完美的科研猫技术宅，有没有可能更进一步呢？试着把NEJM当中的配色或者Lancet当中的配色直接用到图中去。
5.1K21发布于 2020-03-26 - 来自专栏巴山学长
一款让你欲罢不能的科研绘图工具箱
其实matlab是可以绘制高质量图像的，不少小伙可能绘图的时候直接调用的绘图命令，没有对作图细节进行设置。 PlotPub是K. M. Masum Habib开发的一款高质量绘图工具箱，作者将绘图相关的设置全部封装在了一个名为“Plot”的类中，只需要简单的设置即可绘制一幅漂亮的图像。 该工具箱支持EPS, PDF, PNG, JPEG,TIFF和SVG等格式文件的输出，接下来就一起来看看作者的漂亮示例吧： 示例一、多曲线制图 % Multiple plots using plotPub
2.1K10发布于 2019-10-29 - 来自专栏数据 学术 商业 新闻
Python科研绘图保姆级教程！
绘图代码全面更新原因： 一些绘图工具包的更新，导致学员在使用过程中，安装了较为新的版本，某些绘图函数无法使用； 一些作者自定义的颜色系函数，在对初学者而言，引用起来较为繁琐，造成不好的学习体验； 在使用一些特定绘图工具包时 ； 绘图代码常规的定期更新(这点我们承诺长期更新且定期调整) 调整和新增 对每个绘图工具包的使用给出了详细的官网介绍和安装语句、使用版本等重要信息，学员可直接通过点击给出的链接，直接学习该工具的使用； 新增后的绘图案例 我们以最为复杂的泰勒图绘制为例： 使用前工具包介绍情况 使用SkillMetrics工具包进行绘制，在使用之初，贴心的给出这个包的介绍，如下图所示： 自定义修改绘图函数后的操作 SkillMetrics 工具包默认的绘图函数，在绘图一些较为繁琐或者需求较高的图形时，还是不能较好地完成。 所以，作者对其源码进行了修改，同时也给出了相关介绍，如下： 修改后绘图结果 针对使用修改后的SkillMetrics工具包绘图，我们也给出了绘图结果，如下：
49810编辑于 2024-07-05 - 来自专栏R语言交流中心
R语言中科研绘图神器ggpubr
在整理图像的时候会让人觉得苦恼的就是怎么让绘图风格统一、画风高级。今天就跟大家介绍一个画图的神器，据说可以直接赢得主编的好感。此包就是ggpubr，一个联合ggplot2包进行绘图工具包。
2.2K20编辑于 2022-11-21 - 来自专栏巴山学长
matlab科研绘图模板，直接奉上源代码！
同时也希望大家多多用matlab作科研绘图，绝大部分科研图表都有能用matlab来做(论文级的那种)，咱对matlab用于各种科研图表都有研究，欢迎大家留言交流，还可特殊定制哦！ 模板的实现原理很简单，就是通过修改matlab的相关默认设置即可完成，完整步骤如下： 1、新建一个名为startup.m的matlab脚本文件，在该文件中添加所有与matlab科研绘图属性设置相关的命令 使用matlab科研绘图模板的优点： 1、不用再死记各种绘图属性设置； 2、全自动加载，打开matlab即可使用，无需多余设置、方便快捷； 3、本代码完全开源免费，可根据自行需求实现完全个人化设置； 4、让科研者更专注于科研本身而无需考虑matlab绘图设置。 如有疑问请看视频讲解 视频中所用到的代码如下： % matlab科研绘图模板测试 % 作者：bashan (巴山) % 欢迎关注：matlab爱好者 clc;clear;close all; % 定义自变量
1.9K30编辑于 2023-03-15
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