day5-linux环境下的软件安装
原创
在https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/
中找到最新的 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh
cd biosoft先进入biosoft文件夹
wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh下载Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh
看到“Thank you for installing Miniconda3 ！”说明安装成功
source ~/.bashrc #激活conda的代码,注意空格
conda #出现满屏的信息说明成功了# 使用北外的镜像
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes配置镜像
conda list查看所有的软件
conda install fastqc -y 安装软件
fastqc --help ###帮助文档
原创声明：本文系作者授权腾讯云开发者社区发表，未经许可，不得转载。
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