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    从NT_NR数据库中提取子库

    1 首先下载NCBI的taxonomy数据库 下载完解压缩,其中names.dmp和nodes.dmp两个文件很重要,是后续提取子库的基础 2 下载NCBI的TaxonKit软件,http://bioinf.shenwei.me...3 下载NCBI的csvtk软件,http://bioinf.shenwei.me/csvtk/download/,linux系统也是直接解压,即可使用 4 (选择性步骤)NCBI taxonomy数据库下还有...库的accession不一致,前者可能冗余更多,因此该方法可忽略,见仁见智吧,下面给个例子,例如: #从taxonomy数据库中的nucl_wgs.accession2taxid提取accession号...outfmt "%a %T" | csvtk grep -d ' ' -D ' ' -f 2 -P $id.taxid.txt \ | cut -d ' ' -f 1 \ $id.acc.txt 7 从NT...这种从NT库中还原的nt.fa序列里面有很多重复的头文件,例如 所以使用的话,还需要写个perl把这些序列拆开,最终形成nt.anmail.fa.gz 8 如果直接想构建子库,那么没必要搞序列,直接运行

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    从NT_NR数据库中提取子库

    那么就有一个问题,如何选择去除污染的数据库呢? 思来想去,还是从NT库入手,打算把NT库所有动物的序列或者所有小鼠的序列提取出来,做成一个子库,用来去除宿主污染。...百度了一下提取子库的方法,大多都是人云亦云,干脆还是自己整理整理。...下面是一些步骤 1 首先下载NCBI的taxonomy数据库 下载完解压缩,其中names.dmp和nodes.dmp两个文件很重要,是后续提取子库的基础 2下载NCBI的TaxonKit软件,http...taxonkit 3下载NCBI的csvtk软件,http://bioinf.shenwei.me/csvtk/download/,linux系统也是直接解压,即可使用 4 (选择性步骤)NCBI taxonomy数据库下还有...库的accession不一致,前者可能冗余更多,因此该方法可忽略,见仁见智吧,下面给个例子,例如: #从taxonomy数据库中的nucl_wgs.accession2taxid提取accession号

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    如何使用DNS和SQLi从数据库中获取数据样本

    泄露数据的方法有许多,但你是否知道可以使用DNS和SQLi从数据库中获取数据样本?本文我将为大家介绍一些利用SQL盲注从DB服务器枚举和泄露数据的技术。...即使有出站过滤,xp_dirtree仍可用于从网络中泄露数据。这是因为SQL服务器必须在xp_dirtree操作的目标上执行DNS查找。因此,我们可以将数据添加为域名的主机或子域部分。...collaborator.redsiege.net上设置DNS服务器,我可以强制xp_dirtree在data.collaborator.redsiege.net上执行DNS查找,我的DNS服务器将接收该主机的查询,允许我提取来自请求的数据...在这一点上,我知道有一种可靠的方法可以来泄露数据,即使需要手动完成。...在下面的示例中,红框中的查询语句将会为我们从Northwind数据库中返回表名。 ? 在该查询中你应该已经注意到了有2个SELECT语句。

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    如何从tushare获取股票历史数据写入自己的MySQL数据库

    如何从tushare获取股票历史数据写入自己的MySQL数据库 点击 https://tushare.pro/register?...因为 tushare api 限制一次获取最高5000条记录,而A股市场目前有3000多只股票,提取一次数据不会超过 api 的限制记录数。...代码如下: import tushare as ts pro = ts.pro_api() df = pro.daily(trade_date='20200325') 然后通过日期循环,就可以获取所有股票的历史数据了...上一篇 《学习python想连接MySQL,没有练习数据怎么办?》 已经把股票基础信息保存在MySQL数据库里了,本篇需要从 stock_basic 里获取上市公司的上市日期。 2.1....接口 ts.set_token('你从tushare获得的token') pro = ts.pro_api() # 建立数据库连接 db = pymysql.connect

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    【Zabbix 4.2】支持时序数据库!支持从Prometheus Agent获取数据!还有还有

    支持在问题列表中显示最新数据 方便查看故障时的最新数据,用以故障诊断。 ? 点击查看大图 3. 实时测试告警媒介功能 方便快速测试已配置告警媒介是否可用。 ? ? ? 点击查看大图 4....支持时序数据库 目前支持时序数据库有PostgreSQL + Extension构成, 参考:https://docs.timescale.com/v1.2/getting-started,支持时序数据库后...,可以从根源上提升Zabbix的性能,降低数据库的维护难度。...支持从Prometheus Agent获取数据 Prometheus有很多现成的监控Agent可以获取数据,Zabbix只需要对接Prometheus。 Prometheus数据格式如下: ?...点击查看大图 Zabbix预处理功能处理Prometheus数据: ? 点击查看大图 数据流: ? 点击查看大图 21.

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    图片管理:从图片获取到上传与删除的 API 数据交互

    今日推荐:Spring AI再更新:如何借助全局参数实现智能数据库操作与个性化待办管理文章链接:https://cloud.tencent.com/developer/article/2464797这篇文章详细介绍了...Spring AI的新特性,特别是如何利用全局参数实现CRUD操作和个人待办管理,内容深入、实用性强,对开发者理解智能数据库交互和Spring AI的应用有很大帮助。...本文将重点讲解如何通过 API 实现图片的获取、上传与删除功能,并结合 Vue.js 组件的实现方式,提供一个全面的图片交互模块。...点击该选项后,前端会调用删除 API 请求,成功删除图片后,会从当前图片列表中移除该图片。...结语本文介绍了如何通过 API 实现图片的获取、上传和删除功能。

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    Shiro学习系列教程二:从数据库中获取认证信息

    本讲主要内容: 1:shiro框架流程了解  2:用户名密码从数据库中读取后进行验证(在实际工作中一般使用这种)  第一节:shiro框架流程了解 首先,我们从外部来看Shiro吧,即从应用程序角度的来观察如何使用...可以看到:应用代码直接交互的对象是Subject,也就是说Shiro的对外API核心就是Subject;其每个API的含义:  Subject:主体,代表了当前“用户”,这个用户不一定是一个具体的人,与当前应用交互的任何东西都是...Realm获取安全数据(如用户、角色、权限),就是说SecurityManager要验证用户身份,那么它需要从Realm获取相应的用户进行比较以确定用户身份是否合法;也需要从Realm得到用户相应的角色...);  SessionDAO:DAO大家都用过,数据访问对象,用于会话的CRUD,比如我们想把Session保存到数据库,那么可以实现自己的SessionDAO,通过如JDBC写到数据库;比如想把Session...Shiro从realm中获取验证的数据  Realm有很多种类,常见的jdbc realm,jndi realm,text realm  第三节:从mysql中读取到验证数据 3.1:创建数据库

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    如何用 ajax 连接mysql数据库,并且获取从中返回的数据。ajax获取从mysql返回的数据。responseXML分别输出不同数据的方法。

    使用它,就可以无闪刷新页面,并且从数据库获取实时改变的数据反馈回界面,显示出来!是不是很爽,的确。       废话不多,开讲,请注意我的代码的注释,里面详说!...; 52 return; 53 } 54 } 55 56 57 58 //回调函数,就是刚才定义的函数,用来获取从服务器文件,asp或者php或者其他返回的信息...{ 76 //判断http的交互是否成功 77 if(xmlHttp.status==200) 78 { 79 //获取服务器端返回的数据...是通有的(" ")这里写的是你链接的文件里面的标签名,等下介绍再详说,[0]也是要写的 87 //.childNodes[0].nodeValue; 这块也是通有的,意思是获取值...""; 12 //这里的 标签就是刚才(" "),里面要填的,通过这方式,分别输出、获取不同的值,下同 13 echo "" .

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    小程序云开发实战五:如何将获取到的API数据存入云数据库里面

    之前的文章里面已经详细写过像云数据库里面插入数据的方法,现在用在实际项目里面再写一遍。...1:使用数据库的时候,首先要进行初始化 云开发数据库文档: https://developers.weixin.qq.com/miniprogram/dev/wxcloud/guide/database.../init.html 2:打开云开发控制台 老规矩,创建一个集合 books 3:打开小程序端js, 初始化数据库 //云数据库初始化 const db = wx.cloud.database...4:用云数据库的示例去创建新的字段添加到数据库之中 6:测试一下,好了,小程序端获取的豆瓣API数据存入云数据库里面了。...附上: 主要思路: 1:通过调用小程序的扫码的api 2:调用云函数获取到图书的信息,并将图书信息传递到小程序 3:在小程序中 调用云数据库来添加 可能会有很多人有问,为啥不直接在云函数中完成添加?

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    小程序云开发实战五:如何将获取到的API数据存入云数据库里面

    之前的文章里面已经详细写过像云数据库里面插入数据的方法,现在用在实际项目里面再写一遍。...1:使用数据库的时候,首先要进行初始化 云开发数据库文档: https://developers.weixin.qq.com/miniprogram/dev/wxcloud/guide/database...3:打开小程序端js, 初始化数据库 //云数据库初始化 const db = wx.cloud.database({}); const book = db.collection...4:用云数据库的示例去创建新的字段添加到数据库之中 6:测试一下,好了,小程序端获取的豆瓣API数据存入云数据库里面了。...附上: 主要思路: 1:通过调用小程序的扫码的api 2:调用云函数获取到图书的信息,并将图书信息传递到小程序 3:在小程序中 调用云数据库来添加 可能会有很多人有问,为啥不直接在云函数中完成添加?

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    小程序云开发实战五:如何将获取到的API数据存入云数据库里面

    之前的文章里面已经详细写过像云数据库里面插入数据的方法,现在用在实际项目里面再写一遍。...1:使用数据库的时候,首先要进行初始化 云开发数据库文档: https://developers.weixin.qq.com/miniprogram/dev/wxcloud/guide/database.../init.html 2:打开云开发控制台 老规矩,创建一个集合 books 3:打开小程序端js, 初始化数据库 //云数据库初始化 const db = wx.cloud.database...4:用云数据库的示例去创建新的字段添加到数据库之中 6:测试一下,好了,小程序端获取的豆瓣API数据存入云数据库里面了。...附上: 主要思路: 1:通过调用小程序的扫码的api 2:调用云函数获取到图书的信息,并将图书信息传递到小程序 3:在小程序中 调用云数据库来添加 可能会有很多人有问,为啥不直接在云函数中完成添加?

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