使用ImageJ在文件夹和子文件夹中放置的图像中使用宏自动执行任务

文章/答案/技术大牛

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automation、imagej、imagej-macro

我最近发现了宏，以及它们是如何出人意料地简化我在斐济/ImageJ上的工作的。run("Image Sequence...", "projection=[Average Intensity]");此<em

浏览 4提问于2018-02-21得票数 0

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ImageJ将“各向异性扩散2D”插件输出保存到宏中

plugins、macros、imagej

我一直在尝试在ImageJ (斐济)中创建一个宏，它允许我使用“各向异性扩散2D”插件批量处理文件夹中的一堆图像，并自动将插件的输出保存到专用文件夹中。然而，当我设法从宏运行插件时，我不能保存它生成的新的处理过的图像，它只保存未处理的开始<

浏览 2提问于2016-05-24得票数 0

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如何使用python在imagej中打开图像？

python、image、counting、imagej、fiji

我想自动计数单元格，我通常用ImageJ来实现这一点。我想把图片上传到python的imagej中subp

浏览 5提问于2021-11-30得票数 0

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exec("dir /w")；函数在imageJ中是如何工作的？

python、imagej

如何在imageJ，中使用exec()？我是否可以使用exec()函数启动外部python程序，其内容如下：能否将图像数组从python返回给exec？

浏览 0提问于2014-05-02得票数 0

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将ImageJ宏转换为插件

r、plugins、macros、imagej、imagej-macro

我有一个概念性的问题，所以很抱歉没有具体说明。我的ImageJ宏非常简单。它利用了几个已有插件中<

浏览 4提问于2017-08-24得票数 0

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ImageJ静默模式-无需打开图像即可处理

java、plugins、imagej

我需要运行Macro，但我不想显示图像。如果我不调用imp.show()，ImageJ将打印到控制台，没有打开的图像。那么如何才能在不显示图像的情况下运行Macro呢？提前谢谢。

浏览 2提问于2013-05-07得票数 3

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斐济/ImagJ命令行参数输入和返回？

command-line、imagej

我在想，如果我在无头模式下运行斐济，什么是将参数传递给某些宏的最佳方法？返回一些信息的最佳方式是什么(前)。宏执行已完成，或某些错误消息) 例如，我有一个宏，它对文件夹中的每一个图像执行FFT，然后将结果输出到另一个文件夹。如果我想在启动宏的命令行中键入输入文件夹和输出文件夹作为参数。我还想知道宏</e

浏览 1提问于2014-01-21得票数 3

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如何对多个目录中特定文件夹中的ImageJ宏进行批处理

imagej、imagej-macro、fiji

我有一个嵌套的文件结构，其中父文件夹包含不同类型数据的多个文件夹。我使用ImageJ宏脚本对其中一个文件夹中的所有图像文件进行批处理。我目前需要分别处理每个文件夹，但我想对文件夹进行批次处理。我已经查找了多个文件夹的一些批处理，但代码似乎正在处理所有文件夹中的所有文件

浏览 0提问于2019-08-12得票数 1

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用ImageJ编写宏以打开、更改颜色和重存显微镜图像

image、rgb、imagej、imagej-macro

我试图在Image中编写一个代码，它将：在以“- GFP.vsi”结尾的文件夹中打开所有图像，使用查找表将图像从ImageJ转换为绿色和RGB颜色，命令是:run(“green”)和RGB(“RGB颜色”)；将每个图像保存在相同的原始文件夹中，该文件夹具有相同的名称，如果<

浏览 7提问于2020-06-24得票数 0

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在.fit宏中打开ImageJ文件

macros、imagej

我希望打开一系列.fit文件，并使用宏将它们重新保存为ImageJ中的Jpegs。我是ImageJ代码编写的新手，所以可能做错了什么。下面的图片可以看到我收到的错误消息以及我的代码：我已经检查过了:文件肯定在那个位置，如果我在文件夹中双击它，我仍然可以让ImageJ打开它。知道为什么会出错吗？

浏览 3提问于2016-04-15得票数 0

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复制行，直到单元格不为空

vba

感谢您能提供的任何帮助。我已经成功地使用宏来搜索文件夹和子文件夹，并对它们进行超链接，并在A列中显示文件夹1，在B列中显示文件夹1中的文件。大约有200个文件夹和大约1600个文件。无论如何，我希望能够放置一个按钮，并附加一个宏到该按钮，这将使文件夹和文件

浏览 0提问于2017-05-14得票数 1

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如何将ImageJ连接到python？

python、jython、imagej

我正在使用Python设计一个软件，图像处理是其中的一个步骤。我正在使用ImageJ来实现这一点。由于在ImageJ中有一个可以在ImageJ软件中打开的Jython解释器，因此必须有一种方法将ImageJ连接到Python并调用Python中的所有函数。我想知道如何才能在Python语言中完成所有处理，而不是在Imag

浏览 2提问于2015-04-20得票数 6

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利用ImageJ* API开发图像处理软件*

java、image、image-processing、imagej

我正在做一个基于内容的图像检索的研究。我希望开发基于web的图像检索系统。目前，我正在评估CBIR中不同的图像检索方法。我想使用imagej来开发这个web应用程序，但是我对imagej并不熟悉，也不知道该如何做。作为一个初学者，我想阅读一个图像，并提取该图像的颜色特征。首先，我将使用颜色瞬间作为图像特征。我

浏览 2提问于2013-12-27得票数 0

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在ImageJ中编写宏以打开、更改颜色、调整亮度和重新保存显微镜图像

image、imagej、imagej-macro

我正在尝试在图像J中编写一段代码，它将：打开文件夹内包含"488“的单独窗口中的所有图像使用查找表将图像转换为绿色和RGB颜色从ImageJ，命令是:运行(”绿色“)；和运行(”RGB颜色“)；调整亮度和对比度与定义的最小和最大值(每个图像相同的值)。我知道它的代

浏览 142提问于2021-06-01得票数 0

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仅在S3桶根上发生的事件

aws-lambda

我正在使用Lambda为S3编写一个自动图像调整工具。我希望在PUT操作时在bucket的子文件夹中创建缩略图，但是如果我将文件放置在桶中的任何位置，则会触发事件。有人能告诉我如何使事件在指定桶的根部而不是其子文件夹中的操作上着火吗？

浏览 5提问于2015-04-22得票数 2

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控制已经存在的ImageJ实例

java、wolfram-mathematica、imagej、jlink

事实上，我正在使用JLink/Mathematica来做我想做的事情。在我们的实验室里，我们用数学控制的相机拍摄实验的照片。我们想把我们的图像显示程序转换成ImageJ。根据我的研究，我可以通过编写插件、脚本或宏来实现这一点。我也有这样的印象:我写的任何东西都将安装到ImageJ中，并由默认的GUI

浏览 4提问于2015-10-08得票数 1

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如何使用VBA从特定的子文件夹打开xlsm文件？

excel、vba

我正在处理宏，它从剪贴板获取路径，遍历这个路径中的每个文件夹和子文件夹，在Financial子文件夹中打开xlsm文件并删除KPI表。交付子文件夹\基本上，我复制“P：\主文件夹”，我的宏遍历所

浏览 1提问于2019-12-11得票数 0

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如何在ImageJ中禁用对话框？

java、imagej

我经常使用ImageJ来查看由多个图像组成的图像堆栈，这些图像位于一个文件夹中。我只需将各自的文件夹拖放到ImageJ图形用户界面中，它就会创建一个可滚动的可视化，这非常方便。不过，这可能更方便，因为每次我这样做时，都会出现一个对话框，询问是否要将文件夹中的所有图像作为堆栈打开。是否可以将其默

浏览 11提问于2017-07-11得票数 0

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使用ImageJ在大型集群上编写多个时间点的并行迭代反卷积脚本

javascript、imagej、pbs

我有一个有趣的ImageJ脚本问题，我想分享一下。一位成像科学家给了我一个包含258个时间点的数据集，其中包含13张“Z堆栈”图像。总共有3354张tif图像。他有一个使用imageJ宏录制功能制作的宏，这个宏在他的windows机器上工作，只是需要花费很长时间。我可以访问一个非常大的学术计算集群，在那里我可以请求与时间点一样多的节点。这是<em

浏览 2提问于2014-11-14得票数 0

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ImageJ宏和插件路径

imagej、imagej-macro

我在MacOS X上使用ImageJ。目前ImageJ属性实用程序报告宏和实用程序目录为"null“IJ.getDir("macros"): null 我可以在命令行中使用以下命令设置目录java -Xmx1024m -jar /Applications/ImageJ/ImageJ.

浏览 7提问于2016-11-01得票数 1

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