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文章/答案/技术大牛
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有一些软件不应该是使用conda的默认安装

自从我们运行了生物信息学奇迹产品《共享服务器》之后，遇到了大量的服务器使用场景的小白提问。...怕大家误解以为是我们服务器问题，我只好亲力亲为尽可能的辅导大家生物信息学基础知识点，比如有一些软件不应该是使用conda的默认安装，否则就会出现如下所示的问题！...following NEW packages will be INSTALLED: sra-tools bioconda/linux-64::sra-tools-2.8.0-0 如果是简单的看这个软件的部分命令的帮助文档...，会误以为软件是成功的，如下所示： 但是实际上如果我们真正的使用它来下载，会出现如下所示的错误提示信息： 2023-10-30T14:01:52 prefetch.2.8.0 sys: connection...，但是我们遇到了太多了这样的求助！

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甲基化信号值的差异分析也许不应该是看logFC

但是差异分析大家还是首先limma，而limma这个包本来是针对log后的表达矩阵设计的，这样的话，如果我们的输入是甲基化信号矩阵，实际上出来的结果是有问题的。...公式计算：平均β=信号B /(信号A +信号B + 100) 通过计算甲基化（信号A）和未甲基化（信号B）等位基因之间的强度比来确定DNA甲基化水平（β值）。...具体地，β值是由甲基化（M对应于信号A）和未甲基化（U对应于信号B）等位基因的强度计算的，荧光信号的比率β= Max（M，0）/ [Max（ M，0）+ Max（U，0）+ 100]。...因此，β值的范围从0（完全未甲基化）到1（完全甲基化） 一般来说，具体的β值的意义是： 任何等于或大于0.6的β值都被认为是完全甲基化的。 任何等于或小于0.2的β值被认为是完全未甲基化的。...β值在0.2和0.6之间被认为是部分甲基化的。

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    双十一狂欢不应该是一个人的狂欢

    当双十一的战役已经打响的时候，我们或许不应该仅仅只是关注双十一的玩法，而是应该更多地去关注双十一的另外一面——产业端。 的确，双十一已然成为每年年终的购物狂欢节。...无论是头部巨头，还是B端玩家其实都加入到了这场新的战役里。 同C端依靠流量和资本驱动的发展模式不同，对于B端的改造和升级并不仅仅只是依靠资本和流量就能够轻松完成的事情。...特别是互联网模式在改造产业上的无力，更是让人们对于互联网模式提出了质疑。 同时，以大数据、云计算、区块链和人工智能为代表的新技术依然处于早期的萌芽和发展阶段，落地和应用并未真正成熟。...产业升级则是建立在新技术的成熟和完备的基础之上的，在新技术尚未成熟和完备之前，所谓的落地和应用仅仅只是一个美好的想象。...一句话，双十一的狂欢不应该是一个人的狂欢。 －完－ 作者：孟永辉，资深撰稿人，专栏作家，特约评论员，行业研究专家。长期专注行业研究，累计发表财经科技文章超400万字。

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    DNA突变频谱不应该是仅限于肿瘤somatic的SNV

    肿瘤DNA测序（比如WES或者WGS），通常是需要取病人的正常组织或者血液，以及肿瘤组织，两个测序结果对比才能定位到真正的肿瘤somatic的SNV。...利用非负矩阵分解算法（NMF）将大约10,000名癌症病人的胚系基因组的碱基（ATCG）序列进行解析，发现了七种和癌症发生有正向或负向相关性的胚系DNA指纹（DNA fingerprint） We obtained...Meanwhile, whole-exome data of 16,670 noncancer individuals from three cohorts 这七种和癌症发生有正向或负向相关性的胚系DNA...写在文末 我在《生信技能树》，《生信菜鸟团》，《单细胞天地》的大量推文教程里面共享的代码都是复制粘贴即可使用的， 有任何疑问欢迎留言讨论，也可以发邮件给我，详细描述你遇到的困难的前因后果给我，我的邮箱地址是...jmzeng1314@163.com 如果你确实觉得我的教程对你的科研课题有帮助，让你茅塞顿开，或者说你的课题大量使用我的技能，烦请日后在发表自己的成果的时候，加上一个简短的致谢，如下所示： We thank

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    生信分析走向临床，科研的难题不应该是不会写代码！

    生信分析走向临床，科研的难题不应该是不会写代码！ 随着社会经济的迅速发展和科学技术的全面进步，计算机事业的飞速发展，以计算机与通信技术为基础的信息系统正处于蓬勃发展的时期。...GAPTEST网址：https://cloud.gaptech.cn/ 随着计算机科学的发展，数据库技术在Internet中的应用越来越广泛，为生物信息的共享和存储提供了很好的服务。...随着生物信息的不断更新和增加，建立这样的生物信息数据库网站会加快生物信息的共享和生物科学的发展。...相比于传统科研模式时间和精力的大成本投入，生信分析仅仅只需要用一台电脑和一根网线就可以分析出大量数据，快速确定课题方向，从而发表高质量SCI文章，很大程度避免传统科研模式的弊端。...“概普测试”网站已全面开放，对单基因预后快速分析及核心基因分析感兴趣的小伙伴，抓紧体验吧！ 使用方式一：电脑端输入网址：https://cloud.gaptech.cn， 即刻访问！

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    透明巨页和巨页的详解

    大页内存与透明大页的关系 大页内存类似专用内存，会从系统中抠出一块大内存，而想要使用这块内存，应用程序必须修改程序。...其次，如果程序内存使用较少，却申请了大页，就造成了内存浪费，这个时候就要用到透明大页(Transparent Huge Pages，THP)了。...这两者的区别在于大页的分配机制：标准大页管理是预分配的方式，而透明大页管理则是动态分配的方式，且不需要修改程序源码。...透明大页之功 THP 是一个提取层，可用于自动创建、管理和使用超大页面的大多数方面。...THP可以改进系统的性能，可以减少使用超大页面的复杂行，目前THP已在各种系统、配置、程序和负载中测试优化，可以改进大多数系统配置的性能。

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    云计算的5个应做和不应做的事项

    云计算专家对于企业在云计算方面做了哪些正确和错误的工作进行了阐述。...相反，IT领导者必须与高级管理人员合作，阐明IT转型的商业利益，使首席执行官和首席财务官与技术战略保持一致。...#3 -不该做：害怕供应商锁定 应该做：采用单一供应商服务时需要考虑效率和集成服务 由于担心单一云计算服务锁定，很多企业正在采用混合云策略，将内部部署和云计算系统交织在一起，并利用供应商的多样性。...#5 - 不应该：相信内部部署系统比云计算更安全 应该做：默认加密 自云计算技术问世以来，高级管理人员一直担心安全问题。 这是理所当然的。...Venkatesan说，“这是因为这些政策和控制措施没有以正确的方式实施。最后只会留下许多在公共论坛中开放的数据，而云计算提供商与此无关。”

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    文件的输入和输出

    简单的文件I/O 写入文件： 让程序写入文件，其步骤大致为如下： 创建一个ofstream对象来管理输入流； 将该对象与特定的文件关联起来； 用使用cout的方式使用该对象，唯一的区别是输出将进入文件...fstream ifstream fin; //#1 fin.open("a.txt");//#2 char ch; fin >> ch; //#3 读取一个字符放入ch 【注：当输入和输出流对象过期...它还继承了两个缓冲区，一个用于输入，一个用于输出，并能同步化这两个缓冲区的处理。...fstream类为此继承了两个方法：seekg()和seekp()，前者将输入指针移到指定的文件位置，后者将输出指针移到指定的文件位置（实际上，由于fstream类使用缓冲区来存储中间数据，因此指针指向的是缓冲区中的位置...这些类方法使得能够将文件指针放置到相对于文件开头、文件尾和当前位置的某个位置。tellg()和tellp()方法报告当前的文件位置。

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    目前测序技术最广泛的临床应用不应该是在肿瘤领域吗？（附复旦大学病理科的癌症基因检测项目分类和收费）

    面对这样的情况，医生和患者都感到困惑和无助。 为什么标准方案会失败？ 在肿瘤治疗中，标准方案通常是基于大规模临床试验的结果制定的，这些方案在大多数患者中可能有效，但并不适用于每一个个体。...基因检测的重要性 这个案例生动地展示了基因检测在肿瘤治疗中的重要性： 精准诊断：基因检测能够揭示肿瘤的基因特征，帮助医生更准确地诊断肿瘤类型和阶段。...通过深入了解肿瘤的基因特征，医生能够为患者提供更精准、更有效的治疗方案，从而显著提高治疗成功率和患者的生活质量。随着基因检测技术的不断发展和应用，未来将有更多患者受益于这种个性化的医疗模式。...复旦大学病理科的癌症基因检测项目分类和收费 在朋友圈看到了癌症患者的基因检测故事后，就放到了群里然后大家给出来了各自的医院目前能承接的癌症基因检测项目分类和收费标准，我拿复旦大学的癌症基因检测项目分类和收费条目让人工智能大模型解读了一下...以下是对该基因检测业务分类及收费的详细梳理，按检测类型、适用癌种、标本要求、报告时间和价格（人民币）进行归纳分析： 一、按癌种分类的基因检测 1.

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    React Native性能优化：应该做和不应该做的

    这个库在iOS和安卓上都可用并且能够有效的缓存图片 使用适当大小的图片 如果React Native APP依赖于使用大量的图像，那么优化图像对于APP的性能是很重要的。...可以在iOS和Android平台减少29%的二进制大小。 避免不必要的渲染 React Native是基于React的库并且处理组件渲染的形式类似于React.js。...记忆化的理念是：如果一个组件接收相同的props超过一次，它将会使用之前一次缓存的props。并且函数组件只会进行一次渲染返回jsx 例如下面Parent组件和Child组件的例子。...Child组件没有做任何和Parent组件有关的操作而仅仅是展示一些静态文本。...它使用原生插件生态系统来调试iOS和Android应用程序。这些插件可用于设备日志、崩溃报告、检查网络请求、检查应用程序的本地数据库、检查缓存的图像等。

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    js 水平轮播和透明度轮播的实现

    透明度轮播 主要思路：透明度轮播相对水平轮播的实现更简单一点。...首先在HTML里建一个绝对定位的div盒子，然后在这个div盒子里用列表的方式插入四张图片，设置为绝对定位，并且块排列；接着在js中实现动态效果，透明轮播的实现就是将前一张图片的透明度设置为0，需要轮播的那一张图片的透明度设置为...) { var current; var target = properties[property]; //分为两种参数，一种是透明度..."bullet"; buttons[next].className = "bullet focus"; //调用animate方法实现透明度的转换...其他的实现方法基本和透明度轮播类似，但是轮播是改变的是距离left 轮播也应用了封装的animate 水平轮播实现代码 <!

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    测试架构师应该做和不应该做的事情

    在需求分析阶段，首先要理解产品的商业目标和核心价值，了解我们的公司、客户及商务，比如公司中的营销人员和销售人员如何细分客户？每个细分市场的关键价值主张是什么？公司试图增长哪些细分市场？如何增长？...产品的竞争对手为用户提供了哪些有价值的解决方案？你们之间的差异是什么？产品所在领域有哪些基本的规范和要求？行业背景有哪些？用户的习惯是什么？...最后要输出产品总体测试策略，它就好像测试的总纲，帮助整个测试团队明确测试的范围、目标，测试的重点和难点，测试的深度和广度，以及如何安排各种测试活动（及测试分层）。...测试架构师的工作是保证测试的正确性，制定测试策略，解决“测什么”和“怎么测”的问题，需要熟练掌握产品技术和测试技术，并有能力找到其中的平衡点。...参考资料： 《测试架构师修炼之道》第2版第3章测试架构师应该做和不应该做的事情

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    EditText输入密码的显示和隐藏

    密码的显示和隐藏是一个很常见的小知识点，主要包括2个部分：小图标的变化和EditText输入密码的显示和隐藏 小图标的变化 小图标的变化一般也有2种实现方式： （1）ImageView或ImageButton...这种方式需要声明一个全局的布尔型变量作为标志位，记录当前是显示密码还是隐藏密码 实现步骤： 首先当然是布局中添加了ImageView或ImageButton 然后在代码中设置点击监听，根据标志位在代码中动态的替换图片...，改变EditText的显示状态 （2）ToggleButton 这种方式需要写一个selector文件，根据state_checked值设置不同的图片 实现步骤： 首先布局中添加ToggleButton...onCheckedChanged方法，在这个方法里可以改变EditText的显示状态 EditText输入内容的显示和隐藏 也有2种方式可以实现：修改TransformationMethod和动态修改...你的每一点支持都是对我莫大的鼓励

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    Go语言的标准输入-scan 和bufio

    除了f mt 和 os ,我们还需要用到 bufio 来实现带缓冲输入（input）和输出(output)读取用户的输入数据我们怎样读取用户从键盘（控制台）输入的数据？...输入指从键盘或其它标准输入（os.Stdin）读取数据。...，并以一个新行结束输入， Scanf做相同的工作，但它使用第一个参数指时输入格式， Sscan系列函数也是读取输入，但它是用来从字符串变量里读取，而不是从标准（os.Stdin）里读取 另外，我们也可以使用...这个带缓冲的reader有一个方法ReadString(delim byte), 这个方法会一直读数据，直到遇到了指定的终止符，终止符将成为输入的一部分，一起放到buffer里去。...('\n') 下面的例子是使用了带关键字switch的，注意Go 的switch的几种形式以及unix和windows下不同的定界符。

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