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ggplot2 中 scale 的使用

ggplot 中 scale 的使用 ggplot画图是画图中的战斗机，但是往往在我们用ggplot2画图时候，需要根据需求更改坐标，图例等，最常见的就是更改x，y坐标系的名称。...在ggplot2中，坐标系与比例尺和参考线是自动生成的，并且生成得很好。...我们会使用scale_color_和scale_fill_来更改调色板，今天我们就来介绍如何在ggplot中调整比例尺，调整中断和标签，修改轴和图例等。...强大的 Scale包，可以实现在ggplot基础上，对图形进行微调及更改。...1.基础底图 Scale包为ggplot底图提供了四种样式的比例尺： demo_continuous() and demo_log10() for numerical axes demo_discrete

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TidyFriday R 语言中桑基图的一些画法。。。

构造示例数据首先我们需要构造一个示例数据集用于接下来的演示，这里我使用的是我的微信好友数据里面的省份、城市、性别变量。...，可以直接使用我的 friends.csv 数据集： # 使用微信好友数据 library(hrbrthemes) library(tidyverse) library(ggplot2) library...使用 sankeywheel 绘制介绍桑基图画法的教程当然首先要介绍我自己写的 R 包啦，我有一个 sankeywheel 包可以用来绘制桑基图，其实我在探索微信好友数据的那个教程里面已经介绍过了这个...组合多个 HTML 控件可以使用 manipulateWidget 包： library(manipulateWidget) combineWidgets( sankeywheel( from...city, gender) 然后就可以绘制一幅基于 ggplot2 的桑基图了： ggplot(pg, aes( axis1 = prov, axis2 = gender, axis3 = city

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R语言ggplot2散点图如何使用更多的形状

R语言ggplot2如果要做散点图可以用自带的一些形状如果想用其他形状，有一个R包是ggstar https://cran.r-project.org/web/packages/ggstar/vignettes.../ggstar.html 如果还想用其他形状，可以修改ggstar的代码，来增加一些形状。...ggstar这个R包的整体结构暂时还看不明白，但是定义形状的部分自己能够修改。...在 primitive.R 代码中 plxy 就是一个形状的数据，第一列是x，第二列是y 比如上图中28的形状 square diamond 把中心掏出一正方形的空白 data.frame(x=c(0,...，就能够把这个形状用于ggplot2的散点图中

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「R」ggplot2在R包开发中的使用

在撰写本文时，ggplot2涉及在CRAN上的超过2,000个包和其他地方的更多包！在包中使用ggplot2编程增加了几个约束，特别是如果你想将包提交给CRAN。...尤其是在R包中编程改变了从ggplot2引用函数的方式，以及在aes()和vars()中使用ggplot2的非标准求值的方式。...引用ggplot2函数与引用其他包类似，你需要在DESCRIPTION文件下的Imports条目下列出ggplot2，并使用::访问ggplot2提供的函数。...将ggplot2列入Depends会让你的包在被加载/测试的同时加载ggplot2。这会让其他想要使用你包的人通过::使用你的函数而无需加载它。...在包函数中使用 aes() 和 vars() 为了使用ggplot2创建图形，你很可能至少要使用一次aes()函数。如果你的图形使用了分面操作，你可能也会使用vars()用来指向绘图数据。

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R 和 RStudio 的安装及 R Profile 的配置 & 爬取 CRAN 上的所有 R 包的名称、发布日期和标题

konradsemsch/ggrapid", dependencies = TRUE) devtools::install_github("thomasp85/patchwork") install.packages('manipulateWidget...设置 R Profile R Profile 里面的代码会在启动 R 的时候自动运行，创建 R Profile 文件可以使用： usethis::edit_r_profile() 运行之后自动会打开一个文件...，在里面输入你想要在 R 启动的时候自动运行的代码即可，可以参考我的： Windows 系统： # 加载包 suppressMessages(suppressWarnings(library(ggplot2...= "MLingWaiMedium-SC" # 这是设定默认使用 Python 的位置，可以参考自己的 Python 安装位置设定： # reticulate::use_python('/opt/anaconda3...基于这种设定，使用 R 基础绘图系统绘图的结果将会是这样的： hist(iris$Sepal.Length) 使用 ggplot2 绘图的结果是这样的： library(ggplot2) ggplot

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详谈如何使用ggplot2绘制火山图

欢迎关注R语言数据分析指南 ❝最近VIP群内有朋友询问火山图的绘制方法，那么本节就来详细介绍在R中如何使用「ggplot2绘制火山图」，小编添加了详细的注释希望各位观众老爷能够喜欢。...❞ 小编已经搭建了一套稳定的真核转录组分析流程，可以完成「从原始数据分析到最终出结果分析文档」基本包含目前RNA_seq文章的所有分析内容。...「有数据分析需求的朋友可联系小编进行咨询」导入数据 df <- read.delim("data.xls", header = TRUE, sep = "\t") 数据清洗 plot_data % janitor::clean_names() %>% # 使用 janitor 包的 clean_names() 函数将列名转换为小写 mutate(fold_change...) %>% # 仅保留指定的列 mutate( gene_type = case_when( fold_change >= 2 & adj_p_val <= 0.05 ~

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R tips：使用ggplot2绘制空间坐标图

空间数据提供的位置信息一般分为两种：细胞的质心和细胞的边界，以Xenium数据为例，这两种细胞坐标信息它都有包含。...theme(panel.background = element_rect(fill = "black")) p_xenium_boundary | p_xenium_boundary2 使用...另一个选择是使用geom_tile图层，它可以指定点的height和width，height和width的大小和使用的数据有关系，在调试出图时只需要指定好了它们的值，则点的遮挡关系就不会因为导出图片的大小而出现改变...如下图所示，两个图层的点大小尚未出现难以接受的遮挡或疏远。但是只要调小一下导出图形的大小，geom_point的点遮挡就非常严重了，而geom_tile依然可以保持不遮挡不疏离的状态。...同样的，将上述图形放大后效果查看绘图细节如下：本文仅作一种概览的绘图演示，具体的空间图绘制可以基于上述思路进行各种个性化的绘图调整。

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「R」使用 ggplot2 进行曲线拟合

有读者询问如何对散点图拟合非线性的曲线。实际上我们通常看到的无论是直线拟合还是各种曲线拟合都属于广义线性模型。这里我们构造一组数据来看看如何使用 ggplot2 来拟合数据。...<- data.frame( x = x, y = y ) 使用 ggplot2 绘制散点图： library(ggplot2) p <- ggplot(df, aes(x, y)) +...geom_point() p 我们先直接利用 geom_smooth() 对散点进行平滑拟合，默认使用的是 loess 方法。...p + geom_smooth(method = "lm", formula = y ~ I(x^3)) 除了直接 geom_smooth() 进行拟合，还可以先使用 lm() 建立模型，生成对应的值...，然后使用线条添加在图上也是可以的。

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「R」ggplot2拼图包patchwork推荐与使用

patchwork是基于ggplot2的拼图包，因为ggplot2本身没有强大的拼图语法，而一般使用的gridExtra与cowplot的拼ggplot2图形都存在不少问题。...下面进入正题，掌握好ggplot2与patchwork的基本用法，一般的图形都可以搞定了，并必要搞的很复杂。解决问题是关键，认真工作也是关键，画图看起来是，其实不是。.../patchwork") 导入： p_load(patchwork) # 或 # library(patchwork) 例子 patchwork的使用灰常简单，使用+把要拼的图加在一起就可以了。...我们不用创建对象，也可以像ggplot2本身使用一样相加。...另外，可以使用布局函数plot_layout对拼接细节进行更细致地指定，像每个图的范围，图形的排列。

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如何使用 ggplot2 绘制双轴分离图？

在此之前，创建一个新的数据框，根据你的 x 值，手动划分 x 轴尺度范围。...这里的细节调整包括：使用 ggthemes 包中的 theme_tufte() 主题，viridis 包的 scale_fill_viridis() 离散配色。...填充的 legend 没有实际含义，所以将图例去除（legend.position = 'none'）。注意：这里将柱子按照类别进行填充，当然你也可以使用另一个变量进行填充（下面会给例子）。...主要细节调整：geom_col() 中的 aes(fill = score)，连续性变量填充使用 scale_fill_gradient2() 以及加上了图例。...当然这种技巧也可以使用其他图形中。读者如有需求，可以自行探索。

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ggplot2 案例：使用 ggplot2 绘制绘制一幅气泡地图展示各国疫情状况

约翰·霍普金斯大学提供了一份数据集，使用这份数据集我们可以绘制一幅气泡地图展示这些确诊患者的分布，代码比较简单：首先导入我们需要的几个 R 包： library(ggplot2) library(sf...) library(readr) library(dplyr) 导入世界地图并把 crs 转换成 4326（其实这份数据的 crs 就是 4326）： worldmap % st_transform(crs = 4326) 把疫情数据读取进来并根据经纬度坐标把这个数据框转换成 sf 对象，同样使用 4326 投影坐标系，这样地图和数据才不会分家： read_csv...99", "100-999", "1,000-49,999", "50,000+")) + guides(color = guide_legend()) + labs(title = "新冠肺炎的全球分布...❝本文的附件和代码可以从知识星球下载：https://t.zsxq.com/iEYVjqr ❞

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如何通过Google来使用ggplot2可视化

第二部分谈到画图，R语言里面有一个极其强大的工具，它是我们今天要谈论的主角：ggplot2 ggplot2 绘图作为R语言可视化阵营扛把子的地位是毋庸置疑的，我能与它结缘主要是因为自己本来没有正经地学过...我就明白我已经学会ggplot2的可视化了，虽然那时候的我画一个完整完美的图仍旧是各种磕磕碰碰，但并不影响我已经掌握了它的精髓。...大家由最近的直播我的基因组45—55讲应该可以看得出来，可视化方面我的确很弱，但我还是想分享一下自己是如何通过google来使用ggplot做可视化的！...而Lattice绘图系统相对高级一些，它会调用lattice包，其中包括 xyplot/histogram/stripplot/dotplot等命令，如果你使用 panel函数，还可以控制每个面板内的绘图...如果ggplot2只是有这39个内置图形函数那就太没意思了，每个映射都是可以细化调整的，包括X,Y轴，颜色，大小等具体的熟悉，只是需要时间来熟练使用！

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ggplot2的主题设置

ggplot2画图的时候有几个默认主题，画图的时候我们可以自己挑选一个喜欢的内置主题，也可以自己设置。...image 如果要全局设置某一种主题的话，那么在开头写上theme_set()即可： # 比如设置theme_bw theme_set(theme_bw()) 如果不用内置的主题设置，或者我们想自己进行一些微调也是可以的

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ggplot2中ylim的坑

在ggplot2中很容易出现一个修改坐标轴范围的问题，喜欢用ggplot2画图的需要注意一下。...ylim和coord_cartesian都是调整坐标轴范围，但是它们的结果是有可能不一样的，看下面的一个例子： data(diamonds) p <- ggplot(data = diamonds, aes...image 截取0到60的部分： ? image 可以看到第二张图跟原图是不一样的，比如Fair的第一个box原数据最高是超过60的，但是截取之后不到60了。这是一个不太容易注意到的坑。...这里是因为ylim是直接处理的数据导致的，比如例子中不在范围的数据就直接被移除。同等操作应该用coord_cartesian来实现。...coord_cartesian指定参数控制图形特定区域放大显示，只影响图形展示，不影响内部数据的值。即使用原数据作图，再对图形进行变动。

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R语言ggplot2作图好玩的配色：使用NBA各球队logo的配色

最近在学习R语言包的开发流程，看了之前分享过的关于吉普力工作室电影的配色包的代码，觉得里面的代码并不复杂，没准我也可以搞一个。...模仿这个包的代码，我尝试把NBA各个球队logo配色整理成了R语言ggplot2包作图的时候可以使用的配色函数。...颜色来源于链接 https://usteamcolors.com/nba-colors/ 首先将颜色整理成为一个yml格式的文件，基本文件格式如下 image.png 这里颜色最多的是太阳队，有7个可选...(name = name,direction = direction),...) } scale_color_nbalogo_d<-scale_colour_nbalogo_d 使用这些颜色首先是读取颜色.../Rpackagedev/ggNBAlogo/",pattern = "*.R",full.names = T) lapply(x,source) 接下来使用太阳队和雷霆队的配色来举个例子 library

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使用 ggplot2 绘制比较各省份及其区县的详细数据

简介赵小编之前介绍过完整中国，及区域地图的画法。...如：使用 ggplot2 绘制单个和多个省份地图；R 语言绘制十段线地图，给特定省份填色；今天小编将介绍如何比较各个省份及其区县的详细数据，本文参考《R 语言数据可视化之美》[1]。...导入 R 包安装并加载所需的 R 包： library(rgdal) library(ggplot2) library(dplyr) library(grid) library(RColorBrewer...BOUNT_poly.shp") dataProjected@data$id <- rownames(dataProjected@data) 利用fortify()函数将对象转化为数据框形式，以便后续使用...读者可以使用自己的数据进行替换。数据形式如下： ##字段 NAME99 是各个县的中文名。

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ggplot2都有哪些使用不多但是却异常强大的图层函数

要说ggplot2中那些使用不多但是却功能强大的图层函数，我首先想到的就是geom_rect、geom_linerange、geom_segment、geom_ploygon。...这四个函数分别定义了ggplot2中的矩形图、垂直线图（线范围图）、线段图、几何多边形图。...这四种图表类型独立使用的机会很少，一般都是作为图表的辅助信息，但是如果能恰到好处的使用，你会挖掘出很多新意。...geom_polygon() 最后一个可以说是很厉害了，几乎是ggplot2里面最为复杂、强大、适应性广的图层函数了，因为它使用极限思维，什么东西都是用尽可能多的点来拟合。...这个几个图形应该算是平时使用几率不会很高的图形了，但是用的恰到好处的话，能够做出非常惊艳的效果，赶快试一试吧~ 《R语言商务图表与数据可视化》的课程已经更新到空间地理信息数据可视化的章节了，感兴趣的童鞋

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在 R 中使用 sf 和 ggplot2 绘制河流地图

因此，我们只需要根据这些类分配不同的宽度。我们在下面使用 mutate 来创建宽度，并使用case_when来分配宽度。后者在SQL用户中是众所周知的。...边界框在我们用ggplot2做魔术之前再走几步。我们的目标包括欧洲和中东，因此我们希望确保我们主要占领欧洲。我们通过制作一个边界框来做到这一点。让我们使用 WGS84 坐标定义边界框的参数。...我们首先绘制河流线，并根据定义的宽度根据类和宽度分配特定颜色。由于我们的目标是将视野缩小到欧洲，因此我们使用coord_sf根据预定义的边界框设置纬度和经度限制。...我们将使用蓝色阴影来绘制我们的河流类。此外，我们将大小限制定义为从 0 到 0.3 的数值范围。我鼓励你玩这个范围，看看你会得到什么。...最后，我们使用一系列 alpha 值来使较大的河流在地图上突出显示。 # 4.

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ggplot2优雅的绘制轨道图

❝本节来绘制一个简单的绘图案例；暂且称之为轨道图；下面小编就通过一个详细的案例介绍如何绘制此图；关于此图的实践应用以后在做介绍加载R包 library(tidyverse) library(systemfonts

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ggplot2中的position参数解析

但它们之间有一些细微的差别： ❞ 1. position = "dodge" 这是position_dodge()的简写形式，它会自动计算需要的dodge宽度。不能设置preserve参数。...3. position_dodge2() 这是position_dodge()的一个扩展，提供了更多的控制，preserve= "single"：保持每个单独的柱子的宽度不变，而不是整个组。...使用position="dodge"或position_dodge()，你会得到四个等宽的柱子（两个A=1和两个A=2），它们按B的水平分开。...使用position_dodge2(preserve="single")，如果A=1和A=2的柱子高度不同，那么A=1的两个柱子会比A=2的两个柱子更接近，因为它们的宽度被保留了。...vjust = 1.5, aes(label = paste("Mean", round(..y.., digits = 1))))+ theme_bw() # 使用黑白主题

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ggplot2 中 scale 的使用

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